Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AMH3

Protein Details
Accession D4AMH3    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAKRRVKKRTHVPPGKAGASBasic
368-406LDASWEKKRKEKELRRKIQKENVEKKKALKTKTPREGKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-17KRRVKKRTHVPPGKA
232-247KRIRRLNPKEFRGKEK
374-402KKRKEKELRRKIQKENVEKKKALKTKTPR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG abe:ARB_05426  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKRRVKKRTHVPPGKAGASGTKNGAASMNKSPKSMVIRIGAGQVGSSMSQLAKDVRSMMEPDTASRLKERTKNRLKDYTVMTGPLGVTHLLLFSKSSNGNSNLRIALTPRGPTLNFRIENYSLCKDVIKALKRPRGLGKSHTTPPLLVMNNFMSSKEGEASEKIPKHLESLVTTVFQSLFPPISPQTTPLASIRRIMLLDRDRSSKKGRDESFTVNLRHYAITTKRIDLSKRIRRLNPKEFRGKEKDKAVPNLGKLNDVADYLLGGGGGDAGFTSASETEIETDAEVEVLESTTRKVLNKKELQRAKEAGSKSARSSGSNVEKRAVKLVELGPRMKLKLMKVEEGLCGGRVMWHDYVTKTKEEAQSLDASWEKKRKEKELRRKIQKENVEKKKALKTKTPREGKDDEEDSDEVDDDDDWDSDDFIHGEEDEDEEMGEAEEGEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.76
3 0.66
4 0.56
5 0.53
6 0.47
7 0.42
8 0.35
9 0.31
10 0.29
11 0.28
12 0.31
13 0.25
14 0.25
15 0.33
16 0.4
17 0.38
18 0.38
19 0.39
20 0.41
21 0.45
22 0.45
23 0.4
24 0.35
25 0.36
26 0.36
27 0.38
28 0.33
29 0.25
30 0.21
31 0.16
32 0.12
33 0.1
34 0.09
35 0.08
36 0.07
37 0.08
38 0.1
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.19
46 0.19
47 0.22
48 0.21
49 0.21
50 0.27
51 0.27
52 0.26
53 0.27
54 0.3
55 0.31
56 0.39
57 0.46
58 0.5
59 0.6
60 0.68
61 0.73
62 0.78
63 0.75
64 0.74
65 0.7
66 0.67
67 0.58
68 0.5
69 0.41
70 0.33
71 0.29
72 0.23
73 0.18
74 0.1
75 0.09
76 0.07
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.11
83 0.13
84 0.15
85 0.19
86 0.24
87 0.27
88 0.28
89 0.3
90 0.27
91 0.26
92 0.25
93 0.21
94 0.23
95 0.22
96 0.22
97 0.2
98 0.22
99 0.22
100 0.24
101 0.29
102 0.32
103 0.31
104 0.31
105 0.35
106 0.33
107 0.36
108 0.38
109 0.34
110 0.26
111 0.25
112 0.24
113 0.19
114 0.24
115 0.29
116 0.29
117 0.34
118 0.42
119 0.49
120 0.5
121 0.54
122 0.56
123 0.55
124 0.54
125 0.53
126 0.52
127 0.51
128 0.54
129 0.54
130 0.46
131 0.39
132 0.38
133 0.37
134 0.3
135 0.24
136 0.23
137 0.2
138 0.21
139 0.21
140 0.19
141 0.14
142 0.13
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.19
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.21
154 0.22
155 0.22
156 0.22
157 0.16
158 0.18
159 0.18
160 0.16
161 0.16
162 0.14
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.09
170 0.09
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.16
178 0.2
179 0.18
180 0.19
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.15
185 0.19
186 0.2
187 0.24
188 0.24
189 0.28
190 0.28
191 0.32
192 0.37
193 0.36
194 0.37
195 0.41
196 0.42
197 0.42
198 0.45
199 0.46
200 0.47
201 0.46
202 0.42
203 0.33
204 0.32
205 0.28
206 0.24
207 0.19
208 0.17
209 0.14
210 0.2
211 0.21
212 0.21
213 0.24
214 0.26
215 0.27
216 0.31
217 0.39
218 0.41
219 0.47
220 0.52
221 0.55
222 0.63
223 0.71
224 0.74
225 0.72
226 0.7
227 0.73
228 0.7
229 0.71
230 0.7
231 0.67
232 0.62
233 0.6
234 0.6
235 0.55
236 0.56
237 0.55
238 0.49
239 0.46
240 0.46
241 0.39
242 0.33
243 0.28
244 0.24
245 0.18
246 0.15
247 0.13
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.07
282 0.09
283 0.11
284 0.17
285 0.24
286 0.34
287 0.43
288 0.51
289 0.59
290 0.65
291 0.65
292 0.67
293 0.63
294 0.57
295 0.54
296 0.46
297 0.43
298 0.41
299 0.4
300 0.35
301 0.39
302 0.36
303 0.31
304 0.33
305 0.35
306 0.4
307 0.43
308 0.42
309 0.4
310 0.42
311 0.42
312 0.45
313 0.37
314 0.26
315 0.26
316 0.3
317 0.33
318 0.33
319 0.33
320 0.31
321 0.33
322 0.33
323 0.32
324 0.31
325 0.26
326 0.31
327 0.34
328 0.34
329 0.34
330 0.35
331 0.33
332 0.32
333 0.3
334 0.21
335 0.17
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.16
340 0.14
341 0.16
342 0.18
343 0.19
344 0.27
345 0.27
346 0.28
347 0.25
348 0.31
349 0.34
350 0.35
351 0.35
352 0.31
353 0.31
354 0.3
355 0.32
356 0.28
357 0.25
358 0.29
359 0.34
360 0.34
361 0.38
362 0.45
363 0.52
364 0.6
365 0.7
366 0.75
367 0.79
368 0.87
369 0.91
370 0.93
371 0.92
372 0.9
373 0.89
374 0.89
375 0.88
376 0.88
377 0.86
378 0.8
379 0.78
380 0.78
381 0.76
382 0.71
383 0.7
384 0.7
385 0.72
386 0.79
387 0.82
388 0.76
389 0.77
390 0.75
391 0.7
392 0.68
393 0.61
394 0.52
395 0.47
396 0.42
397 0.36
398 0.32
399 0.27
400 0.18
401 0.15
402 0.12
403 0.09
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.1
414 0.08
415 0.1
416 0.1
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.08