Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AXE1

Protein Details
Accession D4AXE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-47MGKNRKPAVKQSNKKMKSFTKLSTSTKKTQNVKQQQQKQNQPQIPFRHydrophilic
374-395ESQGTSSGKFKRKRKGSGSESDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
382-389KFKRKRKG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019446  BMT5-like  
Gene Ontology GO:0070042  F:rRNA (uridine-N3-)-methyltransferase activity  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
KEGG abe:ARB_00869  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10354  BMT5-like  
Amino Acid Sequences MGKNRKPAVKQSNKKMKSFTKLSTSTKKTQNVKQQQQKQNQPQIPFRPSDRVLLIGEGDFSFALSLATHHKCRKRLMATCYDSEAKLIEKYPDAKRHIEQLEAFSSYSQESRAGVKRKRDEGVGSDQSDEEADQKPQDRVKVAPVESNSPKAPKASVPSPKVVFSIDARKLGTTGGGGKLIRSGFPAPSPKIHYSNWSKKGGNDLTGESGGPWDIICFNFPHVGGLSTDVNRQVRSNQELLVGFFKACVPLLSVPNPTDDWSDFEDEDEYTDEEENGDSLSGASEVRCKPRKEPGHIIVTLFEGEPYTLWNIRDLARHAGLRVVTSFKFPWASYPGYSHARTIGAIEGKDGGRGGWKGEERGARSYVFERKGFESQGTSSGKFKRKRKGSGSESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.81
3 0.78
4 0.77
5 0.74
6 0.69
7 0.68
8 0.69
9 0.73
10 0.74
11 0.73
12 0.72
13 0.73
14 0.76
15 0.74
16 0.75
17 0.78
18 0.78
19 0.82
20 0.84
21 0.86
22 0.87
23 0.89
24 0.91
25 0.91
26 0.9
27 0.85
28 0.81
29 0.8
30 0.78
31 0.74
32 0.67
33 0.6
34 0.58
35 0.53
36 0.52
37 0.44
38 0.38
39 0.34
40 0.31
41 0.28
42 0.2
43 0.19
44 0.14
45 0.13
46 0.1
47 0.09
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.06
53 0.13
54 0.18
55 0.24
56 0.32
57 0.38
58 0.44
59 0.5
60 0.58
61 0.6
62 0.64
63 0.66
64 0.69
65 0.67
66 0.64
67 0.63
68 0.55
69 0.46
70 0.38
71 0.31
72 0.22
73 0.19
74 0.18
75 0.15
76 0.17
77 0.23
78 0.3
79 0.37
80 0.4
81 0.43
82 0.42
83 0.49
84 0.47
85 0.45
86 0.39
87 0.35
88 0.33
89 0.3
90 0.29
91 0.2
92 0.19
93 0.16
94 0.15
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.15
99 0.23
100 0.31
101 0.35
102 0.44
103 0.5
104 0.55
105 0.55
106 0.52
107 0.48
108 0.44
109 0.48
110 0.44
111 0.38
112 0.34
113 0.32
114 0.29
115 0.26
116 0.21
117 0.14
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.14
122 0.17
123 0.19
124 0.21
125 0.21
126 0.2
127 0.26
128 0.3
129 0.29
130 0.3
131 0.29
132 0.33
133 0.33
134 0.35
135 0.3
136 0.26
137 0.25
138 0.22
139 0.22
140 0.18
141 0.22
142 0.26
143 0.34
144 0.35
145 0.39
146 0.4
147 0.39
148 0.37
149 0.32
150 0.26
151 0.2
152 0.25
153 0.23
154 0.23
155 0.23
156 0.22
157 0.22
158 0.2
159 0.18
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.14
173 0.19
174 0.18
175 0.21
176 0.26
177 0.27
178 0.29
179 0.29
180 0.33
181 0.38
182 0.46
183 0.49
184 0.49
185 0.47
186 0.44
187 0.52
188 0.46
189 0.39
190 0.31
191 0.26
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.13
196 0.11
197 0.08
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.14
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.18
222 0.22
223 0.22
224 0.19
225 0.21
226 0.21
227 0.22
228 0.21
229 0.17
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.1
238 0.13
239 0.15
240 0.17
241 0.17
242 0.19
243 0.19
244 0.18
245 0.18
246 0.15
247 0.16
248 0.17
249 0.19
250 0.17
251 0.17
252 0.17
253 0.14
254 0.15
255 0.13
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.11
272 0.14
273 0.23
274 0.3
275 0.32
276 0.36
277 0.46
278 0.55
279 0.57
280 0.65
281 0.62
282 0.64
283 0.63
284 0.59
285 0.5
286 0.42
287 0.34
288 0.24
289 0.17
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.1
295 0.12
296 0.12
297 0.14
298 0.16
299 0.18
300 0.22
301 0.23
302 0.26
303 0.27
304 0.28
305 0.26
306 0.28
307 0.26
308 0.23
309 0.22
310 0.2
311 0.17
312 0.2
313 0.2
314 0.2
315 0.22
316 0.2
317 0.23
318 0.24
319 0.27
320 0.25
321 0.28
322 0.31
323 0.34
324 0.35
325 0.32
326 0.29
327 0.27
328 0.25
329 0.23
330 0.23
331 0.21
332 0.2
333 0.19
334 0.21
335 0.2
336 0.2
337 0.19
338 0.14
339 0.15
340 0.16
341 0.17
342 0.21
343 0.23
344 0.25
345 0.31
346 0.37
347 0.35
348 0.39
349 0.4
350 0.33
351 0.34
352 0.37
353 0.4
354 0.4
355 0.38
356 0.38
357 0.4
358 0.45
359 0.43
360 0.4
361 0.35
362 0.32
363 0.38
364 0.38
365 0.35
366 0.36
367 0.43
368 0.5
369 0.55
370 0.61
371 0.64
372 0.69
373 0.78
374 0.82
375 0.83