Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B1E0

Protein Details
Accession D4B1E0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-49NKPGVAGRKKSERKKLEAAKIKKKKKKNRATLHGWTDEBasic
129-150SKGRNKGKTRRIWKPNVRKEKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-45KPGVAGRKKSERKKLEAAKIKKKKKKNRATLHG
50-54ARRRR
128-149ISKGRNKGKTRRIWKPNVRKEK
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 10, nucl 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034704  L28p-like  
IPR026569  Ribo_L28/L24  
IPR037147  Ribo_L28/L24_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
KEGG abe:ARB_02269  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00830  Ribosomal_L28  
Amino Acid Sequences MRLALALSLKENKPGVAGRKKSERKKLEAAKIKKKKKKNRATLHGWTDEARRRRRLLELGLPRVSLLTASFSNLSLQATRSFSTTLPTQRAATLPAEIPPYPYGPRRTFKQADSGLYGGATIIFGNKISKGRNKGKTRRIWKPNVRKEKIYSKALDEEIELKVTHGVLRTINKVGGLDEYLLGDKPARIKELGMFGWKLRWRVMTSLAMKEKFALERQQLGLQEPETFEQFLARHSESEKIEAATEHDLRRQQEAHEAATPLTAASMGEMNAPELRTNPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.37
3 0.41
4 0.46
5 0.49
6 0.59
7 0.69
8 0.75
9 0.8
10 0.78
11 0.76
12 0.81
13 0.83
14 0.83
15 0.84
16 0.84
17 0.85
18 0.87
19 0.9
20 0.89
21 0.9
22 0.9
23 0.91
24 0.92
25 0.92
26 0.92
27 0.91
28 0.92
29 0.91
30 0.87
31 0.8
32 0.7
33 0.61
34 0.57
35 0.55
36 0.54
37 0.52
38 0.5
39 0.5
40 0.52
41 0.56
42 0.55
43 0.54
44 0.55
45 0.57
46 0.58
47 0.56
48 0.52
49 0.46
50 0.39
51 0.32
52 0.22
53 0.13
54 0.1
55 0.08
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.1
63 0.11
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.15
70 0.17
71 0.2
72 0.22
73 0.23
74 0.24
75 0.24
76 0.24
77 0.24
78 0.24
79 0.2
80 0.17
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.15
85 0.16
86 0.15
87 0.16
88 0.17
89 0.21
90 0.26
91 0.29
92 0.33
93 0.35
94 0.42
95 0.44
96 0.43
97 0.47
98 0.43
99 0.4
100 0.39
101 0.35
102 0.26
103 0.23
104 0.21
105 0.12
106 0.08
107 0.06
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.04
113 0.06
114 0.08
115 0.11
116 0.17
117 0.25
118 0.34
119 0.43
120 0.53
121 0.6
122 0.68
123 0.74
124 0.77
125 0.79
126 0.79
127 0.79
128 0.8
129 0.82
130 0.83
131 0.85
132 0.8
133 0.73
134 0.7
135 0.69
136 0.65
137 0.59
138 0.5
139 0.42
140 0.42
141 0.39
142 0.34
143 0.25
144 0.21
145 0.16
146 0.16
147 0.13
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.07
153 0.08
154 0.1
155 0.12
156 0.14
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.16
178 0.21
179 0.21
180 0.2
181 0.2
182 0.18
183 0.24
184 0.26
185 0.25
186 0.22
187 0.25
188 0.24
189 0.25
190 0.3
191 0.31
192 0.32
193 0.38
194 0.42
195 0.39
196 0.37
197 0.36
198 0.33
199 0.28
200 0.27
201 0.26
202 0.23
203 0.27
204 0.29
205 0.32
206 0.3
207 0.3
208 0.29
209 0.24
210 0.22
211 0.19
212 0.18
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.19
223 0.25
224 0.24
225 0.27
226 0.26
227 0.21
228 0.21
229 0.2
230 0.22
231 0.22
232 0.25
233 0.23
234 0.26
235 0.3
236 0.31
237 0.35
238 0.34
239 0.3
240 0.34
241 0.36
242 0.34
243 0.34
244 0.33
245 0.28
246 0.27
247 0.26
248 0.16
249 0.14
250 0.1
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.11
258 0.13
259 0.14
260 0.14