Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4ALN0

Protein Details
Accession D4ALN0    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-123DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
130-155EKKVEFAKLLKKQKRGKKDVTITEEVHydrophilic
421-440ANAKRRQEEDRQRRNNNNDHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-147KKVEFAKLLKKQKRGKK
410-450RRRRQTEERRNANAKRRQEEDRQRRNNNNDHARKKRRGSRG
876-882RGGRGRG
Subcellular Location(s) cyto 11.5cyto_mito 11.5, mito 10.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG abe:ARB_05228  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSSKYPKIVSAVVEEQPQEIDGQEIPVDITKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPANEGEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQDAKAEDEKKVEFAKLLKKQKRGKKDVTITEEVITKTWDTNVITPGTPFMDILALALRYWVAYKLSTDPGWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMEFIRSQRACPEYDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPHFRVLREDVFFQESKARTCKLCGQAGHVEEACTGKAKEKRGEFDEKQKGNPLKPFIWLHVSVLREYLAVEMQVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRENGIDTLIAIWRDNIPQMGGYLTKDGRVDLAKAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQTEERRNANAKRRQEEDRQRRNNNNDHARKKRRGSRGAEPVPDIPPLVVPGKGELSRAERELTHAMVVNRGAVYKANMANKSAAAALKAQLLSGGTAEDGVDTTNAQDSAPSGIPGSKLGKRKSDVFENSNTEAEAEEEDEEEEDTVEVPAKPKEDEMPPDTVRLWEDGYADRYYEQKFGVSPKDIAFRHKVARAYVEGLSWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGEMDVQFTKGTPFKPFEQLMGVLPAASNHAIPEVFRDLMSDENSEIIDFYPEDFPVDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKRLLAAMGKRYHLLSEEEQARNAMGKDVLLLSEKHPLYESLTANFYSKKQVSSKLKLNMRISEGLGGKVEKNESYLPHSSLSLEVDGADIPALDEDRSISVYYEMPRSMHTHKSMLLRGVKFKEPALDKADLEITRNKARHSGRSFGGAPLHSSRGGRGRGGGRGGGQISYASNDRPNPFAAHVAPGYIPPPHMGGGPPGYNPAPPNMYNGPDRYRSQGGYPRGGGGGGGGGYGGGYGGHYQQPPPHSWAQHDGPAYNHPPRNAYQDRAHYQRGGSSGYGRGGGGGGGSYDGRGGGGYYGSRGSGRGRGRGDGYGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.46
4 0.46
5 0.41
6 0.4
7 0.38
8 0.35
9 0.34
10 0.33
11 0.29
12 0.27
13 0.24
14 0.18
15 0.13
16 0.13
17 0.1
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.12
23 0.13
24 0.11
25 0.16
26 0.21
27 0.24
28 0.27
29 0.28
30 0.28
31 0.31
32 0.32
33 0.34
34 0.3
35 0.3
36 0.27
37 0.26
38 0.24
39 0.2
40 0.18
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.44
55 0.5
56 0.49
57 0.51
58 0.51
59 0.52
60 0.44
61 0.38
62 0.31
63 0.25
64 0.24
65 0.17
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.13
73 0.13
74 0.17
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.46
80 0.45
81 0.46
82 0.45
83 0.44
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.37
99 0.45
100 0.55
101 0.66
102 0.74
103 0.8
104 0.82
105 0.79
106 0.76
107 0.77
108 0.76
109 0.73
110 0.73
111 0.66
112 0.61
113 0.65
114 0.59
115 0.49
116 0.43
117 0.37
118 0.31
119 0.31
120 0.28
121 0.22
122 0.26
123 0.35
124 0.41
125 0.51
126 0.55
127 0.62
128 0.71
129 0.78
130 0.83
131 0.83
132 0.83
133 0.82
134 0.85
135 0.85
136 0.83
137 0.79
138 0.69
139 0.62
140 0.56
141 0.46
142 0.36
143 0.28
144 0.21
145 0.16
146 0.15
147 0.17
148 0.16
149 0.18
150 0.21
151 0.22
152 0.21
153 0.21
154 0.21
155 0.19
156 0.17
157 0.14
158 0.11
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.11
173 0.15
174 0.19
175 0.19
176 0.22
177 0.23
178 0.28
179 0.32
180 0.3
181 0.27
182 0.27
183 0.32
184 0.29
185 0.29
186 0.24
187 0.21
188 0.24
189 0.24
190 0.21
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.16
204 0.25
205 0.26
206 0.26
207 0.31
208 0.33
209 0.33
210 0.32
211 0.38
212 0.35
213 0.43
214 0.45
215 0.43
216 0.46
217 0.45
218 0.42
219 0.34
220 0.28
221 0.2
222 0.2
223 0.17
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.06
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.18
242 0.2
243 0.24
244 0.25
245 0.26
246 0.25
247 0.28
248 0.27
249 0.24
250 0.28
251 0.24
252 0.26
253 0.28
254 0.28
255 0.25
256 0.28
257 0.36
258 0.35
259 0.4
260 0.37
261 0.39
262 0.43
263 0.43
264 0.43
265 0.35
266 0.28
267 0.23
268 0.23
269 0.18
270 0.14
271 0.13
272 0.16
273 0.2
274 0.26
275 0.32
276 0.35
277 0.41
278 0.44
279 0.54
280 0.51
281 0.57
282 0.61
283 0.57
284 0.54
285 0.57
286 0.56
287 0.51
288 0.53
289 0.47
290 0.39
291 0.42
292 0.42
293 0.36
294 0.37
295 0.33
296 0.29
297 0.28
298 0.28
299 0.22
300 0.21
301 0.19
302 0.13
303 0.13
304 0.11
305 0.08
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.13
311 0.14
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.15
316 0.17
317 0.17
318 0.14
319 0.15
320 0.17
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.12
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.15
352 0.1
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.12
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.15
382 0.15
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.13
393 0.14
394 0.2
395 0.26
396 0.29
397 0.37
398 0.4
399 0.44
400 0.5
401 0.59
402 0.62
403 0.67
404 0.72
405 0.71
406 0.76
407 0.78
408 0.78
409 0.74
410 0.7
411 0.64
412 0.59
413 0.58
414 0.6
415 0.65
416 0.66
417 0.7
418 0.72
419 0.75
420 0.79
421 0.8
422 0.78
423 0.76
424 0.76
425 0.74
426 0.74
427 0.77
428 0.78
429 0.79
430 0.79
431 0.78
432 0.77
433 0.77
434 0.74
435 0.73
436 0.75
437 0.72
438 0.66
439 0.59
440 0.51
441 0.44
442 0.37
443 0.28
444 0.17
445 0.11
446 0.11
447 0.1
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.14
456 0.15
457 0.16
458 0.16
459 0.14
460 0.16
461 0.17
462 0.16
463 0.13
464 0.14
465 0.13
466 0.13
467 0.13
468 0.11
469 0.1
470 0.09
471 0.09
472 0.06
473 0.08
474 0.1
475 0.13
476 0.17
477 0.17
478 0.18
479 0.19
480 0.18
481 0.18
482 0.15
483 0.12
484 0.08
485 0.09
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.03
496 0.04
497 0.04
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.05
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.08
515 0.1
516 0.13
517 0.15
518 0.22
519 0.24
520 0.29
521 0.3
522 0.36
523 0.37
524 0.42
525 0.42
526 0.39
527 0.41
528 0.41
529 0.4
530 0.35
531 0.31
532 0.23
533 0.18
534 0.15
535 0.11
536 0.07
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.07
550 0.08
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.12
555 0.14
556 0.18
557 0.2
558 0.24
559 0.24
560 0.25
561 0.24
562 0.22
563 0.2
564 0.16
565 0.14
566 0.09
567 0.1
568 0.11
569 0.13
570 0.13
571 0.12
572 0.12
573 0.14
574 0.14
575 0.14
576 0.13
577 0.11
578 0.12
579 0.15
580 0.18
581 0.17
582 0.18
583 0.18
584 0.25
585 0.24
586 0.27
587 0.28
588 0.28
589 0.3
590 0.32
591 0.32
592 0.27
593 0.29
594 0.26
595 0.25
596 0.22
597 0.18
598 0.15
599 0.13
600 0.12
601 0.09
602 0.07
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.09
612 0.13
613 0.17
614 0.15
615 0.19
616 0.2
617 0.25
618 0.28
619 0.3
620 0.27
621 0.24
622 0.24
623 0.2
624 0.2
625 0.15
626 0.12
627 0.09
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.06
637 0.06
638 0.05
639 0.05
640 0.07
641 0.09
642 0.11
643 0.14
644 0.17
645 0.2
646 0.26
647 0.26
648 0.25
649 0.25
650 0.25
651 0.22
652 0.2
653 0.17
654 0.11
655 0.1
656 0.09
657 0.09
658 0.08
659 0.07
660 0.05
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.09
665 0.11
666 0.11
667 0.11
668 0.11
669 0.11
670 0.13
671 0.15
672 0.13
673 0.1
674 0.1
675 0.1
676 0.1
677 0.09
678 0.07
679 0.07
680 0.06
681 0.07
682 0.08
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.08
687 0.1
688 0.13
689 0.13
690 0.13
691 0.16
692 0.15
693 0.17
694 0.18
695 0.16
696 0.15
697 0.14
698 0.14
699 0.15
700 0.17
701 0.15
702 0.14
703 0.13
704 0.12
705 0.12
706 0.12
707 0.08
708 0.07
709 0.09
710 0.09
711 0.09
712 0.11
713 0.15
714 0.21
715 0.25
716 0.25
717 0.25
718 0.25
719 0.25
720 0.24
721 0.24
722 0.18
723 0.22
724 0.29
725 0.28
726 0.28
727 0.28
728 0.26
729 0.24
730 0.22
731 0.16
732 0.09
733 0.08
734 0.09
735 0.09
736 0.1
737 0.09
738 0.1
739 0.1
740 0.18
741 0.18
742 0.17
743 0.18
744 0.18
745 0.2
746 0.25
747 0.25
748 0.19
749 0.21
750 0.21
751 0.22
752 0.23
753 0.2
754 0.22
755 0.22
756 0.25
757 0.26
758 0.35
759 0.43
760 0.49
761 0.57
762 0.58
763 0.62
764 0.66
765 0.66
766 0.61
767 0.56
768 0.51
769 0.43
770 0.4
771 0.35
772 0.28
773 0.25
774 0.22
775 0.18
776 0.18
777 0.19
778 0.13
779 0.15
780 0.17
781 0.17
782 0.22
783 0.24
784 0.24
785 0.24
786 0.24
787 0.22
788 0.21
789 0.21
790 0.15
791 0.12
792 0.1
793 0.09
794 0.09
795 0.08
796 0.07
797 0.05
798 0.04
799 0.05
800 0.05
801 0.05
802 0.05
803 0.06
804 0.07
805 0.08
806 0.08
807 0.08
808 0.09
809 0.12
810 0.14
811 0.17
812 0.17
813 0.16
814 0.18
815 0.22
816 0.25
817 0.29
818 0.3
819 0.3
820 0.34
821 0.39
822 0.41
823 0.43
824 0.46
825 0.42
826 0.46
827 0.48
828 0.47
829 0.43
830 0.4
831 0.41
832 0.37
833 0.39
834 0.37
835 0.35
836 0.31
837 0.32
838 0.36
839 0.29
840 0.29
841 0.3
842 0.29
843 0.34
844 0.36
845 0.34
846 0.37
847 0.42
848 0.49
849 0.49
850 0.5
851 0.44
852 0.49
853 0.49
854 0.44
855 0.44
856 0.34
857 0.32
858 0.3
859 0.31
860 0.26
861 0.25
862 0.26
863 0.28
864 0.3
865 0.27
866 0.3
867 0.31
868 0.33
869 0.35
870 0.33
871 0.27
872 0.29
873 0.29
874 0.23
875 0.2
876 0.16
877 0.14
878 0.15
879 0.15
880 0.13
881 0.16
882 0.21
883 0.23
884 0.24
885 0.26
886 0.26
887 0.26
888 0.29
889 0.26
890 0.25
891 0.23
892 0.23
893 0.21
894 0.19
895 0.19
896 0.16
897 0.15
898 0.11
899 0.13
900 0.12
901 0.13
902 0.13
903 0.16
904 0.19
905 0.2
906 0.2
907 0.22
908 0.22
909 0.23
910 0.23
911 0.23
912 0.24
913 0.23
914 0.29
915 0.28
916 0.31
917 0.34
918 0.37
919 0.38
920 0.39
921 0.4
922 0.4
923 0.41
924 0.39
925 0.42
926 0.46
927 0.46
928 0.47
929 0.47
930 0.42
931 0.38
932 0.36
933 0.29
934 0.2
935 0.16
936 0.09
937 0.08
938 0.06
939 0.05
940 0.05
941 0.05
942 0.04
943 0.03
944 0.03
945 0.05
946 0.07
947 0.12
948 0.13
949 0.15
950 0.2
951 0.24
952 0.28
953 0.33
954 0.38
955 0.36
956 0.4
957 0.46
958 0.45
959 0.47
960 0.46
961 0.41
962 0.36
963 0.41
964 0.43
965 0.44
966 0.43
967 0.39
968 0.41
969 0.43
970 0.5
971 0.48
972 0.49
973 0.48
974 0.54
975 0.6
976 0.62
977 0.64
978 0.57
979 0.52
980 0.5
981 0.44
982 0.37
983 0.32
984 0.29
985 0.28
986 0.27
987 0.27
988 0.22
989 0.2
990 0.17
991 0.15
992 0.12
993 0.08
994 0.07
995 0.07
996 0.07
997 0.07
998 0.07
999 0.07
1000 0.06
1001 0.06
1002 0.07
1003 0.06
1004 0.08
1005 0.09
1006 0.1
1007 0.11
1008 0.12
1009 0.12
1010 0.13
1011 0.16
1012 0.22
1013 0.27
1014 0.33
1015 0.35
1016 0.39
1017 0.42
1018 0.47