Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B2F7

Protein Details
Accession D4B2F7    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-179YYGGEKRQRGGRKKRKKNYESEVIIBasic
416-439VNPLQVKVQKQKKKPDSEGRGVAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
160-171KRQRGGRKKRKK
425-452KQKKKPDSEGRGVAPPGGPRGKIVGGGR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR040052  RBM17  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG abe:ARB_02685  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSSEKTTTPKPGMSLYANLLDTPEGASISRAPVVFKQATDAPQDDPAMKKQQISAGRAYTLSLQTVCTDMIGSLVSRKPSFASLRFQPTKRPQLPSQRLKAKSGISKPPVITSSASPATPDQGTTSGAVTAGRPTGKSTIADWTATADDDDVNGYYGGEKRQRGGRKKRKKNYESEVIIQNWDDIYDPTRPNSYEAYKHSDEKIREVREWKDRLYAHRLAQQYNSDEDSDEERSRPQMNRQFAPPSSFAPPPNLNAPPEESPEPQRTFSEAVPQPAVEIPDDSTGEEAYARRLRLSANINQPEPPPQPSQPSQLSQPSPTNEAPESTAPASHNYSAATISRPPVRYALPAAPGDLPATEAELEETLANEQEDANKEGDEDAPRSLRPGQKGFAERLLTKYGWTKGSGLGANESGIVNPLQVKVQKQKKKPDSEGRGVAPPGGPRGKIVGGGRKQEEQGKFGPMSDVVILHGMVDGLDLDAELESGELMQEIGDECGEKVWHPYIVLNLWLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.35
3 0.35
4 0.33
5 0.3
6 0.28
7 0.22
8 0.19
9 0.17
10 0.14
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.13
16 0.16
17 0.15
18 0.17
19 0.19
20 0.26
21 0.27
22 0.25
23 0.28
24 0.29
25 0.32
26 0.34
27 0.33
28 0.28
29 0.3
30 0.31
31 0.29
32 0.28
33 0.31
34 0.34
35 0.34
36 0.34
37 0.33
38 0.39
39 0.43
40 0.44
41 0.45
42 0.4
43 0.39
44 0.38
45 0.36
46 0.32
47 0.27
48 0.25
49 0.19
50 0.16
51 0.16
52 0.17
53 0.16
54 0.12
55 0.1
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.11
61 0.14
62 0.18
63 0.17
64 0.18
65 0.19
66 0.25
67 0.31
68 0.3
69 0.34
70 0.38
71 0.48
72 0.55
73 0.54
74 0.58
75 0.62
76 0.69
77 0.68
78 0.68
79 0.66
80 0.7
81 0.8
82 0.79
83 0.79
84 0.78
85 0.75
86 0.71
87 0.68
88 0.64
89 0.62
90 0.6
91 0.6
92 0.55
93 0.57
94 0.54
95 0.53
96 0.47
97 0.41
98 0.35
99 0.27
100 0.29
101 0.25
102 0.24
103 0.21
104 0.2
105 0.21
106 0.2
107 0.18
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.09
117 0.09
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.13
122 0.15
123 0.16
124 0.17
125 0.17
126 0.21
127 0.22
128 0.22
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.17
133 0.15
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.09
144 0.13
145 0.17
146 0.18
147 0.2
148 0.28
149 0.37
150 0.46
151 0.56
152 0.63
153 0.69
154 0.8
155 0.87
156 0.91
157 0.9
158 0.89
159 0.86
160 0.85
161 0.78
162 0.72
163 0.67
164 0.57
165 0.5
166 0.4
167 0.31
168 0.21
169 0.16
170 0.12
171 0.07
172 0.09
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.17
177 0.17
178 0.19
179 0.22
180 0.23
181 0.24
182 0.27
183 0.33
184 0.33
185 0.35
186 0.36
187 0.38
188 0.36
189 0.38
190 0.42
191 0.37
192 0.38
193 0.4
194 0.42
195 0.45
196 0.47
197 0.4
198 0.4
199 0.39
200 0.4
201 0.44
202 0.43
203 0.37
204 0.4
205 0.41
206 0.35
207 0.36
208 0.34
209 0.29
210 0.26
211 0.24
212 0.18
213 0.17
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.14
219 0.14
220 0.16
221 0.19
222 0.2
223 0.25
224 0.29
225 0.33
226 0.35
227 0.37
228 0.39
229 0.36
230 0.39
231 0.32
232 0.27
233 0.26
234 0.26
235 0.23
236 0.24
237 0.24
238 0.22
239 0.24
240 0.23
241 0.2
242 0.19
243 0.21
244 0.18
245 0.2
246 0.21
247 0.18
248 0.2
249 0.26
250 0.27
251 0.25
252 0.24
253 0.23
254 0.23
255 0.22
256 0.27
257 0.23
258 0.23
259 0.22
260 0.22
261 0.2
262 0.18
263 0.19
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.1
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.19
282 0.23
283 0.26
284 0.32
285 0.35
286 0.36
287 0.37
288 0.37
289 0.37
290 0.34
291 0.32
292 0.26
293 0.24
294 0.29
295 0.3
296 0.36
297 0.33
298 0.33
299 0.33
300 0.35
301 0.36
302 0.33
303 0.35
304 0.31
305 0.32
306 0.31
307 0.3
308 0.24
309 0.23
310 0.22
311 0.19
312 0.2
313 0.15
314 0.17
315 0.14
316 0.16
317 0.18
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.14
327 0.19
328 0.2
329 0.21
330 0.22
331 0.23
332 0.23
333 0.25
334 0.26
335 0.24
336 0.23
337 0.24
338 0.22
339 0.21
340 0.19
341 0.15
342 0.12
343 0.08
344 0.09
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.09
358 0.12
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.17
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.16
369 0.16
370 0.19
371 0.23
372 0.25
373 0.29
374 0.31
375 0.31
376 0.37
377 0.41
378 0.41
379 0.41
380 0.41
381 0.36
382 0.35
383 0.37
384 0.3
385 0.28
386 0.31
387 0.29
388 0.27
389 0.27
390 0.25
391 0.23
392 0.28
393 0.28
394 0.24
395 0.22
396 0.2
397 0.19
398 0.18
399 0.16
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.12
407 0.15
408 0.2
409 0.29
410 0.39
411 0.48
412 0.55
413 0.65
414 0.72
415 0.79
416 0.84
417 0.85
418 0.85
419 0.84
420 0.83
421 0.75
422 0.7
423 0.6
424 0.52
425 0.43
426 0.35
427 0.34
428 0.3
429 0.27
430 0.22
431 0.26
432 0.25
433 0.28
434 0.31
435 0.34
436 0.36
437 0.43
438 0.46
439 0.45
440 0.47
441 0.5
442 0.48
443 0.43
444 0.39
445 0.38
446 0.35
447 0.33
448 0.32
449 0.24
450 0.23
451 0.2
452 0.17
453 0.12
454 0.13
455 0.12
456 0.1
457 0.09
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.03
476 0.04
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.07
481 0.07
482 0.1
483 0.11
484 0.1
485 0.14
486 0.16
487 0.18
488 0.18
489 0.2
490 0.22
491 0.24