Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4APC6

Protein Details
Accession D4APC6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-35LDSMKRKSSTENRSRNRNTVRTGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 9, cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
KEGG abe:ARB_06093  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
Amino Acid Sequences MMEAAEAGEFLGLDSMKRKSSTENRSRNRNTVRTGTLANDGREDATAPATTYTYEKKSEISSTTSNNGTLLENRRQRSLDLSARYSHPRGVMKFGGSSLNISPSDQYQNWKSRIENHLKQGQPIEAAHHFLRPPGDFVEENMETLKELSTSIFNENLKAGNTSLAGGIFRWDERNGQVTSDSWEALLLAQGSRWSADTLASLYLRHADRFELSYNLRSLVLRSLVDSFRLGEAKEFIFRYLKDDSSCGLCAIYLGGLYTKSRNMELVEVQAGKLASALLGLGIPPTERLFNPLLKAYIESGYDEKAEALIEEMKDIYGITIGLRPLGLLAYGKALKSDWPAVEEYLQQIHELGLDKSGRKNFTKIFDRIFLEYFLGNSGESIRTFIFKAIDEYGLEMDDVLFEHILIAFIQKGSMEMVDEFLQAAKTRQWNVTSNKEHFIHLLRNHRMTCEKSTVGLWRMFRSSQQKNGRAGASQRILGFDRDSFPLEEAYKLPWTGERTTWSDKVKYASTSGRDVDKFVALRKRMIHSINSGRMDEALELYTVAKASGKVMKQIHIELAVVASLMQNGSANEAQKILEDASRLFPDFDRTKLGTFYKQIFEVRSKEKALKMAVFLFYRTLEENMLPIKHHMTVSASAMLIKHGKPGAALRLFRAVNKGKYGATVPFDAVAVKMISRAAAASGSRRGLRWAILTAMSRKSALHRDLVVELQRLVAHLKYLLEQHSETSTPNAADDALYDELEYLEYLVKLLDQKEAAQSGRVDTVNVAPTDEMPTKAQPTPSYDTPVHFPDPALRASGLAHTLANWCERSEFETASGKERKGPIEMDGFVGSRGSKKLAEPELQLSHG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.14
3 0.18
4 0.2
5 0.21
6 0.29
7 0.39
8 0.49
9 0.56
10 0.64
11 0.69
12 0.79
13 0.85
14 0.85
15 0.85
16 0.82
17 0.78
18 0.75
19 0.71
20 0.64
21 0.59
22 0.52
23 0.51
24 0.48
25 0.42
26 0.36
27 0.32
28 0.29
29 0.27
30 0.25
31 0.17
32 0.15
33 0.15
34 0.13
35 0.14
36 0.13
37 0.14
38 0.16
39 0.21
40 0.22
41 0.25
42 0.25
43 0.26
44 0.29
45 0.33
46 0.32
47 0.33
48 0.34
49 0.35
50 0.38
51 0.37
52 0.34
53 0.3
54 0.28
55 0.24
56 0.26
57 0.29
58 0.34
59 0.4
60 0.41
61 0.46
62 0.46
63 0.45
64 0.44
65 0.46
66 0.45
67 0.44
68 0.45
69 0.45
70 0.48
71 0.53
72 0.48
73 0.43
74 0.41
75 0.41
76 0.4
77 0.43
78 0.42
79 0.38
80 0.37
81 0.36
82 0.33
83 0.26
84 0.27
85 0.21
86 0.22
87 0.21
88 0.2
89 0.2
90 0.2
91 0.26
92 0.25
93 0.29
94 0.33
95 0.41
96 0.44
97 0.46
98 0.45
99 0.47
100 0.55
101 0.59
102 0.58
103 0.58
104 0.63
105 0.61
106 0.62
107 0.57
108 0.49
109 0.42
110 0.35
111 0.32
112 0.25
113 0.28
114 0.26
115 0.26
116 0.24
117 0.23
118 0.26
119 0.22
120 0.23
121 0.2
122 0.23
123 0.2
124 0.21
125 0.27
126 0.23
127 0.23
128 0.21
129 0.19
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.1
137 0.12
138 0.14
139 0.18
140 0.18
141 0.19
142 0.2
143 0.2
144 0.19
145 0.18
146 0.16
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.16
161 0.21
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.18
166 0.21
167 0.21
168 0.18
169 0.13
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.08
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.16
196 0.19
197 0.2
198 0.19
199 0.2
200 0.23
201 0.23
202 0.23
203 0.22
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.18
208 0.15
209 0.15
210 0.18
211 0.17
212 0.18
213 0.18
214 0.15
215 0.15
216 0.16
217 0.15
218 0.12
219 0.14
220 0.14
221 0.17
222 0.16
223 0.16
224 0.18
225 0.18
226 0.21
227 0.22
228 0.23
229 0.2
230 0.21
231 0.2
232 0.21
233 0.21
234 0.17
235 0.14
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.13
250 0.13
251 0.15
252 0.16
253 0.17
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.12
260 0.11
261 0.08
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.07
274 0.07
275 0.11
276 0.14
277 0.16
278 0.18
279 0.18
280 0.19
281 0.17
282 0.18
283 0.16
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.04
316 0.04
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.12
324 0.16
325 0.13
326 0.14
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.16
331 0.14
332 0.12
333 0.12
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.09
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.16
344 0.2
345 0.22
346 0.22
347 0.26
348 0.27
349 0.34
350 0.4
351 0.39
352 0.38
353 0.39
354 0.39
355 0.37
356 0.34
357 0.27
358 0.21
359 0.18
360 0.15
361 0.11
362 0.09
363 0.07
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.1
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.08
383 0.06
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.08
413 0.11
414 0.13
415 0.15
416 0.18
417 0.24
418 0.28
419 0.37
420 0.4
421 0.39
422 0.42
423 0.41
424 0.38
425 0.33
426 0.31
427 0.28
428 0.27
429 0.34
430 0.32
431 0.35
432 0.35
433 0.35
434 0.36
435 0.34
436 0.32
437 0.28
438 0.25
439 0.22
440 0.23
441 0.25
442 0.25
443 0.25
444 0.22
445 0.19
446 0.21
447 0.2
448 0.24
449 0.29
450 0.29
451 0.36
452 0.44
453 0.48
454 0.49
455 0.52
456 0.48
457 0.41
458 0.39
459 0.36
460 0.29
461 0.24
462 0.22
463 0.21
464 0.21
465 0.2
466 0.19
467 0.13
468 0.14
469 0.13
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.14
474 0.13
475 0.13
476 0.12
477 0.13
478 0.12
479 0.12
480 0.11
481 0.12
482 0.15
483 0.16
484 0.17
485 0.19
486 0.23
487 0.28
488 0.33
489 0.33
490 0.31
491 0.31
492 0.32
493 0.3
494 0.26
495 0.25
496 0.24
497 0.24
498 0.26
499 0.25
500 0.27
501 0.25
502 0.25
503 0.23
504 0.22
505 0.2
506 0.21
507 0.26
508 0.23
509 0.26
510 0.28
511 0.3
512 0.31
513 0.33
514 0.31
515 0.31
516 0.37
517 0.4
518 0.39
519 0.37
520 0.32
521 0.3
522 0.28
523 0.21
524 0.15
525 0.09
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.05
534 0.08
535 0.13
536 0.13
537 0.19
538 0.21
539 0.24
540 0.26
541 0.26
542 0.25
543 0.21
544 0.21
545 0.14
546 0.13
547 0.09
548 0.07
549 0.06
550 0.05
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.08
557 0.09
558 0.1
559 0.1
560 0.11
561 0.11
562 0.1
563 0.12
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.13
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.13
573 0.19
574 0.2
575 0.2
576 0.23
577 0.23
578 0.24
579 0.27
580 0.29
581 0.26
582 0.28
583 0.31
584 0.27
585 0.29
586 0.29
587 0.29
588 0.31
589 0.32
590 0.33
591 0.34
592 0.34
593 0.36
594 0.37
595 0.39
596 0.37
597 0.34
598 0.32
599 0.3
600 0.31
601 0.27
602 0.25
603 0.22
604 0.19
605 0.18
606 0.17
607 0.15
608 0.12
609 0.12
610 0.13
611 0.14
612 0.15
613 0.14
614 0.14
615 0.15
616 0.16
617 0.16
618 0.15
619 0.15
620 0.16
621 0.18
622 0.18
623 0.16
624 0.15
625 0.15
626 0.16
627 0.16
628 0.14
629 0.16
630 0.15
631 0.15
632 0.16
633 0.19
634 0.25
635 0.28
636 0.28
637 0.26
638 0.32
639 0.33
640 0.32
641 0.38
642 0.35
643 0.33
644 0.36
645 0.36
646 0.29
647 0.31
648 0.32
649 0.28
650 0.25
651 0.23
652 0.2
653 0.18
654 0.18
655 0.16
656 0.14
657 0.12
658 0.09
659 0.07
660 0.08
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.06
666 0.08
667 0.09
668 0.12
669 0.15
670 0.18
671 0.19
672 0.2
673 0.22
674 0.22
675 0.23
676 0.22
677 0.2
678 0.19
679 0.21
680 0.24
681 0.25
682 0.27
683 0.25
684 0.23
685 0.22
686 0.25
687 0.3
688 0.3
689 0.3
690 0.29
691 0.3
692 0.32
693 0.35
694 0.34
695 0.27
696 0.25
697 0.21
698 0.2
699 0.18
700 0.18
701 0.14
702 0.11
703 0.11
704 0.12
705 0.13
706 0.16
707 0.18
708 0.19
709 0.19
710 0.2
711 0.22
712 0.22
713 0.21
714 0.2
715 0.2
716 0.17
717 0.17
718 0.15
719 0.13
720 0.12
721 0.12
722 0.13
723 0.11
724 0.11
725 0.11
726 0.11
727 0.1
728 0.11
729 0.1
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.08
736 0.11
737 0.12
738 0.15
739 0.14
740 0.16
741 0.2
742 0.24
743 0.23
744 0.23
745 0.23
746 0.22
747 0.26
748 0.24
749 0.21
750 0.19
751 0.23
752 0.24
753 0.23
754 0.22
755 0.17
756 0.18
757 0.23
758 0.24
759 0.21
760 0.19
761 0.23
762 0.26
763 0.29
764 0.32
765 0.3
766 0.35
767 0.4
768 0.4
769 0.44
770 0.41
771 0.41
772 0.41
773 0.43
774 0.39
775 0.32
776 0.3
777 0.3
778 0.32
779 0.3
780 0.28
781 0.23
782 0.21
783 0.21
784 0.23
785 0.18
786 0.16
787 0.15
788 0.13
789 0.16
790 0.17
791 0.2
792 0.18
793 0.18
794 0.18
795 0.19
796 0.21
797 0.22
798 0.21
799 0.21
800 0.29
801 0.3
802 0.37
803 0.41
804 0.39
805 0.41
806 0.44
807 0.43
808 0.39
809 0.39
810 0.36
811 0.37
812 0.37
813 0.34
814 0.31
815 0.29
816 0.24
817 0.24
818 0.2
819 0.17
820 0.18
821 0.18
822 0.18
823 0.21
824 0.3
825 0.35
826 0.39
827 0.4
828 0.45