Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AVA1

Protein Details
Accession D4AVA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-250IMNANQPNPCNKRKKLTPRSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG abe:ARB_00110  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MECTENRKLEQHNVPDKLPEEALEILKKASKERDLEDFRDGLKIYSKAVPLATYVDIEKLLRQEKLNVYLIALEREIGDCHTVVNLQGKLNCKYVVGLYFSDKPQRINLKERWPATPEENLERLAEAGFPLDRQIPKCSNCGIISLLTICPQEMGHIMKSCKEELSVVERVEVKCVNCKQPGHRARDCKEARVDRFACRNCGKGGHRSNECTEPRSAEGVECKRCNEGIIMNANQPNPCNKRKKLTPRSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.57
3 0.54
4 0.48
5 0.39
6 0.3
7 0.23
8 0.22
9 0.25
10 0.22
11 0.21
12 0.19
13 0.22
14 0.22
15 0.23
16 0.27
17 0.3
18 0.32
19 0.34
20 0.43
21 0.47
22 0.49
23 0.49
24 0.43
25 0.38
26 0.37
27 0.34
28 0.25
29 0.24
30 0.22
31 0.2
32 0.23
33 0.23
34 0.22
35 0.22
36 0.21
37 0.17
38 0.19
39 0.17
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.13
44 0.12
45 0.13
46 0.15
47 0.16
48 0.18
49 0.18
50 0.23
51 0.26
52 0.32
53 0.34
54 0.29
55 0.27
56 0.27
57 0.27
58 0.23
59 0.19
60 0.13
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.17
75 0.21
76 0.23
77 0.25
78 0.24
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.16
84 0.14
85 0.15
86 0.18
87 0.19
88 0.24
89 0.23
90 0.22
91 0.25
92 0.32
93 0.33
94 0.38
95 0.43
96 0.47
97 0.53
98 0.53
99 0.5
100 0.44
101 0.43
102 0.38
103 0.36
104 0.28
105 0.26
106 0.25
107 0.23
108 0.21
109 0.19
110 0.16
111 0.12
112 0.1
113 0.06
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.08
119 0.09
120 0.11
121 0.16
122 0.2
123 0.21
124 0.24
125 0.24
126 0.24
127 0.23
128 0.23
129 0.19
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.1
142 0.11
143 0.15
144 0.16
145 0.19
146 0.21
147 0.21
148 0.19
149 0.18
150 0.16
151 0.15
152 0.2
153 0.2
154 0.18
155 0.2
156 0.23
157 0.22
158 0.24
159 0.24
160 0.19
161 0.24
162 0.27
163 0.31
164 0.33
165 0.36
166 0.39
167 0.48
168 0.55
169 0.56
170 0.59
171 0.63
172 0.61
173 0.68
174 0.65
175 0.6
176 0.62
177 0.62
178 0.58
179 0.59
180 0.58
181 0.53
182 0.6
183 0.57
184 0.55
185 0.49
186 0.49
187 0.41
188 0.47
189 0.44
190 0.45
191 0.51
192 0.52
193 0.54
194 0.56
195 0.58
196 0.6
197 0.59
198 0.52
199 0.45
200 0.4
201 0.38
202 0.36
203 0.32
204 0.26
205 0.32
206 0.37
207 0.43
208 0.41
209 0.41
210 0.4
211 0.4
212 0.38
213 0.32
214 0.27
215 0.25
216 0.3
217 0.31
218 0.34
219 0.37
220 0.38
221 0.36
222 0.34
223 0.38
224 0.38
225 0.45
226 0.5
227 0.53
228 0.61
229 0.71
230 0.8