Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4ASP2

Protein Details
Accession D4ASP2    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-200DRSTAHTEKERRHRRHRHRDERDRDRDRDRBasic
210-245RDEERRSSRRSRRHHDEDDRRSRHHRRDRSRSASHSBasic
250-292PSSSRRSYRSPSPHRRKRSFSPRQRDRDRDRSRSPYRRREEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-314KERRHRRHRHRDERDRDRDRDRDRDRDRDRDRDEERRSSRRSRRHHDEDDRRSRHHRRDRSRSASHSRSPPPSSSRRSYRSPSPHRRKRSFSPRQRDRDRDRSRSPYRRREEEESSRRHTSSYRSHRSTGPRRPKP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG abe:ARB_07257  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGDLNVKKSWHPVLLKNQERVWVEQKKALEERKRIDQMMKERQEERQIQELQEMQEAAGGKKRLNRVDWMYSGPAAGQTGTTEEMEGYLLGRRRIDGLLKGSENSKLEKAAPEESFMLAQNANTARDTAAKIREDPMLAIKKQEQAAYEAMMNDPARRRALLKAAGMDEDRSTAHTEKERRHRRHRHRDERDRDRDRDRDRDRDRDRDRDEERRSSRRSRRHHDEDDRRSRHHRRDRSRSASHSRSPPPSSSRRSYRSPSPHRRKRSFSPRQRDRDRDRSRSPYRRREEEESSRRHTSSYRSHRSTGPRRPKPEIHQSRPPQPSSADLERERAARLAAMQQNANELDEERTRRINAAEEREKAEREAEEAARAESSKYGGRGAFVNNIHRKAGDIDLADRLQRGKKNLEKEQEAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.61
3 0.67
4 0.67
5 0.64
6 0.64
7 0.61
8 0.59
9 0.57
10 0.54
11 0.5
12 0.49
13 0.5
14 0.5
15 0.55
16 0.58
17 0.58
18 0.58
19 0.61
20 0.66
21 0.7
22 0.65
23 0.64
24 0.63
25 0.64
26 0.66
27 0.67
28 0.62
29 0.59
30 0.62
31 0.65
32 0.62
33 0.57
34 0.55
35 0.51
36 0.47
37 0.49
38 0.47
39 0.4
40 0.36
41 0.31
42 0.21
43 0.2
44 0.21
45 0.17
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.24
50 0.31
51 0.35
52 0.37
53 0.43
54 0.44
55 0.5
56 0.5
57 0.49
58 0.44
59 0.38
60 0.35
61 0.28
62 0.22
63 0.15
64 0.13
65 0.09
66 0.07
67 0.08
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.09
77 0.12
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.16
82 0.18
83 0.21
84 0.22
85 0.24
86 0.28
87 0.28
88 0.29
89 0.28
90 0.3
91 0.28
92 0.26
93 0.23
94 0.19
95 0.2
96 0.22
97 0.24
98 0.26
99 0.25
100 0.24
101 0.24
102 0.23
103 0.22
104 0.19
105 0.17
106 0.12
107 0.11
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.21
118 0.22
119 0.23
120 0.24
121 0.26
122 0.24
123 0.22
124 0.25
125 0.26
126 0.25
127 0.26
128 0.26
129 0.29
130 0.3
131 0.31
132 0.24
133 0.21
134 0.22
135 0.2
136 0.19
137 0.15
138 0.13
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.18
147 0.18
148 0.24
149 0.26
150 0.26
151 0.26
152 0.26
153 0.26
154 0.25
155 0.22
156 0.16
157 0.12
158 0.11
159 0.09
160 0.12
161 0.11
162 0.13
163 0.18
164 0.23
165 0.3
166 0.41
167 0.51
168 0.56
169 0.67
170 0.75
171 0.81
172 0.87
173 0.91
174 0.92
175 0.92
176 0.95
177 0.94
178 0.94
179 0.93
180 0.89
181 0.82
182 0.77
183 0.74
184 0.68
185 0.68
186 0.62
187 0.62
188 0.6
189 0.66
190 0.64
191 0.66
192 0.66
193 0.65
194 0.64
195 0.61
196 0.61
197 0.6
198 0.6
199 0.59
200 0.59
201 0.58
202 0.6
203 0.62
204 0.66
205 0.66
206 0.7
207 0.7
208 0.74
209 0.75
210 0.8
211 0.81
212 0.83
213 0.84
214 0.86
215 0.8
216 0.73
217 0.72
218 0.7
219 0.7
220 0.7
221 0.69
222 0.69
223 0.76
224 0.83
225 0.84
226 0.82
227 0.8
228 0.78
229 0.75
230 0.7
231 0.67
232 0.62
233 0.6
234 0.56
235 0.52
236 0.5
237 0.52
238 0.53
239 0.52
240 0.55
241 0.54
242 0.56
243 0.57
244 0.6
245 0.63
246 0.67
247 0.71
248 0.75
249 0.79
250 0.84
251 0.87
252 0.84
253 0.84
254 0.84
255 0.84
256 0.83
257 0.85
258 0.85
259 0.88
260 0.9
261 0.89
262 0.87
263 0.87
264 0.85
265 0.83
266 0.8
267 0.8
268 0.81
269 0.82
270 0.83
271 0.83
272 0.81
273 0.81
274 0.8
275 0.77
276 0.75
277 0.76
278 0.75
279 0.71
280 0.7
281 0.65
282 0.59
283 0.53
284 0.46
285 0.42
286 0.44
287 0.48
288 0.52
289 0.52
290 0.55
291 0.6
292 0.68
293 0.71
294 0.71
295 0.72
296 0.71
297 0.73
298 0.78
299 0.79
300 0.77
301 0.78
302 0.78
303 0.75
304 0.76
305 0.76
306 0.78
307 0.77
308 0.71
309 0.62
310 0.52
311 0.49
312 0.46
313 0.45
314 0.43
315 0.37
316 0.39
317 0.39
318 0.39
319 0.35
320 0.28
321 0.22
322 0.16
323 0.16
324 0.21
325 0.23
326 0.24
327 0.25
328 0.24
329 0.27
330 0.27
331 0.26
332 0.18
333 0.15
334 0.16
335 0.2
336 0.24
337 0.23
338 0.26
339 0.26
340 0.28
341 0.28
342 0.33
343 0.35
344 0.41
345 0.46
346 0.46
347 0.49
348 0.51
349 0.51
350 0.43
351 0.39
352 0.3
353 0.25
354 0.27
355 0.24
356 0.24
357 0.24
358 0.23
359 0.21
360 0.21
361 0.2
362 0.15
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.2
367 0.19
368 0.2
369 0.22
370 0.24
371 0.29
372 0.29
373 0.38
374 0.41
375 0.44
376 0.43
377 0.4
378 0.39
379 0.35
380 0.35
381 0.3
382 0.25
383 0.24
384 0.28
385 0.3
386 0.29
387 0.27
388 0.27
389 0.29
390 0.32
391 0.36
392 0.4
393 0.47
394 0.56
395 0.64
396 0.69