Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AIF9

Protein Details
Accession D4AIF9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-95LQYNSRARSKWQKPPTSRDIPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG abe:ARB_04054  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
Amino Acid Sequences MTNFNLHCSINNYLHLPLTIPKQVKATVSFVTQALLYAALGDHVNSLKRQVREPAFLCGVAFTKDRRRIFQLRLQYNSRARSKWQKPPTSRDIPPVTLTTIPPVEPLVFKNYLSQIGPLFDTLQRMKLEYENRGTQSFRQDTATDKHEEFAPREKSKIGVSKRGQLAPTPLSTIPSVYFDENFRLEDPRTFDVVSEHAEVVRQPLSTIGNRNNDTDGIVANGDPHPARKALTTDAILQEKLSWYMDTVEIHLIYSISKASTSFFAALGSLRELQTEVSHSVTKIQKLREDLVHLDNAMIEHGFEIIRVKRRQDNLRKLGEAIMQHQCVLRGVSHCEELVDSGKLETAIQHISYVEQLVSGTLDPKIGSELCWFLPNSFTRLIDLRQLHVLEDPLQNIGQLRLRIWKGYEARLLHVLLCDLRQHVSSIPPRDTLSRWTDISKRTHSSLSTPAPMTTAEKLREELVPVLQGLGQSQYLAAASTTFREAVIREMKSLIRRHLPSSTDDDNESMVSASTLTSGRRPSQQERLSILSRNLRALSPEDAHVFFVKVYCRVGEALRRLSVQIKVLLDITSGIKKSPSNVLTSSLSERCNLQEDMTQTLDMSSLLVQAVDKVESEMTKVLRVRTEQTVRLGPTEFLRYFTLNRLFINECEAISGHSGTALRGVVNKQIHDFIPLLHEVEKQKLAQKMETERWEPVNFKPQDALILERVVQSMTTDSSVWLSYTDVTTAALETGERNLQTNYEGSSNTAKQNKKDPALAVIDEEKFMLVDSAAFALRGIEQYLILLASIPSMANEISMALLDYLTLYNSRTQELILGAGARTTAGLTNINTKHLSLTSQSLSFFITLIPYLRESIRRRPSIVTSGLAEYDQLKRLFQDHRSSIHHKLISIMSFRATLYIREMEKIKWDDEDEIQRSVSPHMETLTKEALTLQRVLSKYLPGSSMSMIIGQVFESYREQWGKAFEDAVIRTETGKSRLLRDAELLQAKLDKIDGAEELGTRMIDIVRAKQISSQPVSRNAPSSGDIPDESNSPSIVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.25
4 0.23
5 0.25
6 0.3
7 0.29
8 0.3
9 0.33
10 0.36
11 0.38
12 0.38
13 0.36
14 0.31
15 0.32
16 0.32
17 0.28
18 0.26
19 0.21
20 0.18
21 0.14
22 0.12
23 0.09
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.09
30 0.11
31 0.13
32 0.13
33 0.21
34 0.26
35 0.29
36 0.33
37 0.4
38 0.44
39 0.51
40 0.52
41 0.53
42 0.49
43 0.47
44 0.42
45 0.35
46 0.3
47 0.24
48 0.24
49 0.22
50 0.29
51 0.38
52 0.42
53 0.46
54 0.52
55 0.57
56 0.63
57 0.66
58 0.67
59 0.66
60 0.69
61 0.69
62 0.69
63 0.68
64 0.69
65 0.67
66 0.59
67 0.59
68 0.63
69 0.67
70 0.69
71 0.72
72 0.75
73 0.76
74 0.83
75 0.85
76 0.83
77 0.77
78 0.76
79 0.72
80 0.65
81 0.59
82 0.52
83 0.46
84 0.39
85 0.36
86 0.32
87 0.27
88 0.23
89 0.21
90 0.2
91 0.19
92 0.18
93 0.2
94 0.21
95 0.21
96 0.21
97 0.25
98 0.26
99 0.28
100 0.27
101 0.27
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.18
106 0.18
107 0.16
108 0.21
109 0.21
110 0.24
111 0.23
112 0.24
113 0.25
114 0.29
115 0.33
116 0.34
117 0.4
118 0.41
119 0.43
120 0.44
121 0.44
122 0.42
123 0.46
124 0.43
125 0.38
126 0.35
127 0.33
128 0.36
129 0.39
130 0.39
131 0.34
132 0.31
133 0.3
134 0.32
135 0.35
136 0.33
137 0.37
138 0.41
139 0.39
140 0.4
141 0.4
142 0.37
143 0.41
144 0.46
145 0.43
146 0.45
147 0.46
148 0.53
149 0.58
150 0.6
151 0.54
152 0.48
153 0.48
154 0.42
155 0.39
156 0.34
157 0.29
158 0.27
159 0.26
160 0.24
161 0.19
162 0.18
163 0.19
164 0.17
165 0.18
166 0.17
167 0.21
168 0.2
169 0.21
170 0.19
171 0.2
172 0.2
173 0.23
174 0.26
175 0.26
176 0.27
177 0.25
178 0.25
179 0.23
180 0.24
181 0.23
182 0.2
183 0.17
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.12
190 0.1
191 0.12
192 0.16
193 0.19
194 0.25
195 0.3
196 0.36
197 0.37
198 0.39
199 0.38
200 0.35
201 0.32
202 0.26
203 0.19
204 0.12
205 0.11
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.17
217 0.18
218 0.22
219 0.23
220 0.24
221 0.28
222 0.29
223 0.27
224 0.24
225 0.22
226 0.19
227 0.18
228 0.16
229 0.11
230 0.1
231 0.12
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.09
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.13
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.13
267 0.2
268 0.23
269 0.28
270 0.3
271 0.32
272 0.34
273 0.37
274 0.4
275 0.36
276 0.37
277 0.35
278 0.33
279 0.31
280 0.27
281 0.23
282 0.19
283 0.16
284 0.12
285 0.09
286 0.06
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.08
292 0.12
293 0.21
294 0.23
295 0.27
296 0.33
297 0.4
298 0.51
299 0.58
300 0.65
301 0.65
302 0.69
303 0.66
304 0.61
305 0.56
306 0.48
307 0.39
308 0.33
309 0.3
310 0.24
311 0.24
312 0.23
313 0.21
314 0.18
315 0.18
316 0.15
317 0.12
318 0.15
319 0.16
320 0.17
321 0.16
322 0.16
323 0.15
324 0.14
325 0.14
326 0.11
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.11
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.16
362 0.16
363 0.18
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.18
368 0.19
369 0.21
370 0.21
371 0.19
372 0.21
373 0.21
374 0.2
375 0.19
376 0.19
377 0.15
378 0.15
379 0.14
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.16
389 0.17
390 0.18
391 0.19
392 0.24
393 0.24
394 0.27
395 0.31
396 0.26
397 0.27
398 0.29
399 0.28
400 0.21
401 0.19
402 0.16
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.15
412 0.2
413 0.24
414 0.25
415 0.25
416 0.26
417 0.27
418 0.28
419 0.27
420 0.26
421 0.25
422 0.24
423 0.25
424 0.29
425 0.32
426 0.37
427 0.36
428 0.34
429 0.33
430 0.34
431 0.32
432 0.31
433 0.32
434 0.3
435 0.28
436 0.26
437 0.24
438 0.22
439 0.22
440 0.21
441 0.17
442 0.18
443 0.16
444 0.16
445 0.17
446 0.18
447 0.17
448 0.17
449 0.15
450 0.11
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.08
455 0.08
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.11
474 0.16
475 0.16
476 0.16
477 0.17
478 0.19
479 0.24
480 0.27
481 0.25
482 0.26
483 0.27
484 0.29
485 0.32
486 0.31
487 0.28
488 0.32
489 0.32
490 0.26
491 0.25
492 0.23
493 0.2
494 0.18
495 0.15
496 0.09
497 0.06
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.08
505 0.1
506 0.12
507 0.17
508 0.22
509 0.25
510 0.34
511 0.37
512 0.39
513 0.4
514 0.43
515 0.39
516 0.36
517 0.35
518 0.31
519 0.28
520 0.25
521 0.23
522 0.19
523 0.18
524 0.19
525 0.18
526 0.14
527 0.15
528 0.15
529 0.15
530 0.15
531 0.14
532 0.12
533 0.09
534 0.1
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.08
539 0.09
540 0.09
541 0.11
542 0.14
543 0.17
544 0.19
545 0.2
546 0.2
547 0.2
548 0.21
549 0.22
550 0.18
551 0.17
552 0.15
553 0.14
554 0.15
555 0.14
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.1
564 0.12
565 0.18
566 0.18
567 0.18
568 0.19
569 0.22
570 0.23
571 0.24
572 0.26
573 0.22
574 0.21
575 0.19
576 0.19
577 0.16
578 0.18
579 0.17
580 0.14
581 0.15
582 0.16
583 0.18
584 0.18
585 0.17
586 0.13
587 0.13
588 0.12
589 0.09
590 0.08
591 0.05
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.06
602 0.06
603 0.07
604 0.09
605 0.09
606 0.12
607 0.14
608 0.15
609 0.16
610 0.18
611 0.21
612 0.26
613 0.3
614 0.29
615 0.3
616 0.33
617 0.31
618 0.31
619 0.28
620 0.22
621 0.19
622 0.23
623 0.2
624 0.18
625 0.19
626 0.19
627 0.19
628 0.24
629 0.27
630 0.23
631 0.23
632 0.24
633 0.24
634 0.23
635 0.26
636 0.21
637 0.16
638 0.15
639 0.15
640 0.12
641 0.12
642 0.12
643 0.07
644 0.08
645 0.08
646 0.07
647 0.09
648 0.08
649 0.07
650 0.09
651 0.1
652 0.15
653 0.17
654 0.17
655 0.17
656 0.19
657 0.19
658 0.19
659 0.19
660 0.13
661 0.14
662 0.14
663 0.14
664 0.13
665 0.16
666 0.15
667 0.18
668 0.19
669 0.18
670 0.22
671 0.25
672 0.26
673 0.25
674 0.29
675 0.33
676 0.37
677 0.41
678 0.38
679 0.36
680 0.38
681 0.37
682 0.34
683 0.31
684 0.35
685 0.3
686 0.29
687 0.28
688 0.24
689 0.25
690 0.24
691 0.24
692 0.16
693 0.16
694 0.16
695 0.15
696 0.15
697 0.12
698 0.1
699 0.08
700 0.07
701 0.07
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.09
706 0.09
707 0.09
708 0.08
709 0.08
710 0.07
711 0.08
712 0.08
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.06
718 0.06
719 0.05
720 0.05
721 0.07
722 0.09
723 0.09
724 0.1
725 0.1
726 0.1
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.12
732 0.13
733 0.17
734 0.19
735 0.24
736 0.31
737 0.32
738 0.34
739 0.43
740 0.48
741 0.46
742 0.48
743 0.43
744 0.41
745 0.42
746 0.39
747 0.32
748 0.28
749 0.25
750 0.21
751 0.2
752 0.15
753 0.11
754 0.1
755 0.08
756 0.04
757 0.04
758 0.04
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.07
766 0.07
767 0.06
768 0.06
769 0.06
770 0.07
771 0.06
772 0.05
773 0.05
774 0.04
775 0.04
776 0.05
777 0.04
778 0.04
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.04
788 0.04
789 0.04
790 0.05
791 0.05
792 0.05
793 0.06
794 0.06
795 0.11
796 0.12
797 0.13
798 0.13
799 0.13
800 0.14
801 0.14
802 0.14
803 0.1
804 0.1
805 0.09
806 0.09
807 0.08
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.06
812 0.06
813 0.09
814 0.1
815 0.19
816 0.2
817 0.23
818 0.23
819 0.22
820 0.23
821 0.21
822 0.22
823 0.16
824 0.2
825 0.19
826 0.2
827 0.2
828 0.19
829 0.19
830 0.17
831 0.15
832 0.11
833 0.09
834 0.08
835 0.09
836 0.1
837 0.1
838 0.12
839 0.14
840 0.22
841 0.26
842 0.36
843 0.44
844 0.47
845 0.48
846 0.51
847 0.54
848 0.53
849 0.51
850 0.43
851 0.36
852 0.34
853 0.32
854 0.27
855 0.22
856 0.18
857 0.18
858 0.21
859 0.19
860 0.18
861 0.18
862 0.23
863 0.28
864 0.32
865 0.39
866 0.37
867 0.42
868 0.49
869 0.54
870 0.56
871 0.58
872 0.54
873 0.44
874 0.44
875 0.42
876 0.38
877 0.35
878 0.3
879 0.23
880 0.22
881 0.22
882 0.21
883 0.18
884 0.16
885 0.18
886 0.22
887 0.22
888 0.24
889 0.27
890 0.24
891 0.32
892 0.34
893 0.3
894 0.27
895 0.28
896 0.28
897 0.32
898 0.4
899 0.34
900 0.33
901 0.32
902 0.31
903 0.3
904 0.29
905 0.26
906 0.19
907 0.17
908 0.18
909 0.2
910 0.2
911 0.24
912 0.26
913 0.22
914 0.21
915 0.23
916 0.25
917 0.25
918 0.26
919 0.22
920 0.24
921 0.25
922 0.29
923 0.27
924 0.27
925 0.27
926 0.27
927 0.27
928 0.22
929 0.24
930 0.21
931 0.21
932 0.18
933 0.17
934 0.14
935 0.13
936 0.12
937 0.09
938 0.1
939 0.09
940 0.1
941 0.12
942 0.13
943 0.2
944 0.22
945 0.22
946 0.23
947 0.27
948 0.29
949 0.28
950 0.27
951 0.22
952 0.26
953 0.26
954 0.26
955 0.23
956 0.2
957 0.2
958 0.23
959 0.25
960 0.23
961 0.29
962 0.28
963 0.32
964 0.39
965 0.4
966 0.38
967 0.38
968 0.38
969 0.39
970 0.42
971 0.37
972 0.31
973 0.31
974 0.3
975 0.26
976 0.23
977 0.16
978 0.12
979 0.13
980 0.13
981 0.12
982 0.13
983 0.12
984 0.13
985 0.13
986 0.12
987 0.1
988 0.11
989 0.09
990 0.12
991 0.14
992 0.17
993 0.24
994 0.25
995 0.26
996 0.31
997 0.36
998 0.4
999 0.44
1000 0.47
1001 0.45
1002 0.53
1003 0.58
1004 0.55
1005 0.54
1006 0.47
1007 0.45
1008 0.4
1009 0.37
1010 0.3
1011 0.28
1012 0.26
1013 0.24
1014 0.24
1015 0.22
1016 0.22
1017 0.21