Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4APX1

Protein Details
Accession D4APX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22LSLLSNKTPRNNKRTPAPLSHydrophilic
248-269GNMFSFKKKKAPHKNDPPPYLVHydrophilic
599-618CRKALGPKRRQQSNDRNNNGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9, cyto 6.5, cyto_nucl 6.5, nucl 5.5, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047546  Rcat_RBR_RNF216  
IPR047544  RING-HC_RBR_RNF216  
IPR044066  TRIAD_supradom  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
KEGG abe:ARB_05826  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20353  Rcat_RBR_RNF216  
cd16630  RING-HC_RBR_RNF216  
Amino Acid Sequences MVLSLLSNKTPRNNKRTPAPLSSSASSSTASSSSRSIKVVSPATAITVKLSPTASSTLAEALRSDPFSPGSQSNTNTTTATTTTTTPAADILTGSHDTEDENHRELRERNDALNVLARIFPDIHPEVFRELLTRFDGKSRLEVSVEQLLRYRSEWVKGRWNVSSTSGGTGILSTTEGSPDARNKPVPREELFRSDQYKDAVRAALAAEFRSLSRSTIDAVLAEGNFSYIRARPTLLDLSRKSWRVTLGNMFSFKKKKAPHKNDPPPYLVWQRSSTDEPEPVLKSTGCEELDEEIHSTYLLPLVNQRRETQVEEDFRKAEDLNEVEAKVVDALYECDCCLSDVTFEQISTCSEACHVICFNCIQRTLQEALFGQGWDKSISSEKSTLWCIAPFANGTCQGTLDAELVKRAILKERSGMETYRKFEARLASDSLAKSNLKLIHCPFCSYAEVDPVFHPSVKGITWQFRKASLATSIAVSILLLDIFQFFLLPLLLLLCISPSALRTIFHRSLQNICLRRRSPRFKCGNPTCSRASCMRCHKAWNDPHTCHEPLLQSLRTTVEAARTAAIKRTCPCCGLSFVKSSGCNKLTCVCGYSMCYICRKALGPKRRQQSNDRNNNGGGGIQLLDGTANAESDNDEIGEEAEGYKHFCEHFRIIPGSACTECNKCGLYQTEDEEAVAQRAGEQAQREWRIQQGMEVNTEDTRTTGAAVTSHKRNPTGATPNGMARVYDWDLQFDVTSGSRKFGWEFWTKDLWQNQRWKMEIQLLVDNAIDTLVVVDAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.74
3 0.8
4 0.79
5 0.77
6 0.74
7 0.72
8 0.7
9 0.65
10 0.57
11 0.49
12 0.43
13 0.35
14 0.28
15 0.23
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.2
20 0.24
21 0.26
22 0.27
23 0.27
24 0.29
25 0.35
26 0.38
27 0.35
28 0.32
29 0.29
30 0.31
31 0.31
32 0.27
33 0.22
34 0.2
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.16
39 0.17
40 0.2
41 0.18
42 0.17
43 0.17
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.16
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.17
53 0.18
54 0.2
55 0.23
56 0.23
57 0.26
58 0.29
59 0.31
60 0.34
61 0.34
62 0.34
63 0.3
64 0.29
65 0.25
66 0.21
67 0.21
68 0.18
69 0.17
70 0.18
71 0.19
72 0.18
73 0.16
74 0.16
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.08
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.15
86 0.21
87 0.21
88 0.23
89 0.24
90 0.25
91 0.3
92 0.33
93 0.36
94 0.39
95 0.38
96 0.37
97 0.4
98 0.4
99 0.36
100 0.39
101 0.32
102 0.24
103 0.22
104 0.21
105 0.18
106 0.19
107 0.18
108 0.19
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.23
113 0.23
114 0.23
115 0.22
116 0.17
117 0.16
118 0.17
119 0.19
120 0.2
121 0.18
122 0.21
123 0.25
124 0.24
125 0.3
126 0.29
127 0.27
128 0.26
129 0.26
130 0.27
131 0.31
132 0.31
133 0.26
134 0.26
135 0.26
136 0.25
137 0.25
138 0.27
139 0.2
140 0.27
141 0.33
142 0.35
143 0.44
144 0.47
145 0.5
146 0.48
147 0.48
148 0.43
149 0.4
150 0.4
151 0.31
152 0.28
153 0.25
154 0.21
155 0.18
156 0.17
157 0.13
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.11
166 0.17
167 0.2
168 0.24
169 0.3
170 0.32
171 0.4
172 0.46
173 0.49
174 0.46
175 0.48
176 0.48
177 0.49
178 0.51
179 0.48
180 0.45
181 0.41
182 0.41
183 0.37
184 0.37
185 0.31
186 0.29
187 0.24
188 0.2
189 0.19
190 0.17
191 0.17
192 0.14
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.1
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.16
221 0.23
222 0.25
223 0.3
224 0.3
225 0.34
226 0.4
227 0.41
228 0.38
229 0.33
230 0.35
231 0.29
232 0.32
233 0.35
234 0.34
235 0.35
236 0.37
237 0.37
238 0.38
239 0.39
240 0.37
241 0.36
242 0.39
243 0.46
244 0.54
245 0.63
246 0.69
247 0.76
248 0.85
249 0.87
250 0.84
251 0.77
252 0.68
253 0.64
254 0.6
255 0.51
256 0.44
257 0.37
258 0.35
259 0.35
260 0.34
261 0.32
262 0.27
263 0.26
264 0.23
265 0.24
266 0.24
267 0.21
268 0.2
269 0.17
270 0.15
271 0.15
272 0.19
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.15
279 0.13
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.12
289 0.19
290 0.24
291 0.25
292 0.26
293 0.28
294 0.31
295 0.33
296 0.31
297 0.3
298 0.32
299 0.34
300 0.34
301 0.31
302 0.29
303 0.27
304 0.24
305 0.18
306 0.15
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.09
315 0.07
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.1
337 0.07
338 0.07
339 0.09
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.12
350 0.12
351 0.16
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.13
359 0.1
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.1
366 0.11
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.17
372 0.17
373 0.14
374 0.13
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.12
397 0.13
398 0.14
399 0.18
400 0.2
401 0.23
402 0.23
403 0.24
404 0.25
405 0.28
406 0.29
407 0.3
408 0.28
409 0.25
410 0.26
411 0.29
412 0.26
413 0.24
414 0.24
415 0.21
416 0.24
417 0.24
418 0.22
419 0.2
420 0.17
421 0.14
422 0.16
423 0.2
424 0.17
425 0.21
426 0.23
427 0.28
428 0.29
429 0.31
430 0.27
431 0.25
432 0.25
433 0.23
434 0.21
435 0.19
436 0.18
437 0.17
438 0.17
439 0.18
440 0.18
441 0.16
442 0.15
443 0.1
444 0.11
445 0.1
446 0.14
447 0.13
448 0.2
449 0.24
450 0.27
451 0.28
452 0.28
453 0.3
454 0.26
455 0.26
456 0.21
457 0.19
458 0.15
459 0.15
460 0.14
461 0.12
462 0.11
463 0.08
464 0.06
465 0.04
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.04
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.04
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.04
486 0.04
487 0.06
488 0.07
489 0.08
490 0.1
491 0.18
492 0.21
493 0.24
494 0.27
495 0.27
496 0.3
497 0.34
498 0.4
499 0.38
500 0.39
501 0.44
502 0.42
503 0.49
504 0.55
505 0.62
506 0.62
507 0.65
508 0.71
509 0.7
510 0.79
511 0.79
512 0.79
513 0.73
514 0.7
515 0.65
516 0.58
517 0.54
518 0.49
519 0.45
520 0.43
521 0.48
522 0.5
523 0.46
524 0.5
525 0.51
526 0.54
527 0.57
528 0.58
529 0.57
530 0.53
531 0.56
532 0.56
533 0.54
534 0.45
535 0.41
536 0.33
537 0.28
538 0.31
539 0.27
540 0.22
541 0.22
542 0.22
543 0.2
544 0.2
545 0.17
546 0.15
547 0.16
548 0.16
549 0.16
550 0.16
551 0.16
552 0.21
553 0.22
554 0.22
555 0.25
556 0.3
557 0.31
558 0.31
559 0.32
560 0.28
561 0.32
562 0.34
563 0.32
564 0.31
565 0.31
566 0.33
567 0.34
568 0.34
569 0.36
570 0.33
571 0.31
572 0.29
573 0.3
574 0.3
575 0.27
576 0.27
577 0.2
578 0.19
579 0.22
580 0.24
581 0.24
582 0.23
583 0.26
584 0.25
585 0.24
586 0.25
587 0.25
588 0.31
589 0.37
590 0.45
591 0.52
592 0.58
593 0.67
594 0.73
595 0.76
596 0.77
597 0.78
598 0.79
599 0.8
600 0.77
601 0.71
602 0.63
603 0.59
604 0.48
605 0.37
606 0.26
607 0.16
608 0.11
609 0.08
610 0.07
611 0.06
612 0.06
613 0.05
614 0.06
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.07
631 0.08
632 0.09
633 0.1
634 0.11
635 0.13
636 0.18
637 0.22
638 0.26
639 0.3
640 0.32
641 0.31
642 0.34
643 0.34
644 0.32
645 0.29
646 0.26
647 0.24
648 0.24
649 0.24
650 0.23
651 0.23
652 0.19
653 0.23
654 0.26
655 0.28
656 0.28
657 0.31
658 0.32
659 0.31
660 0.3
661 0.27
662 0.23
663 0.19
664 0.16
665 0.12
666 0.09
667 0.1
668 0.12
669 0.13
670 0.14
671 0.17
672 0.26
673 0.3
674 0.32
675 0.32
676 0.35
677 0.37
678 0.35
679 0.35
680 0.33
681 0.32
682 0.33
683 0.33
684 0.3
685 0.26
686 0.27
687 0.22
688 0.15
689 0.14
690 0.11
691 0.11
692 0.1
693 0.1
694 0.13
695 0.18
696 0.24
697 0.3
698 0.35
699 0.38
700 0.38
701 0.39
702 0.41
703 0.45
704 0.47
705 0.44
706 0.44
707 0.43
708 0.44
709 0.46
710 0.41
711 0.32
712 0.25
713 0.27
714 0.25
715 0.28
716 0.25
717 0.24
718 0.24
719 0.25
720 0.24
721 0.18
722 0.16
723 0.13
724 0.18
725 0.17
726 0.18
727 0.18
728 0.2
729 0.22
730 0.24
731 0.29
732 0.32
733 0.35
734 0.39
735 0.45
736 0.45
737 0.5
738 0.55
739 0.56
740 0.56
741 0.62
742 0.63
743 0.64
744 0.65
745 0.6
746 0.57
747 0.57
748 0.53
749 0.47
750 0.45
751 0.38
752 0.36
753 0.34
754 0.29
755 0.2
756 0.16
757 0.12
758 0.06
759 0.06