Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AUV3

Protein Details
Accession D4AUV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-175DGTTGPKPRGKRGKYKKRQPPADQAGNGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-181PKPRGKRGKYKKRQPPADQAGNGTGKKRK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG abe:ARB_08020  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSEPRVRLTRHQGQLSFGPEIRQFLYAYGDTTPHSSYPQEPNPETVRVLDEIVTDFVIETCHEAAQVANYSNRQKVKSDDFRFILRRDPIKLGRVQELFRLERELKEARKAFDQNDDRLGGNLKESSKAELADLAGEAGAQDDNFAKDGTTGPKPRGKRGKYKKRQPPADQAGNGTGKKRKVASFDGFFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.55
3 0.49
4 0.4
5 0.35
6 0.29
7 0.31
8 0.28
9 0.24
10 0.2
11 0.17
12 0.21
13 0.17
14 0.17
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.17
19 0.17
20 0.13
21 0.15
22 0.15
23 0.19
24 0.27
25 0.32
26 0.37
27 0.37
28 0.41
29 0.42
30 0.43
31 0.39
32 0.31
33 0.27
34 0.21
35 0.2
36 0.16
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.13
57 0.16
58 0.2
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.27
63 0.34
64 0.42
65 0.43
66 0.45
67 0.43
68 0.46
69 0.48
70 0.44
71 0.4
72 0.34
73 0.33
74 0.3
75 0.33
76 0.31
77 0.32
78 0.34
79 0.3
80 0.31
81 0.31
82 0.28
83 0.27
84 0.28
85 0.25
86 0.22
87 0.25
88 0.2
89 0.18
90 0.22
91 0.23
92 0.2
93 0.27
94 0.29
95 0.26
96 0.31
97 0.33
98 0.3
99 0.35
100 0.38
101 0.32
102 0.33
103 0.33
104 0.28
105 0.26
106 0.27
107 0.17
108 0.15
109 0.15
110 0.13
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.1
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.1
136 0.14
137 0.21
138 0.24
139 0.28
140 0.35
141 0.38
142 0.47
143 0.55
144 0.58
145 0.61
146 0.7
147 0.76
148 0.81
149 0.89
150 0.9
151 0.9
152 0.94
153 0.91
154 0.91
155 0.89
156 0.88
157 0.79
158 0.71
159 0.67
160 0.62
161 0.55
162 0.49
163 0.45
164 0.38
165 0.41
166 0.43
167 0.41
168 0.42
169 0.49
170 0.52