Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AR56

Protein Details
Accession D4AR56    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
413-440EDEAVRERERRRRERRQEDERKLRQSRMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
253-268PKFKHKKIPRGPPSPP
357-397KEKAKKEEHLRQLAQKAREARAGASSSRNESRARSRSRSGS
418-438RERERRRRERRQEDERKLRQS
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 9.833, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG abe:ARB_06885  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASLSEGLFKSLPAPKYTGENEELPAHAQRRGPRVVGADAIDETQIVVKVSGFLPCFFMGSGSLCSSFVSNGVLFLQRAGPPPYGKRAGWRPRSLEDFGDGGAFPEIAVAQYPLDMGRKDAPNKSNALALQVDAEGKVKYDSIAKQGHNENRIVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLDRPSQEEVNAQMEKTKAALEKLVTGAVSAQKPKNVATGKRSEPTFVRYTPANQMGNTNRKNDRIMKIVEKQVDPLEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVLHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRAQMQQKLAEKEKAKKEEHLRQLAQKAREARAGASSSRNESRARSRSRSGSRSPSPYSSRSPTPDEEDEAVRERERRRRERRQEDERKLRQSRMGAERRVQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQTSGLQSGFNEDQPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQMDDDDENAGGAEMDRINRGNRFEVLGRAKEGFKGTEDAEAREGPVEFEKDTADPFGIDGMIAEVTGGQSSSGQKRYGIQEAESSQRGSKRARVDDDDEDDDRHRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.35
4 0.38
5 0.39
6 0.36
7 0.35
8 0.35
9 0.34
10 0.34
11 0.29
12 0.32
13 0.28
14 0.28
15 0.3
16 0.34
17 0.38
18 0.42
19 0.41
20 0.4
21 0.42
22 0.4
23 0.39
24 0.34
25 0.28
26 0.25
27 0.23
28 0.19
29 0.15
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.1
37 0.11
38 0.16
39 0.15
40 0.15
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.16
45 0.16
46 0.13
47 0.14
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.12
56 0.12
57 0.1
58 0.1
59 0.12
60 0.14
61 0.13
62 0.14
63 0.16
64 0.16
65 0.2
66 0.23
67 0.24
68 0.27
69 0.31
70 0.38
71 0.4
72 0.38
73 0.43
74 0.5
75 0.57
76 0.62
77 0.66
78 0.63
79 0.64
80 0.69
81 0.63
82 0.55
83 0.47
84 0.38
85 0.31
86 0.26
87 0.2
88 0.15
89 0.13
90 0.1
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.18
105 0.24
106 0.29
107 0.36
108 0.39
109 0.4
110 0.43
111 0.41
112 0.39
113 0.33
114 0.32
115 0.25
116 0.21
117 0.18
118 0.16
119 0.15
120 0.12
121 0.13
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.13
128 0.15
129 0.21
130 0.28
131 0.28
132 0.33
133 0.41
134 0.46
135 0.45
136 0.45
137 0.39
138 0.37
139 0.39
140 0.35
141 0.29
142 0.24
143 0.23
144 0.22
145 0.21
146 0.23
147 0.21
148 0.24
149 0.28
150 0.32
151 0.31
152 0.33
153 0.33
154 0.28
155 0.31
156 0.27
157 0.21
158 0.19
159 0.18
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.13
170 0.18
171 0.19
172 0.18
173 0.19
174 0.18
175 0.17
176 0.16
177 0.17
178 0.12
179 0.13
180 0.15
181 0.13
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.13
186 0.11
187 0.12
188 0.14
189 0.15
190 0.18
191 0.18
192 0.19
193 0.21
194 0.21
195 0.27
196 0.29
197 0.31
198 0.33
199 0.39
200 0.42
201 0.45
202 0.45
203 0.4
204 0.36
205 0.37
206 0.35
207 0.28
208 0.26
209 0.23
210 0.25
211 0.29
212 0.34
213 0.3
214 0.25
215 0.3
216 0.35
217 0.43
218 0.43
219 0.43
220 0.39
221 0.4
222 0.44
223 0.46
224 0.42
225 0.38
226 0.4
227 0.4
228 0.43
229 0.46
230 0.45
231 0.38
232 0.37
233 0.32
234 0.29
235 0.24
236 0.24
237 0.25
238 0.23
239 0.25
240 0.34
241 0.39
242 0.4
243 0.49
244 0.54
245 0.59
246 0.66
247 0.76
248 0.74
249 0.76
250 0.79
251 0.77
252 0.75
253 0.71
254 0.64
255 0.55
256 0.51
257 0.48
258 0.48
259 0.48
260 0.48
261 0.46
262 0.47
263 0.49
264 0.45
265 0.41
266 0.41
267 0.4
268 0.38
269 0.35
270 0.33
271 0.33
272 0.32
273 0.3
274 0.27
275 0.2
276 0.15
277 0.16
278 0.17
279 0.25
280 0.28
281 0.35
282 0.4
283 0.45
284 0.51
285 0.48
286 0.48
287 0.41
288 0.39
289 0.37
290 0.39
291 0.37
292 0.37
293 0.38
294 0.34
295 0.32
296 0.32
297 0.28
298 0.19
299 0.17
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.15
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.11
314 0.12
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.16
329 0.25
330 0.31
331 0.35
332 0.39
333 0.39
334 0.45
335 0.5
336 0.51
337 0.45
338 0.45
339 0.44
340 0.45
341 0.46
342 0.45
343 0.42
344 0.45
345 0.5
346 0.5
347 0.47
348 0.49
349 0.55
350 0.58
351 0.63
352 0.63
353 0.57
354 0.55
355 0.6
356 0.59
357 0.52
358 0.47
359 0.43
360 0.37
361 0.38
362 0.34
363 0.27
364 0.26
365 0.25
366 0.23
367 0.23
368 0.22
369 0.23
370 0.24
371 0.26
372 0.23
373 0.25
374 0.32
375 0.37
376 0.43
377 0.44
378 0.46
379 0.53
380 0.6
381 0.63
382 0.6
383 0.61
384 0.59
385 0.6
386 0.59
387 0.56
388 0.53
389 0.5
390 0.5
391 0.45
392 0.44
393 0.42
394 0.43
395 0.39
396 0.4
397 0.38
398 0.36
399 0.33
400 0.3
401 0.28
402 0.26
403 0.25
404 0.2
405 0.23
406 0.26
407 0.33
408 0.42
409 0.5
410 0.58
411 0.68
412 0.78
413 0.84
414 0.88
415 0.91
416 0.92
417 0.92
418 0.93
419 0.9
420 0.89
421 0.82
422 0.75
423 0.68
424 0.61
425 0.59
426 0.58
427 0.58
428 0.52
429 0.53
430 0.54
431 0.51
432 0.49
433 0.41
434 0.32
435 0.33
436 0.37
437 0.37
438 0.37
439 0.35
440 0.39
441 0.4
442 0.41
443 0.34
444 0.27
445 0.24
446 0.19
447 0.19
448 0.16
449 0.14
450 0.12
451 0.14
452 0.13
453 0.15
454 0.16
455 0.18
456 0.18
457 0.2
458 0.21
459 0.22
460 0.28
461 0.3
462 0.31
463 0.35
464 0.34
465 0.37
466 0.39
467 0.37
468 0.29
469 0.27
470 0.27
471 0.24
472 0.24
473 0.21
474 0.17
475 0.16
476 0.22
477 0.2
478 0.19
479 0.18
480 0.15
481 0.17
482 0.19
483 0.23
484 0.19
485 0.18
486 0.17
487 0.17
488 0.2
489 0.18
490 0.2
491 0.16
492 0.18
493 0.19
494 0.2
495 0.19
496 0.17
497 0.18
498 0.18
499 0.19
500 0.18
501 0.19
502 0.21
503 0.22
504 0.26
505 0.33
506 0.34
507 0.34
508 0.34
509 0.31
510 0.27
511 0.25
512 0.2
513 0.13
514 0.07
515 0.08
516 0.07
517 0.09
518 0.11
519 0.12
520 0.15
521 0.19
522 0.22
523 0.23
524 0.23
525 0.26
526 0.26
527 0.33
528 0.36
529 0.36
530 0.35
531 0.35
532 0.34
533 0.33
534 0.34
535 0.27
536 0.23
537 0.24
538 0.22
539 0.27
540 0.28
541 0.26
542 0.27
543 0.26
544 0.24
545 0.23
546 0.22
547 0.16
548 0.18
549 0.18
550 0.16
551 0.16
552 0.17
553 0.16
554 0.17
555 0.17
556 0.14
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.09
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.05
568 0.05
569 0.06
570 0.05
571 0.04
572 0.07
573 0.13
574 0.2
575 0.24
576 0.25
577 0.26
578 0.32
579 0.37
580 0.43
581 0.4
582 0.35
583 0.38
584 0.4
585 0.45
586 0.42
587 0.38
588 0.35
589 0.36
590 0.39
591 0.37
592 0.41
593 0.44
594 0.5
595 0.56
596 0.59
597 0.61
598 0.64
599 0.65
600 0.64
601 0.56
602 0.5
603 0.46