Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4ASY3

Protein Details
Accession D4ASY3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-241SPLGGGRPGRVKRKKMRAAEKGDDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-233GRPGRVKRKKMRA
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 12.5, nucl 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR005710  Ribosomal_S4/S9_euk/arc  
IPR001912  Ribosomal_S4/S9_N  
IPR018079  Ribosomal_S4_CS  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG abe:ARB_07347  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00632  RIBOSOMAL_S4  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MEEIEGAGCVANMSVLIAGAHTPRPTRSHVVVSIELFSKLRFGYSAGEKSSRLNDSELKLVGEYGLRNKREVWRVNLTLSKIRRAARYGFFLEFMVYVISGGGALIRSGCSELLTLDEKDPKRLFEGNALIRRLVRVGVLDESRMKLDYVLALKIEDFLERRLQTCVYRLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVGKQIVNVPSFVVRLDSQKHIDFSLTSPLGGGRPGRVKRKKMRAAEKGDDEEEEEDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.06
6 0.08
7 0.11
8 0.12
9 0.14
10 0.17
11 0.21
12 0.27
13 0.32
14 0.35
15 0.38
16 0.4
17 0.44
18 0.44
19 0.42
20 0.39
21 0.33
22 0.3
23 0.24
24 0.2
25 0.16
26 0.13
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.15
31 0.21
32 0.25
33 0.26
34 0.29
35 0.28
36 0.3
37 0.34
38 0.31
39 0.26
40 0.25
41 0.26
42 0.26
43 0.3
44 0.28
45 0.23
46 0.21
47 0.2
48 0.17
49 0.14
50 0.13
51 0.17
52 0.24
53 0.24
54 0.25
55 0.28
56 0.34
57 0.41
58 0.45
59 0.43
60 0.44
61 0.45
62 0.48
63 0.49
64 0.45
65 0.43
66 0.4
67 0.38
68 0.35
69 0.35
70 0.35
71 0.35
72 0.37
73 0.34
74 0.38
75 0.36
76 0.32
77 0.3
78 0.27
79 0.24
80 0.18
81 0.15
82 0.09
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.02
91 0.02
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.07
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.16
105 0.16
106 0.21
107 0.22
108 0.2
109 0.21
110 0.22
111 0.22
112 0.21
113 0.27
114 0.27
115 0.32
116 0.32
117 0.29
118 0.27
119 0.27
120 0.22
121 0.16
122 0.1
123 0.06
124 0.07
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.15
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.19
151 0.19
152 0.21
153 0.23
154 0.18
155 0.2
156 0.2
157 0.21
158 0.25
159 0.25
160 0.23
161 0.25
162 0.29
163 0.27
164 0.27
165 0.26
166 0.21
167 0.3
168 0.39
169 0.38
170 0.41
171 0.46
172 0.48
173 0.56
174 0.59
175 0.54
176 0.53
177 0.55
178 0.54
179 0.52
180 0.55
181 0.5
182 0.47
183 0.43
184 0.35
185 0.28
186 0.22
187 0.18
188 0.16
189 0.12
190 0.15
191 0.19
192 0.23
193 0.26
194 0.28
195 0.3
196 0.27
197 0.27
198 0.24
199 0.22
200 0.27
201 0.23
202 0.2
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.2
207 0.19
208 0.15
209 0.24
210 0.31
211 0.42
212 0.5
213 0.6
214 0.68
215 0.78
216 0.83
217 0.84
218 0.88
219 0.88
220 0.88
221 0.87
222 0.84
223 0.79
224 0.7
225 0.61
226 0.52
227 0.43