FuNGI

D4APJ3

Protein Details

Accession

D4APJ3

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MASRKEDKKERKQKKEKKPAAEGDGTT	Basic
397-424	ATPTPSPPKPTPKSSKRRQSKAAAPAPA	Hydrophilic
436-467	TPTPATKKSSPEKKEKKSKSKDKDRRASAANA	Hydrophilic
473-496	ASPVPEPPKSEKKARKKRKSAVDE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-19	RKEDKKERKQKKEKKP
404-492	PKPTPKSSKRRQSKAAAPAPAPAPAPAPPVIETPTPATKKSSPEKKEKKSKSKDKDRRASAANAAAAEVASPVPEPPKSEKKARKKRKS

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
KEGG	abe:ARB_06161 -
Pfam	View protein in Pfam PF00505 HMG_box
PROSITE	View protein in PROSITE PS50118 HMG_BOX_2

Amino Acid Sequences

MASRKEDKKERKQKKEKKPAAEGDGTTTLVVSIDDFTRTRDSPTPPVCQSVSLSVLDATPPAPCLVLYYYYYTLSVLLRTSNTPLRCQTASAAASPAAPLDLVQAIALLTYRINSTAQDLFLGAQQPGLFSAELTCEQVIVGLAALQSAVSDLSRAYINHANTVLNRGPSSIDIGGLNSLLENGLFPSSVTAGGGADADGGVSAAEGAGRAASPGARSVAGTKRKRVHDPNAPKRALTAYFLYMKHERANIAAELGANARPKEVADEGTRRWGRMPPQEKQVDHLSLSLSLYILSYPGKWKDLYAQNLAVYNEEMSAYKASLPPGHKVDSTVPATPKPAKAAKTSKSSKPSTKEAARHEDDHDAAAEQQLQQAVREATTEDTSSSESAGSSESEAEATPTPSPPKPTPKSSKRRQSKAAAPAPAPAPAPAPPVIETPTPATKKSSPEKKEKKSKSKDKDRRASAANAAAAEVASPVPEPPKSEKKARKKRKSAVDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.95
2	0.96
3	0.95
4	0.94
5	0.93
6	0.9
7	0.87
8	0.83
9	0.73
10	0.67
11	0.6
12	0.5
13	0.39
14	0.3
15	0.22
16	0.15
17	0.14
18	0.08
19	0.08
20	0.08
21	0.11
22	0.12
23	0.15
24	0.2
25	0.21
26	0.25
27	0.3
28	0.35
29	0.42
30	0.47
31	0.51
32	0.48
33	0.52
34	0.48
35	0.43
36	0.4
37	0.34
38	0.31
39	0.24
40	0.23
41	0.19
42	0.18
43	0.16
44	0.14
45	0.1
46	0.08
47	0.09
48	0.08
49	0.08
50	0.07
51	0.1
52	0.11
53	0.14
54	0.15
55	0.19
56	0.2
57	0.21
58	0.21
59	0.19
60	0.18
61	0.16
62	0.15
63	0.11
64	0.11
65	0.13
66	0.14
67	0.18
68	0.23
69	0.25
70	0.28
71	0.3
72	0.33
73	0.32
74	0.32
75	0.29
76	0.3
77	0.3
78	0.27
79	0.25
80	0.2
81	0.2
82	0.18
83	0.16
84	0.09
85	0.07
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.05
93	0.06
94	0.06
95	0.04
96	0.04
97	0.05
98	0.05
99	0.06
100	0.07
101	0.08
102	0.11
103	0.13
104	0.13
105	0.13
106	0.13
107	0.12
108	0.14
109	0.15
110	0.11
111	0.1
112	0.1
113	0.09
114	0.1
115	0.11
116	0.09
117	0.07
118	0.08
119	0.09
120	0.1
121	0.11
122	0.1
123	0.09
124	0.08
125	0.09
126	0.08
127	0.06
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.03
134	0.03
135	0.03
136	0.04
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.05
141	0.06
142	0.07
143	0.11
144	0.16
145	0.16
146	0.19
147	0.2
148	0.2
149	0.19
150	0.24
151	0.22
152	0.18
153	0.18
154	0.16
155	0.16
156	0.15
157	0.18
158	0.13
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.09
164	0.09
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.04
169	0.03
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.04
180	0.05
181	0.05
182	0.04
183	0.03
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.02
189	0.02
190	0.02
191	0.02
192	0.02
193	0.02
194	0.02
195	0.02
196	0.02
197	0.02
198	0.03
199	0.03
200	0.04
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.1
206	0.17
207	0.27
208	0.29
209	0.35
210	0.41
211	0.45
212	0.53
213	0.57
214	0.57
215	0.58
216	0.67
217	0.71
218	0.73
219	0.69
220	0.61
221	0.55
222	0.5
223	0.4
224	0.31
225	0.22
226	0.15
227	0.19
228	0.2
229	0.22
230	0.21
231	0.22
232	0.21
233	0.2
234	0.18
235	0.14
236	0.16
237	0.13
238	0.11
239	0.1
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.1
250	0.1
251	0.11
252	0.13
253	0.17
254	0.17
255	0.27
256	0.27
257	0.25
258	0.26
259	0.26
260	0.28
261	0.35
262	0.4
263	0.35
264	0.44
265	0.49
266	0.48
267	0.48
268	0.47
269	0.39
270	0.33
271	0.3
272	0.21
273	0.17
274	0.17
275	0.13
276	0.08
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.09
284	0.1
285	0.12
286	0.12
287	0.13
288	0.2
289	0.27
290	0.3
291	0.31
292	0.31
293	0.3
294	0.32
295	0.32
296	0.24
297	0.18
298	0.14
299	0.1
300	0.09
301	0.08
302	0.07
303	0.08
304	0.07
305	0.08
306	0.1
307	0.11
308	0.15
309	0.17
310	0.2
311	0.23
312	0.25
313	0.24
314	0.24
315	0.26
316	0.28
317	0.29
318	0.28
319	0.27
320	0.26
321	0.3
322	0.31
323	0.29
324	0.28
325	0.3
326	0.29
327	0.35
328	0.43
329	0.44
330	0.51
331	0.55
332	0.57
333	0.61
334	0.64
335	0.64
336	0.61
337	0.62
338	0.61
339	0.63
340	0.62
341	0.62
342	0.64
343	0.61
344	0.58
345	0.53
346	0.49
347	0.41
348	0.35
349	0.29
350	0.2
351	0.16
352	0.14
353	0.13
354	0.09
355	0.1
356	0.11
357	0.11
358	0.11
359	0.14
360	0.14
361	0.12
362	0.13
363	0.12
364	0.13
365	0.14
366	0.14
367	0.11
368	0.12
369	0.13
370	0.13
371	0.12
372	0.1
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.14
387	0.18
388	0.2
389	0.26
390	0.31
391	0.4
392	0.45
393	0.54
394	0.62
395	0.69
396	0.77
397	0.82
398	0.86
399	0.86
400	0.89
401	0.88
402	0.86
403	0.84
404	0.84
405	0.81
406	0.76
407	0.66
408	0.62
409	0.54
410	0.47
411	0.38
412	0.28
413	0.22
414	0.18
415	0.21
416	0.18
417	0.19
418	0.18
419	0.19
420	0.22
421	0.21
422	0.21
423	0.23
424	0.3
425	0.31
426	0.3
427	0.34
428	0.36
429	0.43
430	0.52
431	0.57
432	0.56
433	0.65
434	0.75
435	0.8
436	0.87
437	0.89
438	0.9
439	0.91
440	0.94
441	0.94
442	0.95
443	0.95
444	0.95
445	0.94
446	0.91
447	0.87
448	0.82
449	0.76
450	0.71
451	0.67
452	0.58
453	0.47
454	0.4
455	0.32
456	0.26
457	0.2
458	0.14
459	0.08
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.11
464	0.12
465	0.17
466	0.25
467	0.35
468	0.41
469	0.52
470	0.61
471	0.69
472	0.79
473	0.86
474	0.89
475	0.9
476	0.94

D4APJ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer