FuNGI

D4B3N3

Protein Details

Accession

D4B3N3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
98-128	GKAQQHKGRGREPQRKKPKKEKSKAEGGADE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
102-122	QHKGRGREPQRKKPKKEKSKA

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 11.833, nucl 10, mito_nucl 6.833, cyto_pero 6.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR030390 MeTrfase_TrmA_AS IPR030391 MeTrfase_TrmA_CS IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf IPR002792 TRAM_dom IPR025795 tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase IPR010280 U5_MeTrfase_fam
Gene Ontology	GO:0030697 F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity
KEGG	abe:ARB_03072 -
Pfam	View protein in Pfam PF05958 tRNA_U5-meth_tr
PROSITE	View protein in PROSITE PS51687 SAM_MT_RNA_M5U PS51622 SAM_MT_RNA_M5U_2 PS50926 TRAM PS01230 TRMA_1 PS01231 TRMA_2

Amino Acid Sequences

MVTNLDILVGKESLKVKLIKVKVKSVSFLRKTILQQHCFNFHSRGMFLRPLNVRITSFSRFRALRTPATQLTTPSVHQYSTVPRAIKIVGGFDMPGQGKAQQHKGRGREPQRKKPKKEKSKAEGGADEVVELDVKNLLENNKRKSEENGEKHTDAETSVSVVHEGKKDSPFPETEVTVSELSSTGEGLALSPNGDHVYIVPFALPGETARVRIYKTIKPKSYSLTDLVEVLKPSEQRDDSLIKCQYFGKCSGCQLQMIPYQDQLQHKKRIIEKAYANFSGLLPELIPAIGDTMGSPMQYGYRTKLTPHFTQPARNRRQEHSSDAPEIPPIGFMMKGRRKVMDIEDCPLGTDIVRSGLKNERKRVAENLQQYPYGGTLLVRESTKRVERNKENEALPSTDKVIRTTFPEYVEEKTYITDQNGISVEYVEDYQFHNIAGTFFQNNNSILPSFTGYVRDNALHPEPKPDATPAESAAAAKSNPKLKYLLDAYCGSGLFTIVLSGTFRSSLGIDVAASSIKCARENAKLSNVPNTGFAAADAAALFKDVPYPADQTLLVIDPPRKGCDTNFLNQLLAYGPTRVLYVSCNVHTQARDVGVLVEGKNGVRYDIESIRGFDFFPQTSHVESVAVLTKAIETKAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.26
3	0.28
4	0.36
5	0.44
6	0.47
7	0.5
8	0.57
9	0.6
10	0.6
11	0.62
12	0.62
13	0.65
14	0.61
15	0.59
16	0.54
17	0.52
18	0.54
19	0.58
20	0.59
21	0.54
22	0.57
23	0.58
24	0.62
25	0.57
26	0.57
27	0.51
28	0.44
29	0.42
30	0.36
31	0.35
32	0.33
33	0.38
34	0.35
35	0.39
36	0.39
37	0.39
38	0.41
39	0.39
40	0.35
41	0.33
42	0.38
43	0.35
44	0.35
45	0.34
46	0.38
47	0.36
48	0.38
49	0.42
50	0.43
51	0.45
52	0.46
53	0.5
54	0.47
55	0.51
56	0.49
57	0.42
58	0.42
59	0.36
60	0.33
61	0.32
62	0.29
63	0.25
64	0.24
65	0.26
66	0.28
67	0.32
68	0.36
69	0.31
70	0.3
71	0.33
72	0.32
73	0.31
74	0.25
75	0.21
76	0.16
77	0.16
78	0.16
79	0.13
80	0.18
81	0.16
82	0.16
83	0.14
84	0.17
85	0.21
86	0.26
87	0.36
88	0.36
89	0.44
90	0.5
91	0.56
92	0.6
93	0.65
94	0.71
95	0.72
96	0.77
97	0.79
98	0.84
99	0.88
100	0.91
101	0.92
102	0.92
103	0.93
104	0.93
105	0.93
106	0.9
107	0.9
108	0.87
109	0.81
110	0.72
111	0.63
112	0.56
113	0.44
114	0.36
115	0.25
116	0.18
117	0.13
118	0.1
119	0.08
120	0.06
121	0.06
122	0.07
123	0.09
124	0.14
125	0.22
126	0.29
127	0.36
128	0.42
129	0.44
130	0.46
131	0.49
132	0.55
133	0.57
134	0.59
135	0.6
136	0.59
137	0.57
138	0.56
139	0.51
140	0.41
141	0.3
142	0.24
143	0.15
144	0.1
145	0.1
146	0.09
147	0.1
148	0.1
149	0.13
150	0.14
151	0.16
152	0.19
153	0.22
154	0.25
155	0.25
156	0.27
157	0.26
158	0.27
159	0.27
160	0.24
161	0.21
162	0.2
163	0.21
164	0.18
165	0.17
166	0.13
167	0.11
168	0.1
169	0.1
170	0.08
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.04
193	0.09
194	0.1
195	0.11
196	0.12
197	0.14
198	0.15
199	0.2
200	0.25
201	0.26
202	0.36
203	0.44
204	0.48
205	0.5
206	0.52
207	0.51
208	0.51
209	0.48
210	0.41
211	0.34
212	0.29
213	0.27
214	0.25
215	0.22
216	0.18
217	0.15
218	0.14
219	0.13
220	0.14
221	0.17
222	0.17
223	0.16
224	0.2
225	0.23
226	0.22
227	0.29
228	0.32
229	0.26
230	0.27
231	0.3
232	0.28
233	0.26
234	0.28
235	0.25
236	0.23
237	0.25
238	0.3
239	0.27
240	0.26
241	0.24
242	0.25
243	0.24
244	0.26
245	0.24
246	0.19
247	0.21
248	0.24
249	0.29
250	0.33
251	0.35
252	0.4
253	0.42
254	0.46
255	0.49
256	0.54
257	0.52
258	0.5
259	0.49
260	0.48
261	0.5
262	0.44
263	0.4
264	0.32
265	0.28
266	0.22
267	0.17
268	0.11
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.03
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.03
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.06
285	0.07
286	0.08
287	0.1
288	0.13
289	0.14
290	0.15
291	0.22
292	0.26
293	0.28
294	0.32
295	0.36
296	0.34
297	0.43
298	0.49
299	0.53
300	0.56
301	0.59
302	0.58
303	0.55
304	0.61
305	0.55
306	0.53
307	0.49
308	0.45
309	0.41
310	0.38
311	0.35
312	0.28
313	0.25
314	0.18
315	0.12
316	0.08
317	0.06
318	0.05
319	0.06
320	0.15
321	0.2
322	0.24
323	0.25
324	0.26
325	0.27
326	0.29
327	0.34
328	0.34
329	0.3
330	0.28
331	0.28
332	0.27
333	0.26
334	0.24
335	0.18
336	0.09
337	0.08
338	0.05
339	0.08
340	0.09
341	0.08
342	0.11
343	0.19
344	0.27
345	0.32
346	0.38
347	0.4
348	0.42
349	0.45
350	0.48
351	0.47
352	0.46
353	0.47
354	0.48
355	0.43
356	0.41
357	0.39
358	0.33
359	0.26
360	0.19
361	0.13
362	0.07
363	0.06
364	0.07
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.15
370	0.21
371	0.26
372	0.32
373	0.39
374	0.48
375	0.54
376	0.58
377	0.58
378	0.54
379	0.51
380	0.47
381	0.4
382	0.33
383	0.28
384	0.24
385	0.22
386	0.22
387	0.2
388	0.19
389	0.17
390	0.2
391	0.23
392	0.22
393	0.21
394	0.24
395	0.24
396	0.25
397	0.27
398	0.23
399	0.19
400	0.18
401	0.18
402	0.16
403	0.15
404	0.17
405	0.14
406	0.17
407	0.17
408	0.16
409	0.14
410	0.13
411	0.13
412	0.09
413	0.1
414	0.06
415	0.07
416	0.07
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.11
427	0.13
428	0.15
429	0.15
430	0.15
431	0.16
432	0.14
433	0.12
434	0.13
435	0.13
436	0.11
437	0.11
438	0.15
439	0.14
440	0.15
441	0.17
442	0.16
443	0.15
444	0.19
445	0.23
446	0.23
447	0.22
448	0.27
449	0.27
450	0.27
451	0.28
452	0.25
453	0.23
454	0.22
455	0.23
456	0.19
457	0.19
458	0.18
459	0.16
460	0.15
461	0.14
462	0.12
463	0.13
464	0.16
465	0.22
466	0.22
467	0.24
468	0.26
469	0.24
470	0.31
471	0.33
472	0.31
473	0.29
474	0.29
475	0.28
476	0.28
477	0.27
478	0.2
479	0.15
480	0.13
481	0.09
482	0.07
483	0.06
484	0.04
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.08
498	0.08
499	0.09
500	0.08
501	0.08
502	0.11
503	0.12
504	0.13
505	0.15
506	0.19
507	0.26
508	0.31
509	0.35
510	0.41
511	0.45
512	0.45
513	0.51
514	0.49
515	0.41
516	0.38
517	0.34
518	0.26
519	0.21
520	0.19
521	0.12
522	0.11
523	0.1
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.05
530	0.07
531	0.07
532	0.09
533	0.11
534	0.15
535	0.15
536	0.17
537	0.17
538	0.15
539	0.16
540	0.16
541	0.14
542	0.15
543	0.17
544	0.2
545	0.23
546	0.26
547	0.26
548	0.27
549	0.28
550	0.34
551	0.37
552	0.38
553	0.42
554	0.4
555	0.38
556	0.36
557	0.35
558	0.26
559	0.23
560	0.18
561	0.12
562	0.12
563	0.11
564	0.12
565	0.12
566	0.11
567	0.11
568	0.15
569	0.19
570	0.21
571	0.23
572	0.25
573	0.29
574	0.29
575	0.29
576	0.28
577	0.25
578	0.24
579	0.21
580	0.2
581	0.18
582	0.2
583	0.17
584	0.15
585	0.15
586	0.15
587	0.18
588	0.17
589	0.16
590	0.14
591	0.15
592	0.19
593	0.21
594	0.26
595	0.24
596	0.27
597	0.28
598	0.27
599	0.26
600	0.23
601	0.25
602	0.21
603	0.21
604	0.22
605	0.23
606	0.25
607	0.26
608	0.23
609	0.19
610	0.18
611	0.2
612	0.21
613	0.19
614	0.16
615	0.15
616	0.17
617	0.18

D4B3N3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer