Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4ATJ4

Protein Details
Accession D4ATJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-89DSDLKQERQRPQTARQRKKRIKTRTGETEKKRKSYKTBasic
123-143SEEDTERKRREERKTQKMAEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-86QTARQRKKRIKTRTGETEKKRKS
Subcellular Location(s) extr 14, nucl 4, mito 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006636  STI1_HS-bd  
IPR015940  UBA  
IPR009060  UBA-like_sf  
IPR015496  Ubiquilin  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
KEGG abe:ARB_07558  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00627  UBA  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50030  UBA  
PS50053  UBIQUITIN_2  
CDD cd14324  UBA_Dsk2p_like  
cd16106  Ubl_Dsk2p_like  
Amino Acid Sequences MTVDRAVALALAVCWLSLEVGVFSAVVEVSCLAFFLRWRSRTVEDKETSSRVDSDLKQERQRPQTARQRKKRIKTRTGETEKKRKSYKTPETGAEAAVIEASEASRDTPRDTARDTARATEDSEEDTERKRREERKTQKMAEEDAPFTFHVKSSAEPKFSLTLKPSSTVAEIKQILAGEEYANVPPERQRLIYSGRVLKDTDTLAAHKVKEGHTIHLVKSSAPAGSSSSASGSANTTAASGSGSNTTASSAAGRGAQSTPSGAAGVPTNLAAGTGNSMLAGLTGARYAGFSQLPGAGMFGPDGGMGPLPDTDQILSMMENPQFQSTMNEALQNPQIIDMMIQQNPMLRDVPNARQILQSPEFRRMLTDPNMLRYMTQMQRAMGQGGGGGQSAFPAPGVTNTTQRDASSQDNSTTSSSNNNNNNNQTQPQMPPFNPFLAMPGAGGNPFSFLAGMQQPPAGAASGDAGTAGPNTTNNSGSSNSNSNQQQQQQQHQPNPFASLFNPALLGQLPNADGQPGQPIPNPFMQNPALFSQLMQAMGGGPGADANSSANPNPNASNPLLHSLFGGQPPQPPDNRPPEERYAEQLRQLNDMGFFEFDRNIEALRRSGGSVQGAIEYLLNSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.06
3 0.06
4 0.05
5 0.06
6 0.05
7 0.06
8 0.07
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.07
21 0.09
22 0.18
23 0.26
24 0.27
25 0.31
26 0.36
27 0.41
28 0.5
29 0.55
30 0.56
31 0.51
32 0.55
33 0.58
34 0.55
35 0.52
36 0.45
37 0.39
38 0.32
39 0.35
40 0.31
41 0.36
42 0.43
43 0.48
44 0.53
45 0.59
46 0.65
47 0.67
48 0.74
49 0.7
50 0.7
51 0.74
52 0.78
53 0.82
54 0.84
55 0.87
56 0.88
57 0.93
58 0.93
59 0.93
60 0.92
61 0.91
62 0.9
63 0.89
64 0.89
65 0.89
66 0.88
67 0.88
68 0.85
69 0.85
70 0.82
71 0.77
72 0.77
73 0.79
74 0.8
75 0.78
76 0.76
77 0.72
78 0.71
79 0.65
80 0.55
81 0.45
82 0.34
83 0.24
84 0.18
85 0.14
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.09
93 0.11
94 0.13
95 0.18
96 0.22
97 0.25
98 0.28
99 0.33
100 0.35
101 0.4
102 0.39
103 0.38
104 0.39
105 0.36
106 0.35
107 0.3
108 0.27
109 0.23
110 0.23
111 0.21
112 0.2
113 0.24
114 0.29
115 0.29
116 0.32
117 0.38
118 0.45
119 0.53
120 0.62
121 0.68
122 0.72
123 0.8
124 0.81
125 0.79
126 0.74
127 0.68
128 0.63
129 0.57
130 0.47
131 0.37
132 0.34
133 0.28
134 0.26
135 0.21
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.14
140 0.21
141 0.26
142 0.27
143 0.27
144 0.28
145 0.31
146 0.31
147 0.33
148 0.28
149 0.28
150 0.27
151 0.28
152 0.27
153 0.24
154 0.25
155 0.24
156 0.21
157 0.23
158 0.23
159 0.21
160 0.22
161 0.2
162 0.18
163 0.16
164 0.15
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.18
177 0.19
178 0.25
179 0.3
180 0.33
181 0.35
182 0.34
183 0.35
184 0.34
185 0.31
186 0.28
187 0.23
188 0.19
189 0.15
190 0.15
191 0.16
192 0.19
193 0.18
194 0.18
195 0.2
196 0.19
197 0.26
198 0.26
199 0.26
200 0.3
201 0.32
202 0.31
203 0.33
204 0.32
205 0.24
206 0.24
207 0.22
208 0.15
209 0.13
210 0.13
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.09
313 0.12
314 0.12
315 0.14
316 0.13
317 0.15
318 0.17
319 0.15
320 0.13
321 0.1
322 0.1
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.1
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.12
334 0.09
335 0.12
336 0.15
337 0.19
338 0.24
339 0.24
340 0.24
341 0.25
342 0.26
343 0.29
344 0.29
345 0.32
346 0.27
347 0.32
348 0.32
349 0.31
350 0.32
351 0.27
352 0.28
353 0.26
354 0.31
355 0.26
356 0.29
357 0.3
358 0.28
359 0.26
360 0.23
361 0.25
362 0.21
363 0.24
364 0.22
365 0.21
366 0.23
367 0.24
368 0.23
369 0.16
370 0.13
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.06
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.09
385 0.1
386 0.16
387 0.18
388 0.2
389 0.21
390 0.21
391 0.21
392 0.2
393 0.23
394 0.21
395 0.21
396 0.2
397 0.2
398 0.22
399 0.22
400 0.2
401 0.17
402 0.19
403 0.21
404 0.27
405 0.33
406 0.38
407 0.41
408 0.45
409 0.47
410 0.44
411 0.42
412 0.36
413 0.32
414 0.3
415 0.3
416 0.31
417 0.29
418 0.31
419 0.31
420 0.3
421 0.28
422 0.24
423 0.21
424 0.17
425 0.16
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.1
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.09
438 0.11
439 0.12
440 0.11
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.09
446 0.06
447 0.05
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.06
458 0.09
459 0.11
460 0.12
461 0.13
462 0.15
463 0.17
464 0.18
465 0.21
466 0.24
467 0.23
468 0.29
469 0.3
470 0.33
471 0.37
472 0.4
473 0.45
474 0.46
475 0.54
476 0.57
477 0.63
478 0.65
479 0.64
480 0.63
481 0.55
482 0.55
483 0.46
484 0.38
485 0.3
486 0.3
487 0.25
488 0.22
489 0.22
490 0.16
491 0.16
492 0.16
493 0.15
494 0.09
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.14
503 0.14
504 0.15
505 0.18
506 0.2
507 0.23
508 0.3
509 0.33
510 0.27
511 0.32
512 0.32
513 0.3
514 0.31
515 0.29
516 0.25
517 0.22
518 0.21
519 0.19
520 0.18
521 0.17
522 0.14
523 0.12
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.07
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.08
535 0.11
536 0.12
537 0.17
538 0.18
539 0.21
540 0.22
541 0.24
542 0.26
543 0.25
544 0.28
545 0.24
546 0.3
547 0.28
548 0.26
549 0.25
550 0.23
551 0.24
552 0.23
553 0.24
554 0.19
555 0.23
556 0.29
557 0.33
558 0.34
559 0.36
560 0.42
561 0.5
562 0.55
563 0.56
564 0.57
565 0.6
566 0.63
567 0.6
568 0.59
569 0.57
570 0.54
571 0.55
572 0.54
573 0.47
574 0.44
575 0.43
576 0.38
577 0.31
578 0.29
579 0.23
580 0.19
581 0.19
582 0.17
583 0.17
584 0.15
585 0.16
586 0.15
587 0.15
588 0.18
589 0.19
590 0.2
591 0.21
592 0.22
593 0.21
594 0.23
595 0.26
596 0.25
597 0.24
598 0.23
599 0.21
600 0.2
601 0.18
602 0.17