Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B139

Protein Details
Accession D4B139    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-48LDDWVLKRRGHRIRQNYSWVLEHydrophilic
991-1014AAKVTRPRSRSRSKSPSSSTNKPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9, cysk 7, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
IPR047151  RNZ2-like  
IPR027794  tRNase_Z_dom  
Gene Ontology GO:0042781  F:3'-tRNA processing endoribonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG abe:ARB_02168  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13691  Lactamase_B_4  
CDD cd07718  RNaseZ_ELAC1_ELAC2-C-term-like_MBL-fold  
Amino Acid Sequences MPPLGRYKDFNPQVAPAIEGFNLLISLDDWVLKRRGHRIRQNYSWVLEDRRLSQYSSVKQERPPTGADRMKSFIQFVTAPTSDTPGTTLFLHYDDKRYFFGNLSEGTQRACIENNVRLSKLSEVFLTGKTTWANNGGMLGMLLTLSDTMASASGAMVEAESRKIKNLEERAKAAVRQKDSDELMARVKRRKLELEALPEFHGQRAISLYGGPNLTHTLATGRTFVCRTGVPIEIREFGCLGCEERDATIDISKPAWSDDHIKVWALPTYPSSSPRLQPGKRTLDDFEGGGRAGAAATKAAREKDLVTRQKIVLDMFNSQWRLDTLVETPLAEVSLPATLFIRDKDTGEVKPYEGPKPGDGEALPNINVLVRQPWPGAMVESLPATTPSDCAVSYIVRGHDSRGKFDRKRAESLNIADKSDFRRLASGETVISADGKTITPDMVLGETRPGKGFAVLELPSVDYIQSIINRKEWDNAEVMKGMEVFIWILGPGVGGHPLLQEFVTKMSKYKHIVSSPDYCADNYGFPAVSTATLELSAIDGDRYQKTFYNGEAMLPVSAFAAADTKTSVSIAQPNLTIDLEPSVKLTASPTPPSKPIKMPRRNSYSRVMGEILSQPGVQKRIEKLKASIPNGDAEIIALGTGSSCPSRYRNVSGTLLRVPGHGNYLFDAGEGTLGQLKRTFGPDELKEVLRDLRVIWISHLHADHHLGTVSVIKAWHEAVYGPLSSSPSYMDITEEDVPRILKEKRLYVVSAQHMLQWMAEYTNVENYGYDKVVPLSASSFEHPDGKTDYTYTIHRRQRNGAAIPDSDGKYLGTRLKFDDENSPLTELLKQGTGLDAILTTPVSHCQGAKAVSLIFPTGFKVSYSGDCRPSTRFIEMGRGSTVLIHEATFDDNMLSDAVAKRHSTVSEAMTVGLRMEAKVIVMTHFSQRYRKMPDIANAKEVHIQPPKGWNNKGNTAEDKKPRQAPSVVRDIPTSEDVEEDYTMAEAEESGAAKVTRPRSRSRSKSPSSSTNKPPIVIAFDYMRLRVADAIQAEAHQPLLTKFLETTSDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.3
4 0.27
5 0.22
6 0.2
7 0.17
8 0.11
9 0.11
10 0.09
11 0.08
12 0.06
13 0.07
14 0.07
15 0.1
16 0.11
17 0.16
18 0.2
19 0.22
20 0.27
21 0.36
22 0.46
23 0.54
24 0.63
25 0.69
26 0.75
27 0.81
28 0.86
29 0.81
30 0.73
31 0.68
32 0.62
33 0.56
34 0.51
35 0.46
36 0.41
37 0.42
38 0.41
39 0.37
40 0.39
41 0.43
42 0.45
43 0.52
44 0.55
45 0.53
46 0.57
47 0.65
48 0.63
49 0.58
50 0.56
51 0.51
52 0.53
53 0.55
54 0.52
55 0.48
56 0.47
57 0.47
58 0.43
59 0.4
60 0.3
61 0.28
62 0.26
63 0.23
64 0.26
65 0.23
66 0.23
67 0.22
68 0.25
69 0.21
70 0.2
71 0.2
72 0.14
73 0.16
74 0.15
75 0.16
76 0.13
77 0.16
78 0.21
79 0.21
80 0.28
81 0.28
82 0.3
83 0.3
84 0.31
85 0.31
86 0.27
87 0.28
88 0.24
89 0.24
90 0.24
91 0.26
92 0.24
93 0.24
94 0.24
95 0.21
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.22
100 0.28
101 0.35
102 0.36
103 0.36
104 0.36
105 0.36
106 0.37
107 0.34
108 0.3
109 0.22
110 0.22
111 0.24
112 0.24
113 0.27
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.21
120 0.2
121 0.16
122 0.16
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.09
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.1
147 0.13
148 0.13
149 0.17
150 0.18
151 0.21
152 0.3
153 0.39
154 0.45
155 0.48
156 0.5
157 0.52
158 0.54
159 0.55
160 0.54
161 0.51
162 0.46
163 0.44
164 0.43
165 0.44
166 0.42
167 0.43
168 0.38
169 0.33
170 0.36
171 0.37
172 0.4
173 0.42
174 0.45
175 0.45
176 0.47
177 0.51
178 0.5
179 0.54
180 0.55
181 0.57
182 0.56
183 0.53
184 0.5
185 0.47
186 0.41
187 0.32
188 0.28
189 0.19
190 0.16
191 0.16
192 0.14
193 0.12
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.14
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.13
206 0.14
207 0.16
208 0.14
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.15
214 0.17
215 0.18
216 0.22
217 0.21
218 0.23
219 0.25
220 0.27
221 0.27
222 0.25
223 0.23
224 0.17
225 0.17
226 0.15
227 0.14
228 0.11
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.18
245 0.19
246 0.23
247 0.24
248 0.24
249 0.23
250 0.24
251 0.24
252 0.19
253 0.17
254 0.14
255 0.18
256 0.2
257 0.22
258 0.25
259 0.26
260 0.27
261 0.36
262 0.43
263 0.41
264 0.47
265 0.53
266 0.58
267 0.56
268 0.57
269 0.5
270 0.45
271 0.43
272 0.36
273 0.28
274 0.2
275 0.18
276 0.14
277 0.12
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.08
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.15
290 0.23
291 0.33
292 0.38
293 0.39
294 0.42
295 0.42
296 0.43
297 0.42
298 0.34
299 0.28
300 0.23
301 0.22
302 0.19
303 0.23
304 0.23
305 0.21
306 0.21
307 0.17
308 0.18
309 0.16
310 0.16
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.11
317 0.1
318 0.08
319 0.07
320 0.04
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.13
329 0.12
330 0.13
331 0.16
332 0.19
333 0.19
334 0.23
335 0.23
336 0.2
337 0.24
338 0.26
339 0.25
340 0.27
341 0.27
342 0.25
343 0.27
344 0.27
345 0.24
346 0.21
347 0.2
348 0.18
349 0.18
350 0.16
351 0.13
352 0.12
353 0.1
354 0.1
355 0.08
356 0.09
357 0.08
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.13
385 0.14
386 0.19
387 0.2
388 0.24
389 0.29
390 0.37
391 0.38
392 0.45
393 0.52
394 0.5
395 0.55
396 0.53
397 0.51
398 0.46
399 0.47
400 0.49
401 0.41
402 0.37
403 0.32
404 0.3
405 0.3
406 0.31
407 0.28
408 0.19
409 0.2
410 0.2
411 0.22
412 0.22
413 0.19
414 0.13
415 0.13
416 0.12
417 0.1
418 0.1
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.12
439 0.12
440 0.09
441 0.11
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.04
450 0.05
451 0.06
452 0.09
453 0.12
454 0.13
455 0.16
456 0.17
457 0.18
458 0.22
459 0.22
460 0.21
461 0.2
462 0.2
463 0.18
464 0.18
465 0.17
466 0.12
467 0.11
468 0.1
469 0.07
470 0.06
471 0.05
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.07
490 0.09
491 0.09
492 0.11
493 0.13
494 0.18
495 0.21
496 0.25
497 0.28
498 0.28
499 0.31
500 0.33
501 0.37
502 0.34
503 0.33
504 0.3
505 0.24
506 0.23
507 0.2
508 0.17
509 0.11
510 0.1
511 0.07
512 0.06
513 0.07
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.03
526 0.04
527 0.06
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.11
532 0.14
533 0.15
534 0.14
535 0.17
536 0.16
537 0.15
538 0.15
539 0.14
540 0.11
541 0.09
542 0.09
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.03
547 0.04
548 0.04
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.1
557 0.11
558 0.11
559 0.12
560 0.12
561 0.13
562 0.13
563 0.12
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.07
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.08
573 0.11
574 0.13
575 0.17
576 0.19
577 0.21
578 0.26
579 0.3
580 0.32
581 0.35
582 0.42
583 0.49
584 0.56
585 0.62
586 0.65
587 0.71
588 0.72
589 0.69
590 0.65
591 0.61
592 0.53
593 0.48
594 0.4
595 0.31
596 0.28
597 0.26
598 0.2
599 0.14
600 0.13
601 0.11
602 0.12
603 0.14
604 0.13
605 0.14
606 0.18
607 0.27
608 0.31
609 0.32
610 0.32
611 0.38
612 0.45
613 0.44
614 0.44
615 0.35
616 0.32
617 0.31
618 0.29
619 0.2
620 0.13
621 0.1
622 0.06
623 0.05
624 0.04
625 0.03
626 0.03
627 0.03
628 0.04
629 0.04
630 0.05
631 0.07
632 0.09
633 0.14
634 0.17
635 0.22
636 0.25
637 0.29
638 0.33
639 0.33
640 0.34
641 0.31
642 0.3
643 0.25
644 0.23
645 0.19
646 0.15
647 0.17
648 0.15
649 0.13
650 0.12
651 0.13
652 0.12
653 0.11
654 0.1
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.05
659 0.08
660 0.08
661 0.09
662 0.1
663 0.11
664 0.12
665 0.15
666 0.16
667 0.15
668 0.21
669 0.21
670 0.25
671 0.27
672 0.26
673 0.24
674 0.24
675 0.23
676 0.18
677 0.17
678 0.12
679 0.14
680 0.15
681 0.15
682 0.15
683 0.16
684 0.17
685 0.19
686 0.19
687 0.15
688 0.14
689 0.17
690 0.16
691 0.14
692 0.13
693 0.1
694 0.1
695 0.11
696 0.1
697 0.09
698 0.09
699 0.08
700 0.09
701 0.1
702 0.1
703 0.08
704 0.08
705 0.08
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.1
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.1
714 0.1
715 0.11
716 0.11
717 0.1
718 0.1
719 0.13
720 0.17
721 0.16
722 0.15
723 0.15
724 0.15
725 0.15
726 0.19
727 0.16
728 0.18
729 0.21
730 0.26
731 0.28
732 0.3
733 0.31
734 0.3
735 0.36
736 0.34
737 0.34
738 0.29
739 0.27
740 0.26
741 0.24
742 0.21
743 0.14
744 0.11
745 0.08
746 0.09
747 0.08
748 0.08
749 0.11
750 0.11
751 0.1
752 0.1
753 0.11
754 0.13
755 0.12
756 0.12
757 0.1
758 0.1
759 0.11
760 0.11
761 0.1
762 0.09
763 0.1
764 0.12
765 0.13
766 0.14
767 0.14
768 0.18
769 0.18
770 0.19
771 0.21
772 0.21
773 0.2
774 0.19
775 0.2
776 0.18
777 0.24
778 0.29
779 0.35
780 0.41
781 0.46
782 0.5
783 0.54
784 0.6
785 0.62
786 0.59
787 0.55
788 0.51
789 0.46
790 0.44
791 0.43
792 0.36
793 0.28
794 0.24
795 0.19
796 0.16
797 0.19
798 0.22
799 0.19
800 0.2
801 0.22
802 0.26
803 0.27
804 0.28
805 0.33
806 0.31
807 0.32
808 0.32
809 0.3
810 0.26
811 0.25
812 0.25
813 0.17
814 0.15
815 0.13
816 0.11
817 0.1
818 0.11
819 0.1
820 0.09
821 0.08
822 0.07
823 0.06
824 0.06
825 0.06
826 0.05
827 0.06
828 0.08
829 0.1
830 0.11
831 0.11
832 0.12
833 0.16
834 0.18
835 0.18
836 0.17
837 0.15
838 0.15
839 0.16
840 0.15
841 0.12
842 0.11
843 0.12
844 0.12
845 0.11
846 0.1
847 0.12
848 0.14
849 0.19
850 0.24
851 0.28
852 0.32
853 0.33
854 0.35
855 0.37
856 0.4
857 0.37
858 0.35
859 0.33
860 0.28
861 0.36
862 0.36
863 0.35
864 0.31
865 0.27
866 0.24
867 0.23
868 0.22
869 0.14
870 0.13
871 0.1
872 0.09
873 0.1
874 0.11
875 0.1
876 0.1
877 0.08
878 0.08
879 0.08
880 0.08
881 0.07
882 0.08
883 0.1
884 0.12
885 0.14
886 0.15
887 0.16
888 0.19
889 0.19
890 0.19
891 0.2
892 0.21
893 0.23
894 0.23
895 0.21
896 0.19
897 0.19
898 0.16
899 0.15
900 0.13
901 0.08
902 0.09
903 0.09
904 0.08
905 0.1
906 0.1
907 0.1
908 0.12
909 0.14
910 0.19
911 0.24
912 0.26
913 0.31
914 0.37
915 0.43
916 0.49
917 0.52
918 0.52
919 0.53
920 0.59
921 0.62
922 0.59
923 0.58
924 0.51
925 0.48
926 0.48
927 0.43
928 0.43
929 0.41
930 0.39
931 0.35
932 0.45
933 0.51
934 0.53
935 0.58
936 0.56
937 0.56
938 0.64
939 0.67
940 0.62
941 0.62
942 0.61
943 0.64
944 0.67
945 0.68
946 0.67
947 0.7
948 0.68
949 0.65
950 0.65
951 0.65
952 0.62
953 0.65
954 0.6
955 0.54
956 0.51
957 0.47
958 0.43
959 0.37
960 0.32
961 0.22
962 0.19
963 0.18
964 0.19
965 0.18
966 0.14
967 0.11
968 0.09
969 0.09
970 0.08
971 0.07
972 0.05
973 0.06
974 0.07
975 0.08
976 0.08
977 0.1
978 0.1
979 0.13
980 0.19
981 0.28
982 0.33
983 0.37
984 0.47
985 0.55
986 0.66
987 0.73
988 0.77
989 0.79
990 0.8
991 0.85
992 0.83
993 0.84
994 0.82
995 0.81
996 0.8
997 0.79
998 0.73
999 0.64
1000 0.59
1001 0.51
1002 0.49
1003 0.41
1004 0.35
1005 0.27
1006 0.3
1007 0.31
1008 0.29
1009 0.28
1010 0.22
1011 0.22
1012 0.21
1013 0.19
1014 0.18
1015 0.17
1016 0.19
1017 0.18
1018 0.18
1019 0.19
1020 0.17
1021 0.16
1022 0.12
1023 0.12
1024 0.11
1025 0.14
1026 0.14
1027 0.14
1028 0.14
1029 0.16