FuNGI

D4AP73

Protein Details

Accession

D4AP73

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-28	MVRRRPKPADPLVRPKKRPIPRPTAPGQ	Basic
521-541	SGTDSSRKKPKNKHLSAQISN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
3-23	RRRPKPADPLVRPKKRPIPRP
496-512	KHTDPLKRAQAAARKRP
528-530	KKP

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	abe:ARB_06040 -

Amino Acid Sequences

MVRRRPKPADPLVRPKKRPIPRPTAPGQPQPQGQPQGYMQGQVRPTTANGTSTLPLQPPRHQPPASTLPQPKPIPSADDLTTNGFSGPLLSETYSDYPLVTTKRALREGLRHHIAKLISKKSVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRATTTSPAGNEKEDANPRRGFRDPYAGLTEAERQEMEAKKEARAKEREDNLAQIAPSVNSGPKKVNAPKQRTQQVFKSIITPEEAAKSQIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGKYEAAMSETYATFVLERSGKMRMIPIDKWYKFTAKNQFKVLTIEEAEKHMARKIRDPRWFMEKEQARAQERELQRYARQRKIYTGQSRNAPVTDRFEGDDMDFDEDRFADDEEHVGLFDDDEDAKTAEKRIKQDQLKANIFDLKDEKDYDEEEHLEKKQKEDLKSFGKQVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDDESTDESELERQKEEQKKSEEDPKRKDNQADKPSGTSTKGTNTPSGRPKHTDPLKRAQAAARKRPGSPNLSDASGTDSSRKKPKNKHLSAQISNSQPTSRPISPVPQAQRKSSGTANANDATSSTAQTAAGAKKRIRTVPGKAGSASDVEKAANSGAEMSDSTMAKRMKLNVPGAKSKTGTPIGSRAGSPTPAGKAVTGSRASSPESSRGISTPSGSGSRRGSVSGANPGAGAPPPASFPTASEIHAAIPANGILSNDLLRMFRSRLGNSRENHRRFIGIVKDVSVFGKEDKLLRPGVIKEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.85
3	0.84
4	0.83
5	0.84
6	0.82
7	0.82
8	0.8
9	0.84
10	0.79
11	0.8
12	0.77
13	0.77
14	0.73
15	0.69
16	0.65
17	0.63
18	0.65
19	0.62
20	0.55
21	0.5
22	0.44
23	0.46
24	0.42
25	0.4
26	0.34
27	0.33
28	0.35
29	0.32
30	0.32
31	0.25
32	0.26
33	0.27
34	0.26
35	0.22
36	0.22
37	0.23
38	0.23
39	0.23
40	0.26
41	0.24
42	0.29
43	0.32
44	0.38
45	0.44
46	0.51
47	0.58
48	0.56
49	0.54
50	0.55
51	0.6
52	0.57
53	0.56
54	0.56
55	0.53
56	0.61
57	0.62
58	0.55
59	0.51
60	0.48
61	0.44
62	0.39
63	0.38
64	0.3
65	0.32
66	0.31
67	0.31
68	0.3
69	0.24
70	0.21
71	0.16
72	0.15
73	0.12
74	0.12
75	0.09
76	0.09
77	0.1
78	0.1
79	0.14
80	0.16
81	0.17
82	0.16
83	0.15
84	0.14
85	0.18
86	0.2
87	0.18
88	0.2
89	0.25
90	0.32
91	0.35
92	0.37
93	0.38
94	0.45
95	0.51
96	0.56
97	0.56
98	0.51
99	0.48
100	0.5
101	0.47
102	0.46
103	0.46
104	0.43
105	0.4
106	0.41
107	0.46
108	0.5
109	0.58
110	0.54
111	0.5
112	0.5
113	0.55
114	0.57
115	0.55
116	0.51
117	0.49
118	0.46
119	0.47
120	0.46
121	0.46
122	0.53
123	0.58
124	0.63
125	0.66
126	0.75
127	0.76
128	0.74
129	0.72
130	0.68
131	0.63
132	0.57
133	0.51
134	0.46
135	0.4
136	0.42
137	0.36
138	0.32
139	0.3
140	0.28
141	0.3
142	0.34
143	0.35
144	0.37
145	0.4
146	0.4
147	0.43
148	0.45
149	0.43
150	0.38
151	0.44
152	0.4
153	0.39
154	0.43
155	0.39
156	0.35
157	0.32
158	0.34
159	0.25
160	0.24
161	0.2
162	0.16
163	0.21
164	0.24
165	0.26
166	0.27
167	0.28
168	0.32
169	0.38
170	0.41
171	0.44
172	0.46
173	0.49
174	0.51
175	0.55
176	0.57
177	0.52
178	0.51
179	0.44
180	0.4
181	0.34
182	0.26
183	0.21
184	0.14
185	0.13
186	0.12
187	0.13
188	0.13
189	0.15
190	0.17
191	0.19
192	0.26
193	0.33
194	0.41
195	0.48
196	0.55
197	0.61
198	0.68
199	0.74
200	0.72
201	0.7
202	0.67
203	0.66
204	0.62
205	0.54
206	0.49
207	0.42
208	0.37
209	0.34
210	0.28
211	0.2
212	0.19
213	0.19
214	0.17
215	0.18
216	0.18
217	0.17
218	0.18
219	0.18
220	0.16
221	0.17
222	0.2
223	0.19
224	0.21
225	0.21
226	0.19
227	0.19
228	0.18
229	0.17
230	0.14
231	0.17
232	0.19
233	0.19
234	0.18
235	0.2
236	0.21
237	0.21
238	0.2
239	0.17
240	0.14
241	0.13
242	0.14
243	0.13
244	0.12
245	0.12
246	0.1
247	0.11
248	0.09
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.09
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.12
259	0.13
260	0.13
261	0.16
262	0.18
263	0.21
264	0.22
265	0.27
266	0.35
267	0.35
268	0.38
269	0.37
270	0.38
271	0.36
272	0.43
273	0.47
274	0.46
275	0.49
276	0.51
277	0.5
278	0.46
279	0.46
280	0.39
281	0.31
282	0.24
283	0.22
284	0.18
285	0.17
286	0.18
287	0.16
288	0.16
289	0.15
290	0.18
291	0.17
292	0.25
293	0.33
294	0.4
295	0.47
296	0.5
297	0.5
298	0.55
299	0.56
300	0.49
301	0.49
302	0.45
303	0.41
304	0.43
305	0.46
306	0.41
307	0.39
308	0.4
309	0.38
310	0.35
311	0.38
312	0.34
313	0.31
314	0.33
315	0.42
316	0.48
317	0.46
318	0.5
319	0.45
320	0.48
321	0.51
322	0.56
323	0.56
324	0.55
325	0.52
326	0.51
327	0.52
328	0.48
329	0.42
330	0.35
331	0.27
332	0.25
333	0.23
334	0.19
335	0.18
336	0.17
337	0.17
338	0.15
339	0.14
340	0.1
341	0.11
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.08
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.08
367	0.11
368	0.14
369	0.18
370	0.23
371	0.31
372	0.35
373	0.43
374	0.47
375	0.53
376	0.53
377	0.5
378	0.45
379	0.41
380	0.37
381	0.3
382	0.25
383	0.18
384	0.17
385	0.16
386	0.16
387	0.13
388	0.14
389	0.14
390	0.14
391	0.13
392	0.13
393	0.15
394	0.16
395	0.22
396	0.22
397	0.22
398	0.26
399	0.3
400	0.33
401	0.34
402	0.38
403	0.38
404	0.41
405	0.45
406	0.45
407	0.45
408	0.44
409	0.46
410	0.49
411	0.51
412	0.53
413	0.59
414	0.63
415	0.66
416	0.69
417	0.72
418	0.66
419	0.62
420	0.58
421	0.5
422	0.46
423	0.38
424	0.35
425	0.29
426	0.26
427	0.22
428	0.21
429	0.18
430	0.13
431	0.12
432	0.12
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.12
440	0.1
441	0.14
442	0.17
443	0.16
444	0.15
445	0.15
446	0.23
447	0.31
448	0.35
449	0.38
450	0.41
451	0.44
452	0.47
453	0.55
454	0.56
455	0.57
456	0.61
457	0.63
458	0.64
459	0.64
460	0.68
461	0.66
462	0.67
463	0.67
464	0.66
465	0.58
466	0.54
467	0.52
468	0.47
469	0.4
470	0.31
471	0.24
472	0.23
473	0.26
474	0.26
475	0.29
476	0.3
477	0.35
478	0.41
479	0.45
480	0.44
481	0.44
482	0.46
483	0.51
484	0.57
485	0.58
486	0.56
487	0.61
488	0.65
489	0.61
490	0.59
491	0.54
492	0.53
493	0.54
494	0.58
495	0.56
496	0.51
497	0.52
498	0.57
499	0.57
500	0.55
501	0.48
502	0.44
503	0.37
504	0.36
505	0.34
506	0.27
507	0.27
508	0.23
509	0.21
510	0.21
511	0.23
512	0.26
513	0.36
514	0.43
515	0.46
516	0.54
517	0.65
518	0.71
519	0.76
520	0.8
521	0.81
522	0.83
523	0.8
524	0.76
525	0.71
526	0.63
527	0.56
528	0.48
529	0.39
530	0.3
531	0.28
532	0.29
533	0.24
534	0.24
535	0.25
536	0.29
537	0.33
538	0.39
539	0.44
540	0.46
541	0.48
542	0.47
543	0.53
544	0.49
545	0.48
546	0.43
547	0.42
548	0.37
549	0.37
550	0.39
551	0.33
552	0.31
553	0.28
554	0.25
555	0.2
556	0.16
557	0.15
558	0.11
559	0.1
560	0.09
561	0.1
562	0.15
563	0.17
564	0.22
565	0.26
566	0.28
567	0.33
568	0.38
569	0.41
570	0.43
571	0.45
572	0.48
573	0.53
574	0.56
575	0.53
576	0.48
577	0.45
578	0.4
579	0.35
580	0.29
581	0.2
582	0.15
583	0.13
584	0.12
585	0.12
586	0.11
587	0.09
588	0.08
589	0.07
590	0.06
591	0.07
592	0.07
593	0.08
594	0.11
595	0.11
596	0.12
597	0.18
598	0.18
599	0.19
600	0.23
601	0.27
602	0.3
603	0.37
604	0.45
605	0.44
606	0.5
607	0.56
608	0.56
609	0.55
610	0.5
611	0.45
612	0.44
613	0.42
614	0.39
615	0.33
616	0.36
617	0.35
618	0.35
619	0.33
620	0.3
621	0.27
622	0.27
623	0.25
624	0.22
625	0.2
626	0.21
627	0.21
628	0.18
629	0.19
630	0.2
631	0.25
632	0.24
633	0.23
634	0.23
635	0.25
636	0.27
637	0.28
638	0.29
639	0.28
640	0.29
641	0.29
642	0.29
643	0.27
644	0.28
645	0.25
646	0.24
647	0.2
648	0.2
649	0.24
650	0.23
651	0.28
652	0.28
653	0.3
654	0.29
655	0.28
656	0.26
657	0.25
658	0.28
659	0.31
660	0.29
661	0.26
662	0.25
663	0.24
664	0.24
665	0.2
666	0.18
667	0.1
668	0.1
669	0.12
670	0.13
671	0.15
672	0.14
673	0.14
674	0.18
675	0.19
676	0.19
677	0.19
678	0.19
679	0.17
680	0.21
681	0.2
682	0.15
683	0.14
684	0.13
685	0.12
686	0.12
687	0.11
688	0.09
689	0.1
690	0.1
691	0.1
692	0.11
693	0.11
694	0.12
695	0.16
696	0.17
697	0.21
698	0.27
699	0.3
700	0.38
701	0.46
702	0.51
703	0.51
704	0.6
705	0.65
706	0.64
707	0.65
708	0.58
709	0.53
710	0.47
711	0.51
712	0.49
713	0.45
714	0.42
715	0.39
716	0.38
717	0.36
718	0.35
719	0.29
720	0.22
721	0.17
722	0.2
723	0.2
724	0.24
725	0.26
726	0.29
727	0.3
728	0.3
729	0.33

D4AP73

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer