Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AMU1

Protein Details
Accession D4AMU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-76RADPPADGTKRRKKRNRWGDAQENKAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-66KRGRSPVRADPPADGTKRRKKRNR
Subcellular Location(s) plas 12, nucl 9, golg 2, cyto_mito 2, mito 1.5, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG abe:ARB_05544  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
Amino Acid Sequences MAWRNQGITGSNNIPLGRRRFGDEPDETPSSSSTPAHMDGGNKRGRSPVRADPPADGTKRRKKRNRWGDAQENKAAGLMGLPTLIMANMTNEQLEAYTLHLRIEEISQKLRINDVVPADGDRSPSPAPQYDNLGKRVNTREYRYRKRLEDERHKLIEKAMKVIPNYHPPSDYRRPTKTQEKVYVPVNDYPEINFSMITNPLTPNRPTLFRLFHSFFFFFSLFCSRLEIFSTCWFFISFSFQLVISLMAFLSFFSPPSHTNPVTTNSSHSLLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.35
4 0.34
5 0.33
6 0.37
7 0.38
8 0.42
9 0.46
10 0.44
11 0.42
12 0.43
13 0.44
14 0.38
15 0.35
16 0.32
17 0.26
18 0.23
19 0.2
20 0.15
21 0.16
22 0.18
23 0.19
24 0.2
25 0.23
26 0.26
27 0.33
28 0.37
29 0.34
30 0.33
31 0.39
32 0.4
33 0.4
34 0.41
35 0.43
36 0.47
37 0.52
38 0.53
39 0.48
40 0.52
41 0.54
42 0.51
43 0.49
44 0.48
45 0.54
46 0.62
47 0.7
48 0.74
49 0.77
50 0.86
51 0.89
52 0.9
53 0.89
54 0.89
55 0.89
56 0.87
57 0.82
58 0.75
59 0.64
60 0.53
61 0.44
62 0.34
63 0.23
64 0.15
65 0.09
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.03
73 0.03
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.12
91 0.14
92 0.13
93 0.15
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.18
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.1
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.21
117 0.24
118 0.27
119 0.3
120 0.31
121 0.29
122 0.31
123 0.35
124 0.36
125 0.35
126 0.37
127 0.42
128 0.49
129 0.58
130 0.61
131 0.62
132 0.59
133 0.61
134 0.65
135 0.65
136 0.67
137 0.66
138 0.65
139 0.63
140 0.61
141 0.54
142 0.49
143 0.44
144 0.34
145 0.3
146 0.25
147 0.24
148 0.24
149 0.28
150 0.28
151 0.32
152 0.35
153 0.32
154 0.3
155 0.29
156 0.38
157 0.43
158 0.47
159 0.44
160 0.46
161 0.5
162 0.56
163 0.65
164 0.64
165 0.63
166 0.64
167 0.62
168 0.59
169 0.6
170 0.58
171 0.5
172 0.47
173 0.41
174 0.34
175 0.29
176 0.27
177 0.23
178 0.19
179 0.17
180 0.13
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.15
188 0.19
189 0.2
190 0.23
191 0.24
192 0.26
193 0.28
194 0.32
195 0.33
196 0.33
197 0.4
198 0.38
199 0.37
200 0.4
201 0.38
202 0.33
203 0.32
204 0.29
205 0.21
206 0.21
207 0.23
208 0.18
209 0.17
210 0.21
211 0.17
212 0.18
213 0.22
214 0.2
215 0.19
216 0.25
217 0.28
218 0.24
219 0.25
220 0.24
221 0.21
222 0.21
223 0.25
224 0.19
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.16
231 0.09
232 0.09
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.13
242 0.15
243 0.22
244 0.3
245 0.29
246 0.31
247 0.34
248 0.38
249 0.4
250 0.39
251 0.37
252 0.34