Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53709

Protein Details
Accession P53709    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38EANRKRALERLQQKKKKDAGEBasic
316-348LDKEWERREENKVKRKEKKYHDQLREMRKRTRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-34RKRALERLQQKKKK
322-348RREENKVKRKEKKYHDQLREMRKRTRA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
IPR022652  Znf_XPA_CS  
Gene Ontology GO:0000110  C:nucleotide-excision repair factor 1 complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
GO:1901255  P:nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair  
GO:0000715  P:nucleotide-excision repair, DNA damage recognition  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
KEGG cal:CAALFM_C702020WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PF01286  XPA_N  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MASHIRGNLTEEQLKRIEANRKRALERLQQKKKKDAGEHVPSSTPKSTSTTTTKETGSYSPTKTLSQIVNSDSVQVSSKFVEIETDGSVKKRRVLTEEQRQKIEQNRLRAIEIQKNLKQRENQKDDSTTSSKPVDNIRLNQNRPDSVVSSTKKFQPPPIRKQDYIEFDFATMKDTKGGFLQDEKTNTQGADEQTLQDWKNKQRELQKIRELPPPIDLQNIPRCRECQSMEVDANLMTNFNVRACRKCIKALPEKYSLLTKTECKEDYLLTEPELQDTTLLPRIEKPNPHGYSRMQLFVRFQVEEFAWKKWGGPEELDKEWERREENKVKRKEKKYHDQLREMRKRTRAEEYTRKLRDGKSLGERHVHDWSSPVNIDKHTIKRRCIDCGIETEEVVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.36
3 0.37
4 0.42
5 0.43
6 0.52
7 0.57
8 0.61
9 0.63
10 0.67
11 0.68
12 0.68
13 0.7
14 0.71
15 0.74
16 0.75
17 0.79
18 0.82
19 0.81
20 0.79
21 0.77
22 0.76
23 0.75
24 0.77
25 0.75
26 0.68
27 0.66
28 0.58
29 0.56
30 0.49
31 0.39
32 0.31
33 0.31
34 0.31
35 0.32
36 0.38
37 0.38
38 0.39
39 0.41
40 0.4
41 0.37
42 0.37
43 0.33
44 0.32
45 0.32
46 0.31
47 0.33
48 0.34
49 0.33
50 0.32
51 0.35
52 0.32
53 0.3
54 0.31
55 0.28
56 0.3
57 0.28
58 0.29
59 0.24
60 0.22
61 0.2
62 0.17
63 0.17
64 0.14
65 0.14
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.17
75 0.22
76 0.22
77 0.27
78 0.3
79 0.31
80 0.35
81 0.44
82 0.51
83 0.58
84 0.66
85 0.65
86 0.64
87 0.62
88 0.6
89 0.58
90 0.59
91 0.52
92 0.51
93 0.52
94 0.51
95 0.51
96 0.53
97 0.5
98 0.47
99 0.47
100 0.46
101 0.45
102 0.51
103 0.53
104 0.52
105 0.54
106 0.56
107 0.62
108 0.62
109 0.62
110 0.59
111 0.59
112 0.56
113 0.56
114 0.5
115 0.4
116 0.36
117 0.34
118 0.3
119 0.28
120 0.31
121 0.33
122 0.33
123 0.36
124 0.43
125 0.48
126 0.49
127 0.53
128 0.51
129 0.43
130 0.41
131 0.38
132 0.3
133 0.25
134 0.31
135 0.28
136 0.28
137 0.3
138 0.34
139 0.37
140 0.37
141 0.42
142 0.45
143 0.52
144 0.59
145 0.67
146 0.67
147 0.63
148 0.65
149 0.64
150 0.6
151 0.54
152 0.46
153 0.35
154 0.29
155 0.29
156 0.25
157 0.21
158 0.15
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.11
166 0.13
167 0.17
168 0.16
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.19
173 0.18
174 0.16
175 0.16
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.2
185 0.23
186 0.3
187 0.31
188 0.35
189 0.41
190 0.51
191 0.54
192 0.58
193 0.6
194 0.6
195 0.62
196 0.63
197 0.56
198 0.47
199 0.42
200 0.37
201 0.28
202 0.25
203 0.21
204 0.21
205 0.28
206 0.31
207 0.3
208 0.29
209 0.3
210 0.31
211 0.35
212 0.31
213 0.27
214 0.27
215 0.29
216 0.28
217 0.27
218 0.24
219 0.2
220 0.18
221 0.14
222 0.1
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.12
228 0.13
229 0.17
230 0.22
231 0.27
232 0.28
233 0.33
234 0.37
235 0.4
236 0.49
237 0.53
238 0.54
239 0.55
240 0.54
241 0.5
242 0.49
243 0.42
244 0.34
245 0.29
246 0.27
247 0.24
248 0.28
249 0.28
250 0.25
251 0.25
252 0.23
253 0.24
254 0.25
255 0.23
256 0.19
257 0.22
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.16
262 0.12
263 0.12
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.19
269 0.25
270 0.3
271 0.33
272 0.36
273 0.41
274 0.44
275 0.46
276 0.45
277 0.42
278 0.45
279 0.43
280 0.43
281 0.33
282 0.32
283 0.32
284 0.33
285 0.34
286 0.26
287 0.24
288 0.21
289 0.21
290 0.26
291 0.26
292 0.23
293 0.22
294 0.21
295 0.23
296 0.24
297 0.28
298 0.23
299 0.25
300 0.31
301 0.34
302 0.36
303 0.39
304 0.36
305 0.34
306 0.35
307 0.35
308 0.31
309 0.3
310 0.38
311 0.44
312 0.53
313 0.61
314 0.68
315 0.74
316 0.81
317 0.87
318 0.88
319 0.88
320 0.89
321 0.9
322 0.9
323 0.89
324 0.89
325 0.88
326 0.89
327 0.89
328 0.84
329 0.81
330 0.78
331 0.74
332 0.69
333 0.71
334 0.68
335 0.67
336 0.71
337 0.73
338 0.76
339 0.73
340 0.72
341 0.67
342 0.62
343 0.61
344 0.55
345 0.54
346 0.54
347 0.57
348 0.57
349 0.59
350 0.59
351 0.53
352 0.56
353 0.49
354 0.39
355 0.35
356 0.33
357 0.31
358 0.3
359 0.3
360 0.26
361 0.26
362 0.31
363 0.35
364 0.44
365 0.49
366 0.54
367 0.57
368 0.63
369 0.65
370 0.68
371 0.66
372 0.62
373 0.56
374 0.56
375 0.55
376 0.47