Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B633

Protein Details
Accession D4B633    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
323-343APDPGRPKRAGRKRSYHDSSFBasic
365-387DDGGSVGKKKRKKMVRSSCMFIVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
328-336RPKRAGRKR
372-377KKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 9, cyto 6, mito 5, plas 2, extr 1, pero 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG abe:ARB_03940  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSFSPQNYESSSSTTKSTSPAHTAAQSANLASPPSSVAMQPHSVSQSTVTTSTSCPTPASSTSGLARDGSDGPGAIAASFADGKIPFETLGSDTKPLAHDHHNNEKSIDTQKPSSNDSNDHDPMDIDLKEGAGLSEEPSLESLQRDVGEAIGLCKSSYTSTLPVPKFDIVSLYGLGPIAASVARTDPVTGEKINRLRKSYEGKIKGLGLAGRNKPVKQEPGAPGGLRNLMMWPDEEWYNQKVAGKEITIAEPDTAFYKQQLRAMKMEPGITPRNEYWEDVLGHEKSSKNAAEQLPKKPGSSSFKNTPQSNGTPAAQASSATVAPDPGRPKRAGRKRSYHDSSFVGYGEGFPDDDDLEGSLYSNDDDGGSVGKKKRKKMVRSSCMFIVLPVLGYLPFYTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.29
4 0.33
5 0.31
6 0.34
7 0.35
8 0.37
9 0.37
10 0.38
11 0.34
12 0.33
13 0.29
14 0.23
15 0.22
16 0.19
17 0.18
18 0.16
19 0.15
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.14
25 0.17
26 0.2
27 0.2
28 0.22
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.2
34 0.19
35 0.2
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.15
43 0.16
44 0.19
45 0.19
46 0.23
47 0.23
48 0.24
49 0.26
50 0.27
51 0.26
52 0.23
53 0.21
54 0.18
55 0.18
56 0.17
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.08
63 0.07
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.11
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.17
82 0.18
83 0.19
84 0.2
85 0.24
86 0.31
87 0.36
88 0.47
89 0.48
90 0.48
91 0.47
92 0.44
93 0.39
94 0.37
95 0.34
96 0.27
97 0.28
98 0.32
99 0.34
100 0.38
101 0.41
102 0.38
103 0.38
104 0.38
105 0.42
106 0.39
107 0.37
108 0.32
109 0.27
110 0.25
111 0.24
112 0.19
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.15
148 0.23
149 0.24
150 0.24
151 0.26
152 0.25
153 0.23
154 0.21
155 0.19
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.16
179 0.22
180 0.3
181 0.32
182 0.32
183 0.32
184 0.37
185 0.42
186 0.44
187 0.47
188 0.44
189 0.43
190 0.42
191 0.41
192 0.36
193 0.3
194 0.24
195 0.18
196 0.21
197 0.21
198 0.25
199 0.27
200 0.26
201 0.28
202 0.3
203 0.31
204 0.26
205 0.32
206 0.29
207 0.32
208 0.34
209 0.3
210 0.27
211 0.25
212 0.23
213 0.16
214 0.13
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.16
228 0.14
229 0.16
230 0.16
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.13
236 0.13
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.15
245 0.17
246 0.21
247 0.26
248 0.27
249 0.3
250 0.32
251 0.35
252 0.31
253 0.31
254 0.28
255 0.28
256 0.29
257 0.26
258 0.28
259 0.24
260 0.28
261 0.27
262 0.27
263 0.24
264 0.24
265 0.24
266 0.21
267 0.26
268 0.2
269 0.2
270 0.23
271 0.21
272 0.17
273 0.21
274 0.21
275 0.18
276 0.24
277 0.28
278 0.34
279 0.39
280 0.45
281 0.49
282 0.49
283 0.48
284 0.43
285 0.47
286 0.45
287 0.47
288 0.48
289 0.48
290 0.56
291 0.63
292 0.62
293 0.59
294 0.57
295 0.52
296 0.48
297 0.44
298 0.36
299 0.3
300 0.29
301 0.26
302 0.2
303 0.17
304 0.14
305 0.12
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.16
312 0.21
313 0.25
314 0.3
315 0.32
316 0.4
317 0.5
318 0.59
319 0.65
320 0.68
321 0.73
322 0.76
323 0.85
324 0.85
325 0.78
326 0.72
327 0.65
328 0.58
329 0.49
330 0.41
331 0.31
332 0.23
333 0.19
334 0.16
335 0.13
336 0.1
337 0.08
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.1
355 0.11
356 0.17
357 0.24
358 0.31
359 0.38
360 0.45
361 0.55
362 0.62
363 0.71
364 0.76
365 0.81
366 0.84
367 0.85
368 0.83
369 0.76
370 0.71
371 0.6
372 0.49
373 0.41
374 0.31
375 0.24
376 0.18
377 0.15
378 0.1
379 0.11