Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B3A7

Protein Details
Accession D4B3A7    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-99LTEAKGRLEKLKRRRREREERRQREAGEBasic
173-196AEGPTRPHPRARRARRNRDEEDSDBasic
272-298DASRESNSQNKRRKKKRSQLAQTEEGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-96KGRLEKLKRRRREREERRQRE
179-188PHPRARRARR
282-288KRRKKKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026846  Nse2(Mms21)  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0019789  F:SUMO transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
KEGG abe:ARB_02942  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11789  zf-Nse  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51044  ZF_SP_RING  
CDD cd16651  SPL-RING_NSE2  
Amino Acid Sequences MSRTTQRASTSEAMGAPLELPPYEPQIAPLTANAKRKVDTVIKSFHTRHLKIHLSHATGALSDSVGDTNDRLTEAKGRLEKLKRRRREREERRQREAGEGKDNEPGDRNDSSAERQREAENFARREEKLAQFELLVKNTTERLEGSMRSLIDTEVQADKMLDLLSTILAQNSAEGPTRPHPRARRARRNRDEEDSDADDDEQDEEAEPPVEVEVIPASRTIADGLAEKKREWESLSLAQSYTQFYRVLHESKYSAMDVPPLPHPSTWFKSLDASRESNSQNKRRKKKRSQLAQTEEGAMEEGGVDDEGLRPSPSGDETNNESEEEDDNNEHDEDDEEDGEDGEEEEEEEPTREDTQDSSSDDEVMINSEKFSITCPLTLQPFNEPVSSTKCPHSFERSAIESMLNRSRQYTFVPLPNDSSRGRNMRCVKCPVCNVLITMHDLKRDPVLIRRVKKAIRMAAAEAEENNDEDGGEGEDLEMDEDDSILMRRSKAANGGRRVVVKSERTRSPSRIPDTQME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.17
4 0.14
5 0.13
6 0.1
7 0.12
8 0.12
9 0.17
10 0.19
11 0.18
12 0.2
13 0.23
14 0.25
15 0.23
16 0.25
17 0.26
18 0.3
19 0.38
20 0.4
21 0.38
22 0.38
23 0.39
24 0.43
25 0.45
26 0.45
27 0.44
28 0.46
29 0.48
30 0.54
31 0.55
32 0.57
33 0.59
34 0.54
35 0.53
36 0.55
37 0.58
38 0.53
39 0.6
40 0.58
41 0.52
42 0.51
43 0.48
44 0.39
45 0.31
46 0.29
47 0.2
48 0.13
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.18
61 0.2
62 0.27
63 0.3
64 0.32
65 0.4
66 0.49
67 0.57
68 0.61
69 0.69
70 0.72
71 0.79
72 0.87
73 0.89
74 0.91
75 0.93
76 0.93
77 0.94
78 0.93
79 0.91
80 0.87
81 0.77
82 0.76
83 0.71
84 0.65
85 0.63
86 0.56
87 0.49
88 0.48
89 0.47
90 0.38
91 0.35
92 0.31
93 0.26
94 0.24
95 0.23
96 0.2
97 0.22
98 0.26
99 0.31
100 0.33
101 0.3
102 0.31
103 0.33
104 0.33
105 0.37
106 0.39
107 0.39
108 0.38
109 0.39
110 0.42
111 0.39
112 0.41
113 0.42
114 0.4
115 0.36
116 0.36
117 0.34
118 0.3
119 0.34
120 0.33
121 0.28
122 0.23
123 0.18
124 0.18
125 0.19
126 0.19
127 0.15
128 0.13
129 0.15
130 0.16
131 0.17
132 0.18
133 0.2
134 0.19
135 0.19
136 0.19
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.11
163 0.18
164 0.25
165 0.27
166 0.34
167 0.39
168 0.48
169 0.59
170 0.67
171 0.72
172 0.76
173 0.86
174 0.88
175 0.9
176 0.85
177 0.82
178 0.75
179 0.67
180 0.61
181 0.53
182 0.44
183 0.35
184 0.29
185 0.22
186 0.17
187 0.15
188 0.09
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.11
212 0.15
213 0.16
214 0.16
215 0.19
216 0.2
217 0.2
218 0.2
219 0.19
220 0.19
221 0.24
222 0.26
223 0.23
224 0.22
225 0.22
226 0.21
227 0.21
228 0.17
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.13
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.16
239 0.17
240 0.15
241 0.12
242 0.11
243 0.13
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.16
248 0.16
249 0.15
250 0.18
251 0.2
252 0.23
253 0.24
254 0.23
255 0.21
256 0.25
257 0.26
258 0.28
259 0.26
260 0.25
261 0.22
262 0.26
263 0.27
264 0.29
265 0.36
266 0.41
267 0.46
268 0.54
269 0.64
270 0.69
271 0.79
272 0.84
273 0.86
274 0.88
275 0.9
276 0.9
277 0.9
278 0.87
279 0.81
280 0.7
281 0.62
282 0.51
283 0.4
284 0.29
285 0.18
286 0.11
287 0.06
288 0.05
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.1
302 0.1
303 0.13
304 0.17
305 0.2
306 0.2
307 0.19
308 0.18
309 0.17
310 0.17
311 0.15
312 0.13
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.06
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.12
343 0.15
344 0.16
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.11
359 0.13
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.17
364 0.21
365 0.22
366 0.22
367 0.21
368 0.24
369 0.24
370 0.24
371 0.22
372 0.21
373 0.26
374 0.29
375 0.28
376 0.3
377 0.32
378 0.35
379 0.38
380 0.44
381 0.4
382 0.4
383 0.43
384 0.41
385 0.38
386 0.36
387 0.33
388 0.26
389 0.28
390 0.32
391 0.28
392 0.25
393 0.26
394 0.27
395 0.27
396 0.29
397 0.31
398 0.29
399 0.33
400 0.36
401 0.35
402 0.39
403 0.39
404 0.4
405 0.34
406 0.33
407 0.34
408 0.39
409 0.4
410 0.44
411 0.52
412 0.56
413 0.61
414 0.67
415 0.63
416 0.62
417 0.65
418 0.61
419 0.54
420 0.47
421 0.42
422 0.35
423 0.33
424 0.3
425 0.31
426 0.27
427 0.27
428 0.27
429 0.27
430 0.27
431 0.29
432 0.26
433 0.27
434 0.36
435 0.42
436 0.47
437 0.53
438 0.58
439 0.58
440 0.63
441 0.64
442 0.62
443 0.58
444 0.56
445 0.51
446 0.48
447 0.46
448 0.4
449 0.32
450 0.27
451 0.22
452 0.19
453 0.17
454 0.12
455 0.1
456 0.09
457 0.1
458 0.08
459 0.08
460 0.07
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.1
473 0.12
474 0.12
475 0.17
476 0.19
477 0.22
478 0.31
479 0.39
480 0.45
481 0.5
482 0.55
483 0.56
484 0.58
485 0.57
486 0.54
487 0.53
488 0.53
489 0.55
490 0.57
491 0.61
492 0.63
493 0.68
494 0.69
495 0.71
496 0.71
497 0.69
498 0.69