Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B4F6

Protein Details
Accession D4B4F6    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-80TESWLQRKDRLKMEKREQTTKRHydrophilic
358-399RDRDRGGRSDRDRDRPRDRDRDRDRYSRRDDDPPRKRHHEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-204VKGWKPRRFGGGL
344-395RDRDRDRDRDRDRDRDRDRGGRSDRDRDRPRDRDRDRDRYSRRDDDPPRKRH
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG abe:ARB_03345  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12220  U1snRNP70_N  
Amino Acid Sequences MTDKLPPNLLALFAPRPPLRYLQPISRAPDDVKPSTISGVAGYLDELKKYGEEVPYNATESWLQRKDRLKMEKREQTTKRLEEGLAAYNPSEDPQIRGDPFRTLFVSRLSYDVKEADLEREFGRVLNPEQSFSTPFPIPYSTYKYSYDKVIKYMTNAIDRSCVTTTAAYKETDGIRIKDRRALVDVERGRTVKGWKPRRFGGGLGGRGYTKAMPSRPMGPGGYGPPSGPGGFQGGFRGPRGGFRGGFRGGDRPFGGRGGVGFQGGRSGFGGSANGASGQAPPNAPLGPGGSRGGGGYGQQNGDGYGDRRFDDRSRGGSRYDRSGDRGVTGSNREPVRPRGYGDRDRDRDRDRDRDRDRDRDRGGRSDRDRDRPRDRDRDRDRYSRRDDDPPRKRHHEGDAYDDPRTKRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.29
4 0.3
5 0.34
6 0.34
7 0.41
8 0.44
9 0.46
10 0.54
11 0.57
12 0.6
13 0.58
14 0.56
15 0.5
16 0.51
17 0.49
18 0.43
19 0.4
20 0.36
21 0.34
22 0.32
23 0.3
24 0.23
25 0.17
26 0.15
27 0.13
28 0.11
29 0.1
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.18
38 0.18
39 0.2
40 0.22
41 0.27
42 0.28
43 0.3
44 0.28
45 0.26
46 0.23
47 0.25
48 0.32
49 0.34
50 0.34
51 0.38
52 0.46
53 0.52
54 0.58
55 0.65
56 0.66
57 0.69
58 0.78
59 0.8
60 0.79
61 0.83
62 0.78
63 0.76
64 0.76
65 0.7
66 0.63
67 0.57
68 0.5
69 0.43
70 0.42
71 0.37
72 0.29
73 0.25
74 0.21
75 0.19
76 0.19
77 0.16
78 0.16
79 0.11
80 0.12
81 0.15
82 0.2
83 0.21
84 0.24
85 0.24
86 0.27
87 0.28
88 0.28
89 0.27
90 0.23
91 0.23
92 0.24
93 0.26
94 0.21
95 0.23
96 0.23
97 0.21
98 0.21
99 0.2
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.16
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.14
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.21
117 0.22
118 0.24
119 0.22
120 0.24
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.18
125 0.2
126 0.21
127 0.28
128 0.27
129 0.29
130 0.33
131 0.34
132 0.34
133 0.38
134 0.41
135 0.34
136 0.34
137 0.35
138 0.32
139 0.31
140 0.36
141 0.31
142 0.3
143 0.29
144 0.26
145 0.25
146 0.25
147 0.26
148 0.2
149 0.18
150 0.13
151 0.15
152 0.16
153 0.17
154 0.18
155 0.15
156 0.15
157 0.17
158 0.17
159 0.21
160 0.21
161 0.2
162 0.25
163 0.29
164 0.29
165 0.31
166 0.31
167 0.27
168 0.28
169 0.29
170 0.24
171 0.29
172 0.3
173 0.28
174 0.29
175 0.27
176 0.25
177 0.24
178 0.26
179 0.22
180 0.3
181 0.38
182 0.43
183 0.47
184 0.49
185 0.52
186 0.49
187 0.44
188 0.43
189 0.39
190 0.34
191 0.31
192 0.29
193 0.24
194 0.23
195 0.23
196 0.14
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.15
202 0.19
203 0.19
204 0.21
205 0.19
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.17
210 0.14
211 0.13
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.15
225 0.12
226 0.15
227 0.19
228 0.2
229 0.19
230 0.2
231 0.24
232 0.23
233 0.24
234 0.22
235 0.24
236 0.22
237 0.23
238 0.23
239 0.2
240 0.19
241 0.18
242 0.18
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.19
297 0.2
298 0.27
299 0.3
300 0.33
301 0.37
302 0.38
303 0.41
304 0.45
305 0.46
306 0.46
307 0.46
308 0.41
309 0.41
310 0.44
311 0.4
312 0.35
313 0.33
314 0.27
315 0.26
316 0.28
317 0.27
318 0.29
319 0.29
320 0.3
321 0.33
322 0.39
323 0.41
324 0.39
325 0.39
326 0.43
327 0.5
328 0.56
329 0.61
330 0.64
331 0.65
332 0.69
333 0.73
334 0.68
335 0.69
336 0.67
337 0.69
338 0.66
339 0.7
340 0.71
341 0.74
342 0.76
343 0.78
344 0.76
345 0.76
346 0.75
347 0.73
348 0.71
349 0.7
350 0.7
351 0.69
352 0.7
353 0.7
354 0.71
355 0.74
356 0.78
357 0.77
358 0.81
359 0.81
360 0.84
361 0.85
362 0.83
363 0.83
364 0.84
365 0.86
366 0.83
367 0.84
368 0.83
369 0.82
370 0.84
371 0.82
372 0.77
373 0.77
374 0.8
375 0.8
376 0.82
377 0.82
378 0.82
379 0.81
380 0.81
381 0.77
382 0.77
383 0.76
384 0.69
385 0.68
386 0.69
387 0.64
388 0.63
389 0.62
390 0.55