Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B038

Protein Details
Accession D4B038    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-76NIFTQFTKRRKQYTKIKKKKTINNTQNYHGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-66RRKQYTKIKKKK
Subcellular Location(s) nucl 9, mito 8, cyto 4, extr 3, plas 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017132  Lsm7  
IPR044641  Lsm7/SmG-like  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG abe:ARB_01809  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01729  LSm7  
Amino Acid Sequences SKKDKKRTRTASLNSGHNDLARGGYLLLHLYSWTVHTQADTPPTHTNIFTQFTKRRKQYTKIKKKKTINNTQNYHGQHRGGHGQGQRDGQRDGGQQRDGQGQQQQEKPKKENILDLTKYMDKEVNVKFNGGREVTGVLKGYDQLMNLVLDDVKETMRGKTVHLDFKEVDGLNMFADWLGVDDNDNVTTRSLGLIVARGTLLVLLSPADGSEEIANPFVQQEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.64
3 0.55
4 0.44
5 0.38
6 0.29
7 0.23
8 0.16
9 0.13
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.09
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.09
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.12
25 0.15
26 0.21
27 0.2
28 0.23
29 0.26
30 0.29
31 0.3
32 0.28
33 0.27
34 0.25
35 0.29
36 0.27
37 0.32
38 0.36
39 0.42
40 0.51
41 0.55
42 0.6
43 0.63
44 0.7
45 0.73
46 0.77
47 0.82
48 0.83
49 0.88
50 0.88
51 0.9
52 0.9
53 0.9
54 0.89
55 0.88
56 0.87
57 0.8
58 0.74
59 0.72
60 0.66
61 0.6
62 0.52
63 0.43
64 0.34
65 0.33
66 0.33
67 0.26
68 0.28
69 0.26
70 0.26
71 0.28
72 0.31
73 0.32
74 0.3
75 0.29
76 0.25
77 0.25
78 0.25
79 0.25
80 0.24
81 0.22
82 0.21
83 0.22
84 0.26
85 0.23
86 0.21
87 0.22
88 0.22
89 0.25
90 0.3
91 0.36
92 0.39
93 0.43
94 0.44
95 0.44
96 0.45
97 0.42
98 0.43
99 0.4
100 0.41
101 0.37
102 0.35
103 0.33
104 0.3
105 0.29
106 0.24
107 0.21
108 0.13
109 0.18
110 0.2
111 0.23
112 0.21
113 0.22
114 0.22
115 0.22
116 0.24
117 0.19
118 0.17
119 0.11
120 0.13
121 0.12
122 0.13
123 0.12
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.22
147 0.27
148 0.33
149 0.32
150 0.36
151 0.32
152 0.33
153 0.37
154 0.29
155 0.24
156 0.18
157 0.17
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.12