FuNGI

Q2HHX8

Protein Details

Accession

Q2HHX8

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
688-711	LISRNLRTKRPSRKLDFRKIGPFK	Hydrophilic
806-826	LEDFHRRNPDRPKGARRRGLS	Basic
915-935	GGHRRRFDSRRWPPEPPPRSM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
696-706	KRPSRKLDFRK
812-833	RNPDRPKGARRRGLSAQLKDKK

Subcellular Location(s)

mito 15, cyto_mito 11.5, cyto 6, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MGFCLRLLRGQLGVVSKGVCGGPHPPGQRLPGLMVDAEENEDVAYVYALARRAVVLWLQPGPAPVQNNGAYGVKPPSRGSASATCTDCDSSVSYLLTPPPWKGQLGARIRSHVQNIALLRVSADDARADRWKQEHEQAFQRIRDAITADPVLMLPDPSKPFEVEADASDFAIGGQLGQRDKDGKLHPVAFFSKKLEGPRLNYPIHDKELLAIVEAFQEWRPYLSGTTHEVQVYTDHKNLRYFTTTKVLNGRQTRWAEFLSEFNFTIHYKKGSENARADALSRRADHHDDTSEASPPLLHQQTDGSLRHASQPTEDYEIAALQQQSEDPEARPLQPFVECCAAFREQRLERDFQGTIADDERDAWQEEPESKIAGLRLEGTRLWYHDKAYVRPSDQKELIRKIHESRLGGHMGISKTVAKVKQNYDFPGIKQATEEVLVECDLCGRSKPRPHKPYGLLQPLPVAERPWSSVTMDFITKLPTSKDSATGTKYDSILTVVDRLTKWSYFLPYKESWSAEQLADVIYRNVTSVHGWPEEWITDRDTKFASKFWQALMTKLGTRSKLSTAYHPQTDGQTERLNQIVEQYLRVYINFQQDDWVELLPTAQLAYNTTVTETTKITPFFANYGYEADLRQGPDVSVPRAAVKADRMNSLHAMLKEELEFVRTRMKKFYDRNRLEGPRLEEGGKVYLISRNLRTKRPSRKLDFRKIGPFKIDKKISENNYALTLPSTMRLRTNVFHISLLEPAPKNARLDKGAEAEDEEELWDVEEILDSRITKGRVEYLVKWLGFGPEDNSWQPAINFNCPEELEDFHRRNPDRPKGARRRGLSAQLKDKKVGKSSGTEDLEEGHRVTVMVAYHAPMGARAGSVPSQSLRMGLRPISRGTKGTATVPRIQSGTRGTITVPHVPSKRFVTQDVGGHRRRFDSRRWPPEPPPRSMLVDVLTESVKSHQTARGVIGAESKFERNIQTCNDISHGGAFTAPLAYH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.2
3	0.17
4	0.18
5	0.17
6	0.14
7	0.13
8	0.16
9	0.2
10	0.27
11	0.3
12	0.32
13	0.36
14	0.4
15	0.41
16	0.39
17	0.36
18	0.31
19	0.3
20	0.26
21	0.22
22	0.2
23	0.17
24	0.17
25	0.15
26	0.12
27	0.1
28	0.1
29	0.09
30	0.08
31	0.07
32	0.05
33	0.06
34	0.09
35	0.1
36	0.1
37	0.1
38	0.1
39	0.11
40	0.13
41	0.14
42	0.14
43	0.17
44	0.18
45	0.19
46	0.19
47	0.2
48	0.21
49	0.23
50	0.22
51	0.2
52	0.25
53	0.25
54	0.26
55	0.27
56	0.26
57	0.22
58	0.23
59	0.28
60	0.25
61	0.26
62	0.27
63	0.3
64	0.33
65	0.33
66	0.36
67	0.37
68	0.39
69	0.43
70	0.44
71	0.38
72	0.36
73	0.36
74	0.3
75	0.24
76	0.21
77	0.17
78	0.17
79	0.17
80	0.16
81	0.17
82	0.19
83	0.21
84	0.21
85	0.21
86	0.25
87	0.27
88	0.27
89	0.27
90	0.32
91	0.37
92	0.43
93	0.49
94	0.46
95	0.48
96	0.51
97	0.52
98	0.49
99	0.44
100	0.37
101	0.34
102	0.33
103	0.32
104	0.29
105	0.25
106	0.22
107	0.18
108	0.18
109	0.14
110	0.13
111	0.12
112	0.12
113	0.16
114	0.22
115	0.22
116	0.25
117	0.29
118	0.34
119	0.37
120	0.45
121	0.48
122	0.48
123	0.55
124	0.6
125	0.62
126	0.58
127	0.54
128	0.47
129	0.4
130	0.37
131	0.3
132	0.22
133	0.2
134	0.2
135	0.17
136	0.15
137	0.15
138	0.14
139	0.12
140	0.12
141	0.08
142	0.13
143	0.16
144	0.17
145	0.19
146	0.19
147	0.2
148	0.21
149	0.24
150	0.19
151	0.19
152	0.2
153	0.19
154	0.18
155	0.17
156	0.15
157	0.11
158	0.1
159	0.08
160	0.05
161	0.06
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.13
166	0.15
167	0.16
168	0.23
169	0.24
170	0.28
171	0.33
172	0.37
173	0.36
174	0.38
175	0.42
176	0.39
177	0.38
178	0.35
179	0.34
180	0.33
181	0.36
182	0.4
183	0.4
184	0.41
185	0.48
186	0.51
187	0.47
188	0.46
189	0.49
190	0.45
191	0.44
192	0.41
193	0.32
194	0.26
195	0.3
196	0.28
197	0.21
198	0.16
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.1
207	0.1
208	0.11
209	0.12
210	0.13
211	0.15
212	0.19
213	0.2
214	0.22
215	0.21
216	0.2
217	0.19
218	0.21
219	0.21
220	0.2
221	0.23
222	0.24
223	0.26
224	0.3
225	0.31
226	0.31
227	0.34
228	0.31
229	0.31
230	0.35
231	0.33
232	0.33
233	0.39
234	0.39
235	0.42
236	0.46
237	0.45
238	0.46
239	0.48
240	0.47
241	0.42
242	0.39
243	0.33
244	0.29
245	0.3
246	0.24
247	0.22
248	0.2
249	0.18
250	0.19
251	0.17
252	0.18
253	0.17
254	0.17
255	0.16
256	0.18
257	0.24
258	0.29
259	0.36
260	0.36
261	0.36
262	0.37
263	0.35
264	0.35
265	0.33
266	0.31
267	0.28
268	0.25
269	0.26
270	0.28
271	0.31
272	0.31
273	0.3
274	0.28
275	0.25
276	0.27
277	0.26
278	0.24
279	0.21
280	0.18
281	0.15
282	0.13
283	0.19
284	0.17
285	0.16
286	0.14
287	0.15
288	0.18
289	0.24
290	0.24
291	0.19
292	0.19
293	0.19
294	0.25
295	0.26
296	0.23
297	0.2
298	0.22
299	0.21
300	0.25
301	0.25
302	0.19
303	0.17
304	0.16
305	0.15
306	0.15
307	0.13
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.09
312	0.11
313	0.12
314	0.09
315	0.14
316	0.16
317	0.17
318	0.18
319	0.18
320	0.17
321	0.18
322	0.19
323	0.17
324	0.21
325	0.2
326	0.19
327	0.22
328	0.23
329	0.21
330	0.22
331	0.27
332	0.24
333	0.31
334	0.33
335	0.32
336	0.31
337	0.35
338	0.33
339	0.26
340	0.24
341	0.19
342	0.16
343	0.15
344	0.13
345	0.09
346	0.1
347	0.11
348	0.11
349	0.11
350	0.1
351	0.09
352	0.11
353	0.12
354	0.13
355	0.13
356	0.12
357	0.11
358	0.12
359	0.12
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.11
365	0.11
366	0.13
367	0.13
368	0.15
369	0.2
370	0.18
371	0.19
372	0.23
373	0.25
374	0.25
375	0.29
376	0.31
377	0.29
378	0.36
379	0.38
380	0.39
381	0.41
382	0.43
383	0.45
384	0.47
385	0.48
386	0.43
387	0.43
388	0.4
389	0.43
390	0.41
391	0.36
392	0.31
393	0.31
394	0.3
395	0.26
396	0.23
397	0.21
398	0.18
399	0.17
400	0.15
401	0.12
402	0.12
403	0.15
404	0.17
405	0.16
406	0.21
407	0.25
408	0.31
409	0.33
410	0.35
411	0.37
412	0.36
413	0.33
414	0.37
415	0.34
416	0.27
417	0.24
418	0.22
419	0.17
420	0.16
421	0.16
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.09
432	0.15
433	0.23
434	0.32
435	0.42
436	0.49
437	0.54
438	0.61
439	0.63
440	0.66
441	0.67
442	0.66
443	0.56
444	0.48
445	0.45
446	0.37
447	0.34
448	0.26
449	0.17
450	0.1
451	0.1
452	0.12
453	0.12
454	0.13
455	0.12
456	0.12
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.11
461	0.1
462	0.12
463	0.11
464	0.11
465	0.1
466	0.11
467	0.13
468	0.13
469	0.16
470	0.17
471	0.19
472	0.2
473	0.2
474	0.2
475	0.19
476	0.19
477	0.16
478	0.13
479	0.12
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.07
484	0.09
485	0.09
486	0.11
487	0.12
488	0.11
489	0.13
490	0.12
491	0.16
492	0.16
493	0.17
494	0.2
495	0.2
496	0.23
497	0.24
498	0.24
499	0.21
500	0.21
501	0.22
502	0.17
503	0.16
504	0.13
505	0.11
506	0.1
507	0.09
508	0.07
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.08
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.12
520	0.12
521	0.12
522	0.13
523	0.12
524	0.12
525	0.16
526	0.17
527	0.17
528	0.18
529	0.19
530	0.18
531	0.18
532	0.19
533	0.17
534	0.18
535	0.18
536	0.25
537	0.23
538	0.23
539	0.24
540	0.22
541	0.2
542	0.22
543	0.24
544	0.18
545	0.19
546	0.2
547	0.19
548	0.23
549	0.23
550	0.27
551	0.32
552	0.35
553	0.35
554	0.34
555	0.32
556	0.28
557	0.3
558	0.25
559	0.19
560	0.18
561	0.18
562	0.18
563	0.18
564	0.17
565	0.14
566	0.15
567	0.16
568	0.14
569	0.14
570	0.13
571	0.13
572	0.13
573	0.13
574	0.13
575	0.13
576	0.2
577	0.2
578	0.19
579	0.19
580	0.19
581	0.21
582	0.2
583	0.16
584	0.09
585	0.08
586	0.08
587	0.06
588	0.06
589	0.05
590	0.04
591	0.04
592	0.06
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.1
598	0.1
599	0.12
600	0.11
601	0.11
602	0.13
603	0.14
604	0.15
605	0.15
606	0.15
607	0.15
608	0.15
609	0.14
610	0.12
611	0.13
612	0.13
613	0.13
614	0.12
615	0.12
616	0.13
617	0.12
618	0.12
619	0.11
620	0.09
621	0.13
622	0.15
623	0.15
624	0.14
625	0.14
626	0.14
627	0.15
628	0.15
629	0.13
630	0.15
631	0.19
632	0.2
633	0.23
634	0.23
635	0.25
636	0.25
637	0.26
638	0.25
639	0.2
640	0.22
641	0.18
642	0.18
643	0.16
644	0.17
645	0.15
646	0.13
647	0.13
648	0.1
649	0.19
650	0.21
651	0.22
652	0.27
653	0.32
654	0.39
655	0.47
656	0.57
657	0.59
658	0.61
659	0.65
660	0.69
661	0.68
662	0.63
663	0.59
664	0.53
665	0.46
666	0.43
667	0.38
668	0.3
669	0.27
670	0.25
671	0.19
672	0.15
673	0.12
674	0.13
675	0.15
676	0.18
677	0.22
678	0.29
679	0.34
680	0.4
681	0.46
682	0.53
683	0.61
684	0.68
685	0.73
686	0.72
687	0.79
688	0.83
689	0.87
690	0.86
691	0.81
692	0.81
693	0.77
694	0.71
695	0.67
696	0.64
697	0.58
698	0.59
699	0.58
700	0.5
701	0.51
702	0.56
703	0.54
704	0.55
705	0.5
706	0.42
707	0.39
708	0.37
709	0.31
710	0.23
711	0.2
712	0.12
713	0.14
714	0.15
715	0.14
716	0.15
717	0.18
718	0.2
719	0.2
720	0.25
721	0.26
722	0.25
723	0.25
724	0.24
725	0.22
726	0.22
727	0.22
728	0.22
729	0.18
730	0.18
731	0.21
732	0.22
733	0.24
734	0.25
735	0.28
736	0.25
737	0.28
738	0.3
739	0.3
740	0.29
741	0.27
742	0.24
743	0.21
744	0.19
745	0.16
746	0.12
747	0.09
748	0.07
749	0.07
750	0.06
751	0.05
752	0.05
753	0.06
754	0.06
755	0.07
756	0.09
757	0.09
758	0.11
759	0.15
760	0.16
761	0.16
762	0.17
763	0.21
764	0.24
765	0.29
766	0.29
767	0.32
768	0.38
769	0.37
770	0.36
771	0.32
772	0.28
773	0.24
774	0.23
775	0.19
776	0.15
777	0.18
778	0.18
779	0.19
780	0.19
781	0.19
782	0.18
783	0.22
784	0.23
785	0.26
786	0.27
787	0.25
788	0.27
789	0.27
790	0.28
791	0.23
792	0.22
793	0.23
794	0.3
795	0.32
796	0.33
797	0.42
798	0.42
799	0.47
800	0.55
801	0.58
802	0.6
803	0.67
804	0.75
805	0.77
806	0.85
807	0.86
808	0.8
809	0.77
810	0.73
811	0.74
812	0.72
813	0.69
814	0.7
815	0.7
816	0.69
817	0.66
818	0.66
819	0.61
820	0.58
821	0.55
822	0.48
823	0.45
824	0.47
825	0.52
826	0.48
827	0.43
828	0.37
829	0.34
830	0.33
831	0.28
832	0.24
833	0.15
834	0.13
835	0.12
836	0.12
837	0.12
838	0.1
839	0.11
840	0.11
841	0.11
842	0.12
843	0.12
844	0.12
845	0.09
846	0.1
847	0.09
848	0.08
849	0.08
850	0.1
851	0.11
852	0.12
853	0.14
854	0.13
855	0.15
856	0.15
857	0.18
858	0.17
859	0.18
860	0.21
861	0.24
862	0.28
863	0.29
864	0.33
865	0.36
866	0.38
867	0.37
868	0.37
869	0.38
870	0.35
871	0.39
872	0.42
873	0.41
874	0.46
875	0.46
876	0.45
877	0.41
878	0.39
879	0.37
880	0.34
881	0.34
882	0.27
883	0.26
884	0.24
885	0.28
886	0.32
887	0.35
888	0.34
889	0.36
890	0.39
891	0.4
892	0.45
893	0.45
894	0.47
895	0.42
896	0.42
897	0.41
898	0.42
899	0.47
900	0.51
901	0.53
902	0.53
903	0.54
904	0.54
905	0.52
906	0.56
907	0.54
908	0.54
909	0.57
910	0.61
911	0.68
912	0.73
913	0.75
914	0.77
915	0.84
916	0.8
917	0.76
918	0.69
919	0.63
920	0.62
921	0.56
922	0.49
923	0.4
924	0.36
925	0.3
926	0.27
927	0.23
928	0.17
929	0.17
930	0.17
931	0.17
932	0.16
933	0.19
934	0.21
935	0.24
936	0.27
937	0.28
938	0.3
939	0.28
940	0.28
941	0.32
942	0.28
943	0.28
944	0.28
945	0.27
946	0.24
947	0.25
948	0.3
949	0.26
950	0.31
951	0.33
952	0.36
953	0.36
954	0.37
955	0.37
956	0.32
957	0.3
958	0.28
959	0.24
960	0.18
961	0.17
962	0.14
963	0.12

Q2HHX8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer