Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AM56

Protein Details
Accession D4AM56    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
365-384ELKARKAKLKAQKAKAVAKVHydrophilic
393-414QEASSSSSKKPRTKLAKMKKATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-216KRVKAADKKR
331-349KKRKSIEGADAGKKSKKSK
367-379KARKAKLKAQKAK
401-413KKPRTKLAKMKKA
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 13.333, nucl 12, mito_nucl 6.833, cyto_pero 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG abe:ARB_04746  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAVSVVKTGSKYQLDADQNETGRLKQEKVLRASTALLSHIKAEDQRKAADSTVKKLPLGDDSDSEDDGSTGEHSPIWLILTTKKHLVDKNRMKPGKIAVPHSLNPSSTLNVCLITADPQRAFKDTIADPAFPPELAAKITKVIGFSKLRDRYKSFESRRQLLAEHDLFLADDRIILRLVNTLGKIFFKSSKRPIPVRLEEIQKVDGKRVKAADKKRPPTDEKIASVAAPAVVAREIERAIACVPVNLSPAATAALRVGWSNWPAQKLVENVSAVVEAMVDKYVARGWKNLKAVHVKGANTAAMPIWLADELWLEEGDVKEDEVKKVEDSSKKRKSIEGADAGKKSKKSKLLTSTVVERDEEEEEELKARKAKLKAQKAKAVAKVNGDALLLPQEASSSSSKKPRTKLAKMKKAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.39
3 0.41
4 0.4
5 0.39
6 0.42
7 0.4
8 0.33
9 0.34
10 0.35
11 0.32
12 0.31
13 0.38
14 0.42
15 0.47
16 0.51
17 0.45
18 0.44
19 0.44
20 0.41
21 0.34
22 0.29
23 0.25
24 0.21
25 0.22
26 0.2
27 0.2
28 0.24
29 0.27
30 0.31
31 0.32
32 0.34
33 0.35
34 0.36
35 0.37
36 0.4
37 0.38
38 0.36
39 0.41
40 0.41
41 0.38
42 0.37
43 0.37
44 0.33
45 0.35
46 0.32
47 0.25
48 0.28
49 0.3
50 0.29
51 0.28
52 0.22
53 0.17
54 0.15
55 0.13
56 0.1
57 0.08
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.15
67 0.19
68 0.22
69 0.26
70 0.29
71 0.33
72 0.37
73 0.45
74 0.5
75 0.56
76 0.64
77 0.7
78 0.7
79 0.66
80 0.64
81 0.62
82 0.6
83 0.54
84 0.49
85 0.45
86 0.48
87 0.49
88 0.51
89 0.46
90 0.37
91 0.35
92 0.32
93 0.27
94 0.22
95 0.21
96 0.16
97 0.14
98 0.14
99 0.11
100 0.1
101 0.13
102 0.14
103 0.16
104 0.17
105 0.2
106 0.21
107 0.23
108 0.25
109 0.21
110 0.24
111 0.21
112 0.28
113 0.27
114 0.27
115 0.24
116 0.26
117 0.25
118 0.19
119 0.19
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.17
131 0.19
132 0.21
133 0.29
134 0.37
135 0.39
136 0.43
137 0.45
138 0.43
139 0.49
140 0.57
141 0.54
142 0.55
143 0.57
144 0.57
145 0.56
146 0.53
147 0.46
148 0.38
149 0.39
150 0.31
151 0.26
152 0.21
153 0.18
154 0.17
155 0.16
156 0.14
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.16
174 0.18
175 0.24
176 0.31
177 0.37
178 0.42
179 0.44
180 0.5
181 0.52
182 0.53
183 0.52
184 0.49
185 0.46
186 0.43
187 0.42
188 0.37
189 0.32
190 0.28
191 0.27
192 0.26
193 0.22
194 0.23
195 0.24
196 0.28
197 0.33
198 0.41
199 0.47
200 0.53
201 0.6
202 0.63
203 0.66
204 0.64
205 0.64
206 0.64
207 0.58
208 0.5
209 0.45
210 0.4
211 0.34
212 0.29
213 0.22
214 0.13
215 0.08
216 0.06
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.13
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.17
252 0.19
253 0.18
254 0.21
255 0.2
256 0.18
257 0.17
258 0.17
259 0.16
260 0.13
261 0.11
262 0.07
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.07
270 0.1
271 0.11
272 0.16
273 0.2
274 0.27
275 0.32
276 0.34
277 0.38
278 0.43
279 0.43
280 0.45
281 0.45
282 0.39
283 0.36
284 0.36
285 0.31
286 0.23
287 0.22
288 0.14
289 0.1
290 0.1
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.13
307 0.15
308 0.16
309 0.17
310 0.18
311 0.17
312 0.21
313 0.28
314 0.32
315 0.39
316 0.49
317 0.56
318 0.61
319 0.62
320 0.62
321 0.62
322 0.61
323 0.62
324 0.61
325 0.58
326 0.59
327 0.61
328 0.6
329 0.58
330 0.55
331 0.5
332 0.48
333 0.49
334 0.48
335 0.54
336 0.6
337 0.63
338 0.64
339 0.64
340 0.65
341 0.6
342 0.56
343 0.47
344 0.38
345 0.33
346 0.3
347 0.26
348 0.21
349 0.17
350 0.16
351 0.2
352 0.2
353 0.2
354 0.23
355 0.25
356 0.3
357 0.34
358 0.42
359 0.49
360 0.59
361 0.67
362 0.71
363 0.77
364 0.77
365 0.8
366 0.79
367 0.77
368 0.7
369 0.64
370 0.59
371 0.52
372 0.45
373 0.37
374 0.29
375 0.21
376 0.21
377 0.16
378 0.13
379 0.11
380 0.1
381 0.11
382 0.14
383 0.17
384 0.17
385 0.23
386 0.32
387 0.41
388 0.48
389 0.54
390 0.61
391 0.68
392 0.75
393 0.8
394 0.83