Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AJZ0

Protein Details
Accession D4AJZ0    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-64IDSIASPEKKRKDKSESKKRKRQEQASETVVVDDGEKKKKKKKDKHLKKDEKQAVDGBasic
400-425AVEVQPSSTKEKKRRKREEGEEGEEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-29EKKRKDKSESKKRKR
43-78EKKKKKKKDKHLKKDEKQAVDGGGKGREKEASRKPL
409-416KEKKRRKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG abe:ARB_04591  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSMDAMEIDSIASPEKKRKDKSESKKRKRQEQASETVVVDDGEKKKKKKKDKHLKKDEKQAVDGGGKGREKEASRKPLSKASSNDKDTHSLSSTADQLPSFHRVTTTLYLPLSPIAISPTHAVSSLLAEHISPLLLTYYPPVRGVVLAYSNPSISATKPTPNATSAHTPNPEPLTLAKTAGEYGVLHTYLTLTFLVFRPERGQTLEGWINVQSEDFLGAIVFNLFSIGIERRRLPADWKWIAPGQQSDRPSTTSASPTSSSKDEEDDDDDEPDSDKENFKPLASNSEASQFEDAASAETGYFQTRSGKRVRGTIRFRVRDVDVIPGSERDKGFLSLEGTMLSKEDEEKLVTEERSKASGAGRAKSGDNYHDPTSTERQEAPDVDIDLDADEDEDVTMTEAVEVQPSSTKEKKRRKREEGEEGEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.35
3 0.44
4 0.51
5 0.6
6 0.68
7 0.75
8 0.83
9 0.86
10 0.88
11 0.9
12 0.93
13 0.93
14 0.93
15 0.93
16 0.92
17 0.92
18 0.9
19 0.87
20 0.81
21 0.75
22 0.65
23 0.54
24 0.44
25 0.33
26 0.25
27 0.23
28 0.24
29 0.31
30 0.38
31 0.45
32 0.53
33 0.63
34 0.73
35 0.77
36 0.83
37 0.85
38 0.89
39 0.93
40 0.95
41 0.97
42 0.95
43 0.95
44 0.93
45 0.86
46 0.78
47 0.69
48 0.62
49 0.52
50 0.46
51 0.38
52 0.35
53 0.31
54 0.29
55 0.27
56 0.28
57 0.29
58 0.36
59 0.42
60 0.46
61 0.52
62 0.57
63 0.59
64 0.62
65 0.64
66 0.62
67 0.59
68 0.59
69 0.61
70 0.6
71 0.61
72 0.55
73 0.55
74 0.49
75 0.46
76 0.38
77 0.3
78 0.27
79 0.25
80 0.26
81 0.22
82 0.22
83 0.19
84 0.18
85 0.19
86 0.23
87 0.21
88 0.18
89 0.17
90 0.17
91 0.21
92 0.23
93 0.22
94 0.2
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.18
99 0.14
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.07
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.09
142 0.14
143 0.15
144 0.18
145 0.21
146 0.23
147 0.24
148 0.24
149 0.25
150 0.23
151 0.28
152 0.27
153 0.3
154 0.29
155 0.28
156 0.29
157 0.3
158 0.26
159 0.2
160 0.19
161 0.16
162 0.15
163 0.16
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.13
191 0.18
192 0.19
193 0.16
194 0.16
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.02
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.06
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.13
219 0.15
220 0.16
221 0.19
222 0.22
223 0.3
224 0.31
225 0.3
226 0.31
227 0.31
228 0.32
229 0.29
230 0.29
231 0.24
232 0.27
233 0.28
234 0.28
235 0.28
236 0.28
237 0.27
238 0.24
239 0.22
240 0.2
241 0.19
242 0.19
243 0.2
244 0.19
245 0.21
246 0.21
247 0.2
248 0.18
249 0.19
250 0.17
251 0.17
252 0.19
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.14
258 0.14
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.12
263 0.11
264 0.16
265 0.17
266 0.16
267 0.2
268 0.19
269 0.24
270 0.25
271 0.25
272 0.21
273 0.26
274 0.27
275 0.24
276 0.24
277 0.17
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.16
291 0.18
292 0.22
293 0.28
294 0.33
295 0.34
296 0.42
297 0.49
298 0.51
299 0.56
300 0.62
301 0.67
302 0.64
303 0.63
304 0.59
305 0.54
306 0.49
307 0.42
308 0.4
309 0.3
310 0.28
311 0.27
312 0.25
313 0.25
314 0.24
315 0.23
316 0.17
317 0.18
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.19
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.12
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.12
335 0.15
336 0.19
337 0.19
338 0.21
339 0.23
340 0.24
341 0.25
342 0.24
343 0.24
344 0.22
345 0.27
346 0.28
347 0.27
348 0.28
349 0.28
350 0.29
351 0.31
352 0.32
353 0.32
354 0.33
355 0.35
356 0.35
357 0.35
358 0.35
359 0.36
360 0.41
361 0.38
362 0.36
363 0.33
364 0.34
365 0.36
366 0.36
367 0.34
368 0.31
369 0.28
370 0.26
371 0.24
372 0.2
373 0.16
374 0.15
375 0.11
376 0.07
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.14
392 0.16
393 0.24
394 0.31
395 0.4
396 0.49
397 0.6
398 0.7
399 0.76
400 0.86
401 0.89
402 0.92
403 0.93
404 0.94
405 0.92