FuNGI

D4B442

Protein Details

Accession

D4B442

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
338-362	EETVPKPRVKPKRVKDPRKKLQTEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
112-161	AARRTTRGGDRGRGRGRGRGGASGASGPLGEGTGPGRHGGAWKGKGGRSG
343-357	KPRVKPKRVKDPRKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	abe:ARB_03231 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPNPPPNRPPAGRGQPSSSESSSATPGPSGTGGTARGGSASARGRPVQRLQSLKKRTPGGSLVPLNADGSTPKPTLKFQPKVVTRKSKEEREALENLEAQRLRERISAANAARRTTRGGDRGRGRGRGRGGASGASGPLGEGTGPGRHGGAWKGKGGRSGKVSGFYGVKNEAGADGEQIGGDISSDEGSDHGLRFSIDHINLESDSEGETLEAGAVTKGKSSMGKSTPTGGSRGLRPVRVERHEHVERSVGIPAESSSSLSKSAELRKKAKEKAGAADDSLFVEDDQSESDVDGGDDDVVMGDIKESGPTADGPQIKAEPTDDDATIDDSVPPAPSEETVPKPRVKPKRVKDPRKKLQTEEERQEYDRYEEDIDYLKSTLGSISTTAGNAPDTSAAAEVGKKDEDDTEASAKPVTDERQGQLFLLQFPPMTPNLVPPTPEKNSAVGQGNEAVVETATPLPVAGTAPAAQGSATIKQEEGAVNPASTASTAPPLVTATNSTLPRGRVGKLNIHRSGKATIDWGGVSFELTKGSTVGFIQDAVILSDNMAGAPDGSASTRDKKLWAMSQVTGKFVVTPDWDKILDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.62
3	0.6
4	0.61
5	0.62
6	0.52
7	0.44
8	0.37
9	0.35
10	0.32
11	0.27
12	0.24
13	0.19
14	0.18
15	0.17
16	0.16
17	0.15
18	0.13
19	0.13
20	0.14
21	0.15
22	0.15
23	0.13
24	0.13
25	0.13
26	0.12
27	0.16
28	0.19
29	0.21
30	0.24
31	0.29
32	0.32
33	0.38
34	0.45
35	0.48
36	0.51
37	0.57
38	0.62
39	0.69
40	0.75
41	0.75
42	0.75
43	0.73
44	0.67
45	0.63
46	0.6
47	0.56
48	0.55
49	0.52
50	0.46
51	0.41
52	0.4
53	0.34
54	0.28
55	0.22
56	0.14
57	0.14
58	0.17
59	0.16
60	0.18
61	0.2
62	0.23
63	0.33
64	0.42
65	0.46
66	0.49
67	0.58
68	0.65
69	0.72
70	0.78
71	0.79
72	0.73
73	0.77
74	0.79
75	0.78
76	0.75
77	0.74
78	0.69
79	0.64
80	0.63
81	0.55
82	0.49
83	0.43
84	0.38
85	0.37
86	0.32
87	0.27
88	0.29
89	0.27
90	0.27
91	0.26
92	0.27
93	0.24
94	0.28
95	0.35
96	0.32
97	0.39
98	0.38
99	0.37
100	0.37
101	0.35
102	0.34
103	0.31
104	0.35
105	0.35
106	0.39
107	0.46
108	0.51
109	0.59
110	0.61
111	0.64
112	0.6
113	0.58
114	0.56
115	0.55
116	0.5
117	0.43
118	0.39
119	0.32
120	0.31
121	0.25
122	0.21
123	0.14
124	0.12
125	0.08
126	0.07
127	0.06
128	0.05
129	0.04
130	0.06
131	0.07
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.09
136	0.11
137	0.15
138	0.21
139	0.22
140	0.26
141	0.3
142	0.31
143	0.38
144	0.39
145	0.38
146	0.35
147	0.38
148	0.35
149	0.34
150	0.34
151	0.3
152	0.29
153	0.25
154	0.23
155	0.2
156	0.18
157	0.15
158	0.14
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.08
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.04
169	0.04
170	0.03
171	0.03
172	0.03
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.06
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.1
184	0.13
185	0.12
186	0.13
187	0.14
188	0.15
189	0.15
190	0.15
191	0.13
192	0.08
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.05
197	0.05
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.03
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.06
207	0.07
208	0.09
209	0.11
210	0.17
211	0.19
212	0.22
213	0.23
214	0.26
215	0.29
216	0.27
217	0.27
218	0.23
219	0.22
220	0.21
221	0.28
222	0.27
223	0.25
224	0.27
225	0.32
226	0.36
227	0.39
228	0.42
229	0.36
230	0.42
231	0.44
232	0.43
233	0.37
234	0.32
235	0.29
236	0.25
237	0.24
238	0.16
239	0.12
240	0.11
241	0.11
242	0.1
243	0.1
244	0.09
245	0.08
246	0.09
247	0.1
248	0.09
249	0.11
250	0.12
251	0.21
252	0.26
253	0.32
254	0.36
255	0.43
256	0.51
257	0.54
258	0.56
259	0.54
260	0.5
261	0.49
262	0.49
263	0.42
264	0.35
265	0.31
266	0.25
267	0.19
268	0.17
269	0.11
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.02
290	0.02
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.04
297	0.05
298	0.06
299	0.11
300	0.12
301	0.12
302	0.14
303	0.14
304	0.14
305	0.14
306	0.13
307	0.09
308	0.11
309	0.12
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.12
314	0.12
315	0.1
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.09
325	0.12
326	0.17
327	0.22
328	0.25
329	0.28
330	0.32
331	0.41
332	0.49
333	0.54
334	0.6
335	0.63
336	0.71
337	0.79
338	0.86
339	0.88
340	0.89
341	0.9
342	0.91
343	0.86
344	0.79
345	0.78
346	0.78
347	0.75
348	0.71
349	0.66
350	0.57
351	0.55
352	0.53
353	0.43
354	0.34
355	0.27
356	0.22
357	0.18
358	0.15
359	0.15
360	0.16
361	0.15
362	0.14
363	0.13
364	0.11
365	0.1
366	0.1
367	0.09
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.1
392	0.11
393	0.12
394	0.14
395	0.16
396	0.16
397	0.16
398	0.16
399	0.15
400	0.15
401	0.16
402	0.16
403	0.18
404	0.2
405	0.21
406	0.24
407	0.25
408	0.24
409	0.23
410	0.22
411	0.18
412	0.17
413	0.16
414	0.12
415	0.12
416	0.14
417	0.12
418	0.13
419	0.12
420	0.15
421	0.2
422	0.21
423	0.22
424	0.23
425	0.3
426	0.31
427	0.34
428	0.31
429	0.29
430	0.3
431	0.33
432	0.35
433	0.28
434	0.26
435	0.25
436	0.23
437	0.2
438	0.18
439	0.13
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.05
451	0.06
452	0.07
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.07
457	0.08
458	0.1
459	0.13
460	0.13
461	0.14
462	0.13
463	0.14
464	0.16
465	0.16
466	0.15
467	0.15
468	0.15
469	0.14
470	0.14
471	0.14
472	0.12
473	0.12
474	0.11
475	0.08
476	0.1
477	0.1
478	0.1
479	0.11
480	0.12
481	0.12
482	0.12
483	0.13
484	0.14
485	0.2
486	0.21
487	0.23
488	0.26
489	0.26
490	0.31
491	0.32
492	0.3
493	0.3
494	0.34
495	0.42
496	0.47
497	0.56
498	0.58
499	0.6
500	0.6
501	0.55
502	0.55
503	0.47
504	0.39
505	0.32
506	0.27
507	0.24
508	0.22
509	0.2
510	0.17
511	0.15
512	0.14
513	0.12
514	0.1
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.09
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.11
523	0.1
524	0.1
525	0.1
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.12
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.08
535	0.08
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.1
543	0.13
544	0.2
545	0.24
546	0.25
547	0.27
548	0.31
549	0.37
550	0.41
551	0.45
552	0.44
553	0.44
554	0.52
555	0.51
556	0.49
557	0.43
558	0.36
559	0.3
560	0.26
561	0.26
562	0.22
563	0.24
564	0.25
565	0.28

D4B442

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer