Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4ATX3

Protein Details
Accession D4ATX3    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-62WNNVRKGKVRTALRRPASKPHydrophilic
491-510GKESSRPIPGRGKRKGNRNTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
434-509PRSRSPESRYGGNHRRPPLPPSRGRGPPPPSRNPGRDRGKGRGGGGGGGGGGGSQRAGKESSRPIPGRGKRKGNRN
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG abe:ARB_07786  -  
Amino Acid Sequences MSGAAEDAACDSRTASVGLAPAKGAQRVTAQSEGAGQPPSVNWNNVRKGKVRTALRRPASKPVTASNSFNKVNGQYWRSGSASEDESEAGTRAEESNAVVKDGSDGDGDRSSDDSTDPSDVDDNDSSILLNMDQPSTENPQLEPQPVHTNEEQPPMPLDTTTTVEIKDETGQLEAEQPAIKDEDIDTTAQTAYTSKYSVPPQTIAELNAEDFKKQLKYILYNSSGNPDPSTPARCIECFREGHLSDICPNKKGSAAEVPCDLCGSDRHIESQCDLMWKQPHPTYTTGKLFISISCAQCASSQHLIGDCPSMRAPSHSTSWSLKAFDPSIISNTSLSSTGVPNGRTNGAIPQLKIKGRAQREPTPEEHELHIRSRPQPPSAPRSNIKFAEGLGRGRNLSSNQPRSNDSGSDRYTPRDSQRDYRERDQYFNPNSRPRSRSPESRYGGNHRRPPLPPSRGRGPPPPSRNPGRDRGKGRGGGGGGGGGGGSQRAGKESSRPIPGRGKRKGNRNT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.11
4 0.15
5 0.17
6 0.17
7 0.16
8 0.19
9 0.21
10 0.23
11 0.21
12 0.19
13 0.23
14 0.26
15 0.3
16 0.29
17 0.27
18 0.25
19 0.29
20 0.28
21 0.26
22 0.23
23 0.18
24 0.16
25 0.16
26 0.23
27 0.22
28 0.25
29 0.29
30 0.37
31 0.46
32 0.52
33 0.56
34 0.55
35 0.59
36 0.64
37 0.66
38 0.67
39 0.68
40 0.72
41 0.78
42 0.8
43 0.81
44 0.76
45 0.77
46 0.72
47 0.66
48 0.59
49 0.56
50 0.56
51 0.51
52 0.52
53 0.48
54 0.51
55 0.47
56 0.45
57 0.41
58 0.35
59 0.38
60 0.4
61 0.36
62 0.33
63 0.35
64 0.38
65 0.35
66 0.33
67 0.29
68 0.25
69 0.25
70 0.21
71 0.19
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.14
76 0.11
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.15
84 0.15
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.1
92 0.1
93 0.12
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.14
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.11
103 0.13
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.17
109 0.16
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.1
115 0.1
116 0.06
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.12
123 0.17
124 0.19
125 0.18
126 0.18
127 0.23
128 0.25
129 0.27
130 0.25
131 0.23
132 0.29
133 0.29
134 0.33
135 0.29
136 0.32
137 0.32
138 0.37
139 0.34
140 0.26
141 0.26
142 0.23
143 0.22
144 0.17
145 0.15
146 0.12
147 0.14
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.13
184 0.16
185 0.19
186 0.2
187 0.21
188 0.2
189 0.22
190 0.22
191 0.19
192 0.17
193 0.14
194 0.13
195 0.15
196 0.15
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.16
203 0.14
204 0.18
205 0.23
206 0.29
207 0.3
208 0.31
209 0.31
210 0.31
211 0.3
212 0.26
213 0.23
214 0.16
215 0.15
216 0.15
217 0.18
218 0.15
219 0.16
220 0.17
221 0.17
222 0.19
223 0.21
224 0.23
225 0.21
226 0.22
227 0.26
228 0.25
229 0.26
230 0.25
231 0.22
232 0.21
233 0.28
234 0.27
235 0.21
236 0.21
237 0.19
238 0.21
239 0.2
240 0.19
241 0.21
242 0.21
243 0.21
244 0.23
245 0.22
246 0.2
247 0.2
248 0.17
249 0.09
250 0.09
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.15
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.18
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.18
264 0.19
265 0.23
266 0.23
267 0.24
268 0.24
269 0.28
270 0.29
271 0.31
272 0.33
273 0.31
274 0.29
275 0.28
276 0.26
277 0.22
278 0.23
279 0.21
280 0.18
281 0.17
282 0.17
283 0.16
284 0.17
285 0.19
286 0.18
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.17
294 0.12
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.14
300 0.17
301 0.16
302 0.19
303 0.19
304 0.22
305 0.23
306 0.27
307 0.26
308 0.25
309 0.23
310 0.23
311 0.23
312 0.2
313 0.19
314 0.16
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.12
326 0.14
327 0.15
328 0.16
329 0.17
330 0.18
331 0.17
332 0.17
333 0.16
334 0.2
335 0.21
336 0.2
337 0.24
338 0.29
339 0.3
340 0.34
341 0.35
342 0.37
343 0.4
344 0.48
345 0.49
346 0.52
347 0.57
348 0.58
349 0.57
350 0.56
351 0.53
352 0.47
353 0.43
354 0.39
355 0.35
356 0.33
357 0.34
358 0.31
359 0.33
360 0.39
361 0.4
362 0.4
363 0.45
364 0.49
365 0.53
366 0.57
367 0.59
368 0.56
369 0.59
370 0.62
371 0.55
372 0.51
373 0.42
374 0.35
375 0.36
376 0.33
377 0.3
378 0.26
379 0.26
380 0.24
381 0.24
382 0.27
383 0.21
384 0.28
385 0.35
386 0.42
387 0.45
388 0.47
389 0.49
390 0.51
391 0.52
392 0.46
393 0.41
394 0.39
395 0.38
396 0.41
397 0.4
398 0.4
399 0.41
400 0.42
401 0.44
402 0.46
403 0.48
404 0.51
405 0.6
406 0.65
407 0.68
408 0.72
409 0.74
410 0.67
411 0.67
412 0.65
413 0.64
414 0.63
415 0.64
416 0.63
417 0.63
418 0.67
419 0.7
420 0.69
421 0.65
422 0.66
423 0.65
424 0.68
425 0.68
426 0.72
427 0.67
428 0.69
429 0.69
430 0.7
431 0.73
432 0.72
433 0.71
434 0.66
435 0.69
436 0.64
437 0.66
438 0.67
439 0.66
440 0.65
441 0.64
442 0.67
443 0.69
444 0.71
445 0.73
446 0.7
447 0.7
448 0.71
449 0.73
450 0.73
451 0.74
452 0.77
453 0.75
454 0.77
455 0.76
456 0.77
457 0.74
458 0.74
459 0.74
460 0.7
461 0.64
462 0.6
463 0.51
464 0.43
465 0.37
466 0.28
467 0.19
468 0.14
469 0.12
470 0.06
471 0.05
472 0.04
473 0.04
474 0.06
475 0.06
476 0.09
477 0.11
478 0.13
479 0.21
480 0.3
481 0.36
482 0.45
483 0.47
484 0.51
485 0.59
486 0.67
487 0.7
488 0.71
489 0.75
490 0.73