Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AMA1

Protein Details
Accession D4AMA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-184ADELREAERVRRRKRKQMKKLAERVDDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-176RVRRRKRKQMKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037212  Med7/Med21-like  
IPR021384  Mediator_Med21  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
KEGG abe:ARB_04791  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11221  Med21  
Amino Acid Sequences MADILTQLQTCLDQLATQFYATLCYLTTYHDHSPAIPPPNVPTAIPQLKKIPKNAPPNTPAAQPASGQAQVQDQKDQTPQQQQQQQQQQGGEGSGGAQDQNKDLPPRPDSPNTFAQRQRELARDLIIKEQQIEYLISVLPGIGSSEAEQEARIRQLADELREAERVRRRKRKQMKKLAERVDDLLEARNGVFEELPKGNPMAAVW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.14
3 0.15
4 0.14
5 0.15
6 0.13
7 0.16
8 0.15
9 0.15
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.13
14 0.16
15 0.18
16 0.2
17 0.23
18 0.23
19 0.23
20 0.27
21 0.31
22 0.34
23 0.3
24 0.28
25 0.28
26 0.32
27 0.32
28 0.27
29 0.24
30 0.28
31 0.34
32 0.35
33 0.34
34 0.39
35 0.45
36 0.49
37 0.52
38 0.52
39 0.52
40 0.62
41 0.65
42 0.63
43 0.59
44 0.61
45 0.57
46 0.5
47 0.43
48 0.35
49 0.31
50 0.24
51 0.22
52 0.19
53 0.18
54 0.16
55 0.14
56 0.17
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.19
61 0.2
62 0.24
63 0.26
64 0.25
65 0.3
66 0.33
67 0.37
68 0.43
69 0.46
70 0.51
71 0.57
72 0.57
73 0.5
74 0.46
75 0.4
76 0.34
77 0.29
78 0.2
79 0.11
80 0.08
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.07
88 0.08
89 0.1
90 0.12
91 0.16
92 0.18
93 0.22
94 0.27
95 0.31
96 0.33
97 0.36
98 0.42
99 0.42
100 0.44
101 0.43
102 0.42
103 0.39
104 0.39
105 0.38
106 0.32
107 0.31
108 0.27
109 0.27
110 0.25
111 0.23
112 0.24
113 0.23
114 0.2
115 0.19
116 0.18
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.04
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.16
143 0.19
144 0.2
145 0.21
146 0.22
147 0.23
148 0.26
149 0.27
150 0.28
151 0.34
152 0.41
153 0.49
154 0.58
155 0.64
156 0.72
157 0.83
158 0.87
159 0.9
160 0.91
161 0.92
162 0.92
163 0.94
164 0.92
165 0.87
166 0.79
167 0.7
168 0.62
169 0.52
170 0.42
171 0.35
172 0.26
173 0.21
174 0.17
175 0.16
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.1
180 0.15
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.19
185 0.18