Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B0M4

Protein Details
Accession D4B0M4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
485-508EGSDRPPVRRREQKQTWRRVQDDNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11cyto_nucl 11, cyto 9, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG abe:ARB_02000  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSGSSLESWAVPRLARLLPLDEESLKQVISYSSSLSKDECAVHLRNLLDDSPAALEFISAFNSRRGQSGQQSSNSSNGQGGRSGQIPKKPAGTKSQRGALKPPPTARQPEGYGDTSGGYTKPQREENYMASSSAVARGASESISPGSSSRNPSPAPSQSKNRLPPSATGPMISEYLPNVRSKKVPKNFGQHNTAPSSSSNNTAQKKTGRTATSNNTTTTTTTTNNIADITSAIAALEILTSNPSKTQARKCNCNASIHPLFAPAPNCTSCGKIICALEGIQPCSFCGTPILSSEEVEDMIRELRSERGNEKMRAHNDSFRRDDHVPAVTRLSSESNQKLTAAKAHRDKLLSFQAHNAQRTRILDEAADFDIPTSSSTQWMTPAQRALALKKQQRMLRELEEQSKPEWEKKNVVMSLEVKKGKLVRTYEKAEQPRVEDTDPDAIAEEAVEDTTESPELSVGEGTFSNNPLLKGAGLVRPTWKPSGEGSDRPPVRRREQKQTWRRVQDDNDDNEQWILDGGLHGHKRKKKYAVVLITVGRAFDLALRSINLLVNYFFFFFFFSLFFFFFMSKRGKCNRFDRFLQRHSLLLPRRWANWGLFPSPSGRCDVNGRAQVIRDTKRHLLALQSQQDRNNEPISLAAWGFTSGRFPRVQPGRANP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.23
4 0.24
5 0.24
6 0.27
7 0.29
8 0.26
9 0.26
10 0.26
11 0.24
12 0.2
13 0.17
14 0.16
15 0.14
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.2
20 0.22
21 0.24
22 0.24
23 0.24
24 0.24
25 0.25
26 0.24
27 0.25
28 0.26
29 0.28
30 0.31
31 0.3
32 0.28
33 0.29
34 0.26
35 0.22
36 0.19
37 0.18
38 0.15
39 0.14
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.09
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.16
49 0.21
50 0.21
51 0.24
52 0.27
53 0.3
54 0.37
55 0.46
56 0.48
57 0.49
58 0.54
59 0.52
60 0.54
61 0.49
62 0.4
63 0.34
64 0.3
65 0.26
66 0.23
67 0.23
68 0.2
69 0.23
70 0.3
71 0.31
72 0.34
73 0.36
74 0.37
75 0.43
76 0.46
77 0.46
78 0.5
79 0.55
80 0.58
81 0.6
82 0.66
83 0.62
84 0.6
85 0.63
86 0.61
87 0.6
88 0.58
89 0.58
90 0.56
91 0.57
92 0.61
93 0.58
94 0.54
95 0.49
96 0.47
97 0.47
98 0.43
99 0.38
100 0.31
101 0.28
102 0.23
103 0.21
104 0.16
105 0.14
106 0.16
107 0.21
108 0.25
109 0.31
110 0.34
111 0.39
112 0.44
113 0.45
114 0.47
115 0.43
116 0.38
117 0.32
118 0.29
119 0.24
120 0.21
121 0.17
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.13
134 0.17
135 0.23
136 0.25
137 0.3
138 0.3
139 0.33
140 0.39
141 0.43
142 0.47
143 0.47
144 0.53
145 0.56
146 0.64
147 0.69
148 0.68
149 0.65
150 0.58
151 0.55
152 0.54
153 0.52
154 0.44
155 0.36
156 0.32
157 0.28
158 0.27
159 0.24
160 0.17
161 0.11
162 0.14
163 0.15
164 0.18
165 0.18
166 0.2
167 0.26
168 0.33
169 0.42
170 0.47
171 0.54
172 0.58
173 0.66
174 0.73
175 0.73
176 0.73
177 0.66
178 0.62
179 0.57
180 0.5
181 0.42
182 0.33
183 0.32
184 0.26
185 0.26
186 0.28
187 0.31
188 0.35
189 0.35
190 0.39
191 0.39
192 0.42
193 0.41
194 0.43
195 0.39
196 0.39
197 0.43
198 0.47
199 0.49
200 0.48
201 0.45
202 0.4
203 0.37
204 0.34
205 0.3
206 0.25
207 0.18
208 0.17
209 0.19
210 0.17
211 0.16
212 0.16
213 0.13
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.1
231 0.13
232 0.19
233 0.29
234 0.37
235 0.43
236 0.51
237 0.55
238 0.63
239 0.62
240 0.62
241 0.54
242 0.52
243 0.49
244 0.41
245 0.37
246 0.28
247 0.26
248 0.23
249 0.23
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.17
254 0.16
255 0.17
256 0.15
257 0.16
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.16
265 0.15
266 0.16
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.15
271 0.14
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.14
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.09
291 0.11
292 0.14
293 0.14
294 0.22
295 0.28
296 0.32
297 0.35
298 0.38
299 0.39
300 0.43
301 0.43
302 0.41
303 0.4
304 0.42
305 0.41
306 0.35
307 0.38
308 0.33
309 0.32
310 0.28
311 0.28
312 0.24
313 0.22
314 0.22
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.13
320 0.16
321 0.18
322 0.18
323 0.18
324 0.19
325 0.19
326 0.17
327 0.22
328 0.2
329 0.24
330 0.28
331 0.3
332 0.32
333 0.33
334 0.32
335 0.31
336 0.36
337 0.31
338 0.26
339 0.27
340 0.32
341 0.34
342 0.37
343 0.32
344 0.25
345 0.27
346 0.28
347 0.27
348 0.2
349 0.17
350 0.15
351 0.14
352 0.15
353 0.13
354 0.12
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.11
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.17
370 0.16
371 0.19
372 0.2
373 0.21
374 0.25
375 0.3
376 0.33
377 0.36
378 0.42
379 0.41
380 0.43
381 0.44
382 0.4
383 0.38
384 0.4
385 0.38
386 0.39
387 0.39
388 0.37
389 0.34
390 0.35
391 0.32
392 0.32
393 0.35
394 0.32
395 0.35
396 0.37
397 0.44
398 0.39
399 0.38
400 0.35
401 0.33
402 0.35
403 0.36
404 0.34
405 0.27
406 0.28
407 0.3
408 0.3
409 0.32
410 0.32
411 0.32
412 0.37
413 0.43
414 0.47
415 0.52
416 0.53
417 0.52
418 0.49
419 0.44
420 0.42
421 0.4
422 0.35
423 0.28
424 0.25
425 0.25
426 0.23
427 0.2
428 0.17
429 0.13
430 0.12
431 0.11
432 0.09
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.09
451 0.1
452 0.11
453 0.12
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.1
458 0.11
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.15
463 0.18
464 0.2
465 0.23
466 0.24
467 0.22
468 0.21
469 0.22
470 0.3
471 0.31
472 0.33
473 0.35
474 0.43
475 0.45
476 0.48
477 0.52
478 0.5
479 0.54
480 0.6
481 0.62
482 0.64
483 0.71
484 0.78
485 0.81
486 0.86
487 0.87
488 0.85
489 0.82
490 0.78
491 0.73
492 0.72
493 0.7
494 0.65
495 0.6
496 0.52
497 0.49
498 0.41
499 0.35
500 0.25
501 0.17
502 0.11
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.12
507 0.16
508 0.21
509 0.29
510 0.35
511 0.41
512 0.49
513 0.56
514 0.57
515 0.63
516 0.69
517 0.69
518 0.68
519 0.66
520 0.59
521 0.53
522 0.46
523 0.36
524 0.26
525 0.18
526 0.13
527 0.11
528 0.11
529 0.09
530 0.1
531 0.11
532 0.12
533 0.13
534 0.15
535 0.13
536 0.12
537 0.12
538 0.12
539 0.13
540 0.14
541 0.12
542 0.11
543 0.11
544 0.1
545 0.11
546 0.1
547 0.09
548 0.11
549 0.11
550 0.12
551 0.11
552 0.12
553 0.12
554 0.16
555 0.22
556 0.22
557 0.3
558 0.39
559 0.45
560 0.52
561 0.62
562 0.67
563 0.67
564 0.73
565 0.76
566 0.75
567 0.74
568 0.75
569 0.66
570 0.58
571 0.53
572 0.55
573 0.51
574 0.47
575 0.5
576 0.45
577 0.46
578 0.48
579 0.49
580 0.43
581 0.45
582 0.43
583 0.38
584 0.35
585 0.34
586 0.34
587 0.34
588 0.32
589 0.28
590 0.23
591 0.23
592 0.28
593 0.33
594 0.37
595 0.4
596 0.42
597 0.4
598 0.41
599 0.45
600 0.47
601 0.48
602 0.44
603 0.45
604 0.48
605 0.5
606 0.5
607 0.45
608 0.44
609 0.47
610 0.52
611 0.54
612 0.56
613 0.55
614 0.58
615 0.61
616 0.58
617 0.53
618 0.45
619 0.37
620 0.3
621 0.27
622 0.23
623 0.22
624 0.18
625 0.14
626 0.11
627 0.12
628 0.13
629 0.12
630 0.18
631 0.17
632 0.21
633 0.23
634 0.24
635 0.33
636 0.41
637 0.47