Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AS17

Protein Details
Accession D4AS17    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-102FDARAEAKSKAKKRENRADDDDDAcidic
298-328LARLGKGLKHRPKWQNKSKKNQKRANGATEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-92KAKK
302-321GKGLKHRPKWQNKSKKNQKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
KEGG abe:ARB_07032  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MSSSYTRQKRGGEEDDSDGAEQSSSKKPRFDVRNPSALAPDALEDDAVLDADEFGHRGQKVRRNAVKVEGFESDSENEGFDARAEAKSKAKKRENRADDDDDMFAELEEDFAENDDEDETGGVKHKKQVRFLETDEIEGQVNSSRAGGKVTLDTRSAGGIGKGRAIDDDEEEDDDSGSDVGDDVRAALPTDVDKELGAGSKKQHAPLLDAFNMRAEQEEGRFDDAGNYVRKAMDPDAVHDSWLEGVSKKDMRKAKEAAEKREEERRQQSLVADKVLTSDVLKTLIQHLDRGETIIEALARLGKGLKHRPKWQNKSKKNQKRANGATEDVEMQEEDPKETEKKRAVEEITEAADMLLSRGQTDIYDTERELLTRMYQRETGEQWVDPPGPETTVDDGGDGENSEMWEFRWSDSRDGGIIHGPYDKPTMQSWSGAGYFSQGGAEFRVVGSSGPWNPGDPFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.5
3 0.47
4 0.4
5 0.32
6 0.25
7 0.19
8 0.16
9 0.15
10 0.22
11 0.28
12 0.32
13 0.35
14 0.39
15 0.49
16 0.58
17 0.63
18 0.65
19 0.65
20 0.7
21 0.68
22 0.66
23 0.59
24 0.5
25 0.41
26 0.31
27 0.24
28 0.17
29 0.15
30 0.13
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.06
36 0.05
37 0.04
38 0.05
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.12
43 0.12
44 0.18
45 0.26
46 0.33
47 0.43
48 0.53
49 0.6
50 0.61
51 0.63
52 0.67
53 0.65
54 0.59
55 0.53
56 0.45
57 0.39
58 0.34
59 0.33
60 0.25
61 0.21
62 0.19
63 0.16
64 0.13
65 0.12
66 0.12
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.12
71 0.14
72 0.17
73 0.24
74 0.34
75 0.41
76 0.49
77 0.58
78 0.64
79 0.72
80 0.8
81 0.81
82 0.8
83 0.81
84 0.77
85 0.7
86 0.64
87 0.54
88 0.43
89 0.35
90 0.26
91 0.18
92 0.12
93 0.08
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.11
109 0.13
110 0.14
111 0.21
112 0.29
113 0.33
114 0.41
115 0.49
116 0.5
117 0.53
118 0.55
119 0.58
120 0.51
121 0.49
122 0.41
123 0.33
124 0.27
125 0.21
126 0.18
127 0.11
128 0.11
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.14
137 0.15
138 0.17
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.11
145 0.1
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.13
154 0.1
155 0.12
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.18
188 0.2
189 0.21
190 0.23
191 0.21
192 0.24
193 0.26
194 0.3
195 0.25
196 0.24
197 0.23
198 0.22
199 0.22
200 0.17
201 0.14
202 0.1
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.12
220 0.14
221 0.13
222 0.15
223 0.2
224 0.2
225 0.2
226 0.18
227 0.17
228 0.12
229 0.13
230 0.11
231 0.06
232 0.06
233 0.1
234 0.14
235 0.14
236 0.21
237 0.25
238 0.28
239 0.33
240 0.36
241 0.4
242 0.46
243 0.51
244 0.52
245 0.54
246 0.53
247 0.49
248 0.55
249 0.5
250 0.47
251 0.48
252 0.44
253 0.39
254 0.38
255 0.38
256 0.35
257 0.34
258 0.29
259 0.22
260 0.19
261 0.18
262 0.17
263 0.15
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.11
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.15
275 0.16
276 0.16
277 0.16
278 0.13
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.15
291 0.25
292 0.35
293 0.4
294 0.5
295 0.61
296 0.71
297 0.79
298 0.84
299 0.85
300 0.86
301 0.9
302 0.92
303 0.92
304 0.92
305 0.9
306 0.87
307 0.87
308 0.84
309 0.81
310 0.74
311 0.65
312 0.56
313 0.48
314 0.41
315 0.3
316 0.23
317 0.15
318 0.11
319 0.14
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.18
325 0.2
326 0.27
327 0.29
328 0.32
329 0.34
330 0.4
331 0.39
332 0.38
333 0.38
334 0.35
335 0.3
336 0.26
337 0.23
338 0.16
339 0.15
340 0.12
341 0.1
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.09
349 0.1
350 0.12
351 0.14
352 0.14
353 0.16
354 0.17
355 0.17
356 0.15
357 0.15
358 0.16
359 0.21
360 0.23
361 0.24
362 0.27
363 0.29
364 0.33
365 0.34
366 0.35
367 0.31
368 0.29
369 0.27
370 0.28
371 0.27
372 0.23
373 0.23
374 0.18
375 0.16
376 0.16
377 0.18
378 0.17
379 0.18
380 0.18
381 0.16
382 0.16
383 0.15
384 0.15
385 0.12
386 0.09
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.22
396 0.24
397 0.28
398 0.3
399 0.31
400 0.27
401 0.27
402 0.27
403 0.23
404 0.21
405 0.19
406 0.21
407 0.2
408 0.21
409 0.25
410 0.24
411 0.22
412 0.23
413 0.29
414 0.26
415 0.28
416 0.26
417 0.26
418 0.26
419 0.24
420 0.21
421 0.18
422 0.16
423 0.15
424 0.15
425 0.11
426 0.11
427 0.13
428 0.13
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.1
434 0.11
435 0.16
436 0.17
437 0.21
438 0.21
439 0.22