Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B5Q0

Protein Details
Accession D4B5Q0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-140KMVCRKCYARLPPRATNCRKKKCGHTNQLRPKKKLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-140RPKKKLK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038587  L40e_sf  
IPR001975  Ribosomal_L40e  
IPR011332  Ribosomal_zn-bd  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR019956  Ubiquitin_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG abe:ARB_03807  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01020  Ribosomal_L40e  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50053  UBIQUITIN_2  
Amino Acid Sequences MRKADYVTPFVSIDSFVKNLSGNTLTLNAEPTDTISAIKSQVFERELVSVDEQRYVFGGKHIRDEFPLSEYGIQKESTLHLVLDLPGGIIEPSLKALASKFNCEKMVCRKCYARLPPRATNCRKKKCGHTNQLRPKKKLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.13
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.16
8 0.15
9 0.13
10 0.13
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.17
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.14
29 0.15
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.17
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.12
44 0.13
45 0.18
46 0.15
47 0.22
48 0.23
49 0.23
50 0.23
51 0.26
52 0.23
53 0.19
54 0.19
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.06
84 0.14
85 0.15
86 0.22
87 0.24
88 0.27
89 0.3
90 0.31
91 0.36
92 0.39
93 0.47
94 0.44
95 0.46
96 0.47
97 0.5
98 0.59
99 0.64
100 0.63
101 0.64
102 0.68
103 0.72
104 0.78
105 0.83
106 0.83
107 0.83
108 0.84
109 0.85
110 0.85
111 0.83
112 0.85
113 0.85
114 0.87
115 0.87
116 0.87
117 0.88
118 0.91
119 0.95
120 0.94