Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AZQ6

Protein Details
Accession D4AZQ6    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-45AVNEHPPSKKSKKTQEKPAKPEVATHydrophilic
66-90EKLSVKVDKKPTKELKPRKRAADFLHydrophilic
103-131EIAPKPKAEKKETQPKKKAKSEKPGVSAEHydrophilic
319-339KGANRRFKKTPWNQIEKRRLDHydrophilic
404-427IEDKKEETPKKKETKSKDEVEAKPBasic
443-474NIEAEKKSTEKRESKKSKKAEEKPKKVKKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-11TKRK
25-85HPPSKKSKKTQEKPAKPEVATVKASSTKSKKEKGIVNGAKSEKLSVKVDKKPTKELKPRKR
105-144APKPKAEKKETQPKKKAKSEKPGVSAESKEKIKKAKSKAK
211-223SKKAMKAIRKKKK
322-366NRRFKKTPWNQIEKRRLDAGKSREKWSKAISKESSKRAKKAEKMK
411-474TPKKKETKSKDEVEAKPVTNGKAIKEKKAEAGNIEAEKKSTEKRESKKSKKAEEKPKKVKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.666, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG abe:ARB_01674  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPEKKATKRKAPATTTAAPAVNEHPPSKKSKKTQEKPAKPEVATVKASSTKSKKEKGIVNGAKSEKLSVKVDKKPTKELKPRKRAADFLSDDDDEGEEPKQEIAPKPKAEKKETQPKKKAKSEKPGVSAESKEKIKKAKSKAKEVEEEPEEAPELVEEQFPPNSDADSDEEAEDDQTIALIRGFESSGDEDPSEDEGFEPGQEVPRIPDSKKAMKAIRKKKKESSAPEVPGTVYVGRIPHGFYEDEMRAYFSQFGDISRLRLSRNRTTGKSKHYAFIEFTSSSVAKVVAATMQNYLMFGHILKCMYIPQDKVHADMWKGANRRFKKTPWNQIEKRRLDAGKSREKWSKAISKESSKRAKKAEKMKALGYEYEIPKLKSVKEVPVALAVQDQIEEGTSAPVAAIEDKKEETPKKKETKSKDEVEAKPVTNGKAIKEKKAEAGNIEAEKKSTEKRESKKSKKAEEKPKKVKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.74
3 0.68
4 0.63
5 0.55
6 0.45
7 0.41
8 0.36
9 0.34
10 0.32
11 0.31
12 0.31
13 0.33
14 0.42
15 0.49
16 0.55
17 0.58
18 0.66
19 0.75
20 0.79
21 0.87
22 0.89
23 0.91
24 0.9
25 0.9
26 0.87
27 0.76
28 0.74
29 0.69
30 0.65
31 0.57
32 0.49
33 0.43
34 0.41
35 0.43
36 0.44
37 0.44
38 0.48
39 0.53
40 0.6
41 0.62
42 0.64
43 0.7
44 0.69
45 0.73
46 0.71
47 0.67
48 0.67
49 0.62
50 0.57
51 0.5
52 0.46
53 0.38
54 0.35
55 0.35
56 0.36
57 0.42
58 0.48
59 0.58
60 0.62
61 0.63
62 0.69
63 0.74
64 0.76
65 0.79
66 0.81
67 0.82
68 0.85
69 0.88
70 0.87
71 0.83
72 0.79
73 0.73
74 0.72
75 0.64
76 0.58
77 0.55
78 0.46
79 0.4
80 0.34
81 0.29
82 0.19
83 0.17
84 0.13
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.11
89 0.14
90 0.2
91 0.27
92 0.34
93 0.39
94 0.47
95 0.53
96 0.58
97 0.62
98 0.65
99 0.67
100 0.7
101 0.75
102 0.78
103 0.82
104 0.84
105 0.87
106 0.88
107 0.89
108 0.87
109 0.88
110 0.87
111 0.85
112 0.81
113 0.75
114 0.68
115 0.61
116 0.55
117 0.48
118 0.45
119 0.41
120 0.38
121 0.38
122 0.42
123 0.47
124 0.52
125 0.58
126 0.61
127 0.64
128 0.72
129 0.76
130 0.76
131 0.75
132 0.68
133 0.65
134 0.57
135 0.53
136 0.42
137 0.34
138 0.28
139 0.2
140 0.18
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.14
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.1
162 0.07
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.14
194 0.17
195 0.16
196 0.23
197 0.26
198 0.32
199 0.36
200 0.4
201 0.41
202 0.47
203 0.57
204 0.61
205 0.66
206 0.69
207 0.71
208 0.74
209 0.77
210 0.78
211 0.75
212 0.73
213 0.71
214 0.66
215 0.6
216 0.52
217 0.43
218 0.34
219 0.28
220 0.19
221 0.1
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.14
236 0.12
237 0.12
238 0.13
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.16
249 0.2
250 0.26
251 0.29
252 0.37
253 0.4
254 0.42
255 0.5
256 0.54
257 0.57
258 0.59
259 0.53
260 0.49
261 0.46
262 0.44
263 0.37
264 0.33
265 0.3
266 0.22
267 0.21
268 0.19
269 0.17
270 0.15
271 0.13
272 0.11
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.12
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.23
298 0.23
299 0.25
300 0.27
301 0.26
302 0.24
303 0.28
304 0.3
305 0.28
306 0.31
307 0.34
308 0.4
309 0.42
310 0.49
311 0.48
312 0.5
313 0.55
314 0.62
315 0.68
316 0.69
317 0.75
318 0.75
319 0.81
320 0.86
321 0.78
322 0.72
323 0.68
324 0.59
325 0.53
326 0.54
327 0.53
328 0.53
329 0.53
330 0.55
331 0.55
332 0.56
333 0.55
334 0.55
335 0.54
336 0.48
337 0.54
338 0.54
339 0.57
340 0.63
341 0.68
342 0.71
343 0.69
344 0.71
345 0.71
346 0.74
347 0.72
348 0.75
349 0.76
350 0.75
351 0.73
352 0.7
353 0.67
354 0.61
355 0.53
356 0.47
357 0.44
358 0.35
359 0.37
360 0.36
361 0.3
362 0.31
363 0.33
364 0.3
365 0.3
366 0.33
367 0.34
368 0.37
369 0.38
370 0.35
371 0.37
372 0.36
373 0.29
374 0.26
375 0.19
376 0.14
377 0.12
378 0.11
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.09
390 0.11
391 0.11
392 0.14
393 0.16
394 0.19
395 0.27
396 0.34
397 0.39
398 0.47
399 0.55
400 0.63
401 0.7
402 0.77
403 0.79
404 0.82
405 0.83
406 0.81
407 0.81
408 0.8
409 0.75
410 0.72
411 0.69
412 0.59
413 0.56
414 0.52
415 0.43
416 0.39
417 0.38
418 0.35
419 0.39
420 0.42
421 0.45
422 0.48
423 0.49
424 0.5
425 0.55
426 0.54
427 0.46
428 0.49
429 0.47
430 0.45
431 0.46
432 0.39
433 0.33
434 0.32
435 0.32
436 0.33
437 0.35
438 0.4
439 0.47
440 0.55
441 0.65
442 0.75
443 0.82
444 0.86
445 0.88
446 0.89
447 0.9
448 0.92
449 0.92
450 0.92
451 0.93
452 0.94
453 0.95
454 0.95