Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AJV7

Protein Details
Accession D4AJV7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
405-424LDDARKYRRTRSNDNQNRMHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
540-548GRSPRGRRG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001660  SAM  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
IPR037635  VTS1_SAM  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0043488  P:regulation of mRNA stability  
KEGG abe:ARB_04557  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07647  SAM_2  
CDD cd09556  SAM_VTS1_fungal  
Amino Acid Sequences MASHIIGNRNSTPEASKSSLRPPSSSRTLGGSHQLRASADMSGFAPPLSARNIRPASEVYFNQQSQGQNNADDALDRAAQQWLADIDQYETTLEEMAAATLDQDFKDELSAIEQWFRVLSEAERTAALYALLQQTTQVQIRFFIQVLQQMSQSHPMSSVLSPATFGEKDAMSNRLSDAMSKLNVEGSRNSLVRPPPSPGNKRNSGLDTSTINAMFPDAAAAIAKKKAELTQQTGNAPVSNRNSAVFSGDRSSLVAPTISTTDVGKDNLPQPPASPWTHRAPEQQAPIARPKSSSGQQQQQQQQQQQQQQPMGQFSQPLQSAGLRSPLSSGPSNIQSTTITAPDLMPEPPILSPYNVGNASWASMTNTPMVSSFNQQSQPNQADMIANATAMKLAALSTVNNRIALDDARKYRRTRSNDNQNRMHNQPPVSPGLPNTIPGTNVIMVNDSGQILNPQQVAALQAQQQAAISGRRSRPNSPGLALQGTPIQMNFTSPQNNGFLAAYDANAYLGNTLGGMGVGQFSGAGSHEGYLSDHSEIPRGRSPRGRRGSSKPPEDPTDPALLQDIPGWLRSLRLHKYTDNLKDLKWTELVELDDKGLEARGVNALGARNKMLKVTIPSYELPYPPFIRDLC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.36
4 0.36
5 0.44
6 0.51
7 0.5
8 0.5
9 0.49
10 0.53
11 0.56
12 0.55
13 0.47
14 0.43
15 0.43
16 0.43
17 0.47
18 0.42
19 0.38
20 0.37
21 0.37
22 0.33
23 0.33
24 0.3
25 0.23
26 0.19
27 0.17
28 0.16
29 0.16
30 0.15
31 0.12
32 0.12
33 0.1
34 0.12
35 0.16
36 0.2
37 0.2
38 0.29
39 0.33
40 0.33
41 0.36
42 0.36
43 0.36
44 0.38
45 0.38
46 0.34
47 0.39
48 0.37
49 0.36
50 0.37
51 0.36
52 0.32
53 0.38
54 0.33
55 0.26
56 0.27
57 0.27
58 0.22
59 0.2
60 0.18
61 0.14
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.06
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.1
97 0.13
98 0.12
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.15
108 0.16
109 0.17
110 0.16
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.14
115 0.08
116 0.1
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.16
123 0.19
124 0.17
125 0.14
126 0.15
127 0.17
128 0.19
129 0.18
130 0.16
131 0.15
132 0.19
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.2
137 0.21
138 0.26
139 0.25
140 0.2
141 0.18
142 0.18
143 0.19
144 0.18
145 0.2
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.16
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.14
156 0.15
157 0.17
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.17
171 0.18
172 0.17
173 0.18
174 0.22
175 0.21
176 0.22
177 0.23
178 0.25
179 0.27
180 0.28
181 0.28
182 0.31
183 0.4
184 0.48
185 0.51
186 0.55
187 0.58
188 0.59
189 0.59
190 0.54
191 0.48
192 0.41
193 0.36
194 0.29
195 0.24
196 0.24
197 0.19
198 0.16
199 0.12
200 0.11
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.12
214 0.18
215 0.23
216 0.27
217 0.31
218 0.34
219 0.34
220 0.36
221 0.33
222 0.28
223 0.25
224 0.24
225 0.21
226 0.2
227 0.2
228 0.18
229 0.19
230 0.18
231 0.2
232 0.15
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.12
253 0.15
254 0.17
255 0.18
256 0.17
257 0.16
258 0.18
259 0.22
260 0.22
261 0.22
262 0.23
263 0.28
264 0.3
265 0.31
266 0.34
267 0.34
268 0.37
269 0.36
270 0.36
271 0.32
272 0.32
273 0.37
274 0.34
275 0.29
276 0.25
277 0.24
278 0.25
279 0.26
280 0.33
281 0.32
282 0.37
283 0.41
284 0.48
285 0.53
286 0.55
287 0.57
288 0.53
289 0.54
290 0.53
291 0.56
292 0.53
293 0.49
294 0.44
295 0.41
296 0.38
297 0.33
298 0.27
299 0.2
300 0.17
301 0.14
302 0.16
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.15
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.15
315 0.14
316 0.15
317 0.13
318 0.16
319 0.17
320 0.15
321 0.15
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.12
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.07
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.12
357 0.11
358 0.13
359 0.14
360 0.16
361 0.2
362 0.2
363 0.22
364 0.26
365 0.27
366 0.24
367 0.22
368 0.2
369 0.16
370 0.15
371 0.16
372 0.1
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.03
380 0.03
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.08
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.14
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.17
394 0.23
395 0.29
396 0.34
397 0.35
398 0.43
399 0.5
400 0.54
401 0.59
402 0.63
403 0.69
404 0.74
405 0.8
406 0.79
407 0.76
408 0.74
409 0.67
410 0.62
411 0.55
412 0.47
413 0.42
414 0.38
415 0.37
416 0.33
417 0.29
418 0.25
419 0.26
420 0.24
421 0.22
422 0.21
423 0.17
424 0.16
425 0.16
426 0.18
427 0.14
428 0.14
429 0.12
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.09
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.11
445 0.1
446 0.12
447 0.12
448 0.15
449 0.15
450 0.16
451 0.15
452 0.14
453 0.15
454 0.15
455 0.15
456 0.19
457 0.24
458 0.31
459 0.35
460 0.38
461 0.43
462 0.47
463 0.48
464 0.43
465 0.42
466 0.38
467 0.36
468 0.32
469 0.26
470 0.22
471 0.19
472 0.17
473 0.13
474 0.12
475 0.1
476 0.12
477 0.13
478 0.14
479 0.18
480 0.18
481 0.21
482 0.21
483 0.21
484 0.2
485 0.19
486 0.15
487 0.14
488 0.14
489 0.11
490 0.11
491 0.1
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.04
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.08
516 0.09
517 0.1
518 0.11
519 0.12
520 0.14
521 0.15
522 0.2
523 0.21
524 0.25
525 0.31
526 0.32
527 0.35
528 0.43
529 0.51
530 0.55
531 0.64
532 0.67
533 0.67
534 0.72
535 0.78
536 0.78
537 0.8
538 0.75
539 0.72
540 0.7
541 0.66
542 0.62
543 0.55
544 0.52
545 0.42
546 0.36
547 0.32
548 0.26
549 0.23
550 0.21
551 0.19
552 0.13
553 0.14
554 0.15
555 0.13
556 0.16
557 0.2
558 0.27
559 0.31
560 0.35
561 0.39
562 0.4
563 0.48
564 0.54
565 0.57
566 0.57
567 0.53
568 0.48
569 0.53
570 0.52
571 0.48
572 0.41
573 0.34
574 0.27
575 0.29
576 0.31
577 0.24
578 0.23
579 0.21
580 0.18
581 0.17
582 0.16
583 0.13
584 0.11
585 0.09
586 0.09
587 0.11
588 0.11
589 0.11
590 0.13
591 0.17
592 0.2
593 0.22
594 0.23
595 0.24
596 0.25
597 0.26
598 0.26
599 0.26
600 0.29
601 0.32
602 0.32
603 0.33
604 0.34
605 0.38
606 0.41
607 0.38
608 0.33
609 0.36
610 0.35
611 0.33