Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B4R9

Protein Details
Accession D4B4R9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
205-225IVPPKVKGRKRNRITDKPLSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-215KGRKR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006164  Ku70/Ku80_beta-barrel_dom  
IPR036494  Ku_C_sf  
IPR014893  Ku_PK_bind  
IPR016194  SPOC-like_C_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
KEGG abe:ARB_03459  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02735  Ku  
PF08785  Ku_PK_bind  
Amino Acid Sequences MSNSNVIIAQRTNNKAIIALSSIIHALHEVESYAVGRLVTKDGKSPTLVLLAPSIDPDYECLLEVQLPFAEDVRCYRFPPLDRVTTMSGKVVKEHRNLPNENLLSAMEKYVENMELVQPGEEGVDQAIRWRAIHPTKPLPPIPKVLQKQSRQPDELMEHSKSALEQLIKTSDVKKGKLKPSIPRVGRGDLISPPSHHIFLLTAIIVPPKVKGRKRNRITDKPLSGLDVDALLQGEKRQRISPENAIPEFKQALANTDDINTVKESVKQMCAIIENQIKHSLGDANYDRVVEYIGTMRDELISFEEPDLYNDFIRELKRKLLDDKLGEDRRELWWLIRKKRIGLIDDKLVEISKVTEQEAKEVCIYPIPTPIFAVTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.32
4 0.28
5 0.22
6 0.19
7 0.16
8 0.15
9 0.15
10 0.13
11 0.12
12 0.1
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.09
24 0.1
25 0.15
26 0.19
27 0.19
28 0.24
29 0.26
30 0.29
31 0.3
32 0.3
33 0.26
34 0.26
35 0.26
36 0.21
37 0.19
38 0.18
39 0.16
40 0.16
41 0.15
42 0.11
43 0.1
44 0.11
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.14
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.25
64 0.29
65 0.31
66 0.39
67 0.41
68 0.4
69 0.39
70 0.42
71 0.43
72 0.4
73 0.38
74 0.33
75 0.32
76 0.26
77 0.3
78 0.33
79 0.36
80 0.38
81 0.45
82 0.49
83 0.53
84 0.55
85 0.53
86 0.55
87 0.49
88 0.44
89 0.36
90 0.29
91 0.23
92 0.21
93 0.18
94 0.1
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.07
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.18
119 0.23
120 0.29
121 0.32
122 0.37
123 0.43
124 0.48
125 0.51
126 0.49
127 0.46
128 0.47
129 0.46
130 0.47
131 0.45
132 0.49
133 0.53
134 0.52
135 0.59
136 0.61
137 0.62
138 0.55
139 0.52
140 0.47
141 0.42
142 0.43
143 0.38
144 0.3
145 0.25
146 0.23
147 0.22
148 0.18
149 0.16
150 0.13
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.18
159 0.2
160 0.23
161 0.28
162 0.34
163 0.4
164 0.47
165 0.5
166 0.52
167 0.58
168 0.65
169 0.59
170 0.57
171 0.54
172 0.48
173 0.44
174 0.37
175 0.29
176 0.22
177 0.24
178 0.18
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.14
184 0.12
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.12
196 0.19
197 0.24
198 0.35
199 0.45
200 0.56
201 0.63
202 0.73
203 0.76
204 0.8
205 0.83
206 0.83
207 0.75
208 0.66
209 0.6
210 0.5
211 0.4
212 0.3
213 0.21
214 0.12
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.11
222 0.13
223 0.14
224 0.17
225 0.2
226 0.25
227 0.31
228 0.36
229 0.39
230 0.43
231 0.43
232 0.42
233 0.39
234 0.37
235 0.32
236 0.25
237 0.22
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.18
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.13
246 0.15
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.15
251 0.17
252 0.18
253 0.2
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.2
258 0.17
259 0.21
260 0.23
261 0.22
262 0.23
263 0.26
264 0.25
265 0.23
266 0.24
267 0.22
268 0.17
269 0.23
270 0.23
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.21
275 0.17
276 0.17
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.18
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.2
301 0.23
302 0.23
303 0.29
304 0.33
305 0.37
306 0.42
307 0.47
308 0.5
309 0.48
310 0.51
311 0.55
312 0.56
313 0.53
314 0.49
315 0.42
316 0.37
317 0.38
318 0.33
319 0.28
320 0.31
321 0.4
322 0.47
323 0.54
324 0.55
325 0.55
326 0.61
327 0.62
328 0.58
329 0.57
330 0.54
331 0.54
332 0.52
333 0.48
334 0.43
335 0.36
336 0.31
337 0.23
338 0.2
339 0.15
340 0.16
341 0.17
342 0.21
343 0.21
344 0.29
345 0.3
346 0.3
347 0.29
348 0.29
349 0.28
350 0.28
351 0.3
352 0.23
353 0.29
354 0.28
355 0.26
356 0.26