Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4APQ0

Protein Details
Accession D4APQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-150CLAVQPQWRPRRKKDGDAAPAREHydrophilic
747-770ASTSGHPSPHKRKRQDHEEHSTEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
772-776RKKKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12, cyto 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG abe:ARB_06218  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MDIHRCRFVPYNPQAINALAFSHPPSNEIQGRGFPTLRLAIGRANGDIEIWNPLRGAWFQESILRGGKDRSIEGLAWTLDPSETIEGKEVAGKLRLFSIGYSSVVTEWDLESGRPARHSSGNYGEIWCLAVQPQWRPRRKKDGDAAPAREEGYLGQHLAVGCADGTIVILSTEDGDLKYLKTIRSSTKRTRVLSITFQNRHTVVAGYADSTIRVFDIRNGSLLRTISLGKGQEKHTKELLVWTVKCLPDGSIISGDSAGEVRIYDAKNYSLVQRLQGHQADVLDIAVSADGESIVSGGADQRTVLYKLKRREKQMTTRRWAEVMHRRYHTHDVKALAAFETKDISIVVSGGLDTTPVVLPLRELGKEHHRKLPNLPQIPQVSSSGASRLLMSWWDREVNIWRVAGSFGSDMEQHKLVGKILFQGDEHLTCATLSRDGTILAAATISEVRLFTLTPDEVDGFPSLRVHKIELPSRLASNGAKNVAISPDCKWLCVLRPNNDIYMAKLIREFKTNWILEVLPSLQKLTRLPRQTRVDKPLHGTLGSYERTVRCITFSGDSRIFACGDLAGYVDVWSLDRRNDDPATIQETEDANADSSDEDSDSDDEDSLPSGVWWKHTPSEAILPRLNSSVLLMTFRPTLEASNISKSKRTSTMPVPHESELCASDDRLMILTSEHHLTEFNALKGKLSDWARRNPKACMPSEFTIIKDRAMGAIWDIAGGRDRLWLYGPAWLWMFDLLQDYPEPQHASTSGHPSPHKRKRQDHEEHSTEGERKKKKTNTGAGDRVALADTEVGFGPAIKKGVGANGTNAELVPIESQKNDNSLPDDEDDDDDGDIDELALANEATLASLRRQQFPGVNGQAINGKSVLSGPEYRRSYADNEPVLGNHLSNGSGHGNQVAKLSTPEPESDHNAESRPRQWWSIFKYRDILGIVPLSHNSQSTVESADLSEAEDAKSVPLEVVVIERPIWDVDLPGRYIRDYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.41
4 0.31
5 0.26
6 0.16
7 0.16
8 0.17
9 0.2
10 0.19
11 0.19
12 0.22
13 0.27
14 0.31
15 0.33
16 0.32
17 0.33
18 0.37
19 0.4
20 0.38
21 0.31
22 0.3
23 0.3
24 0.28
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.24
29 0.25
30 0.22
31 0.2
32 0.19
33 0.18
34 0.17
35 0.14
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.18
43 0.23
44 0.2
45 0.21
46 0.21
47 0.26
48 0.27
49 0.27
50 0.32
51 0.28
52 0.25
53 0.25
54 0.28
55 0.26
56 0.26
57 0.26
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.25
62 0.22
63 0.2
64 0.19
65 0.16
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.2
76 0.19
77 0.18
78 0.22
79 0.21
80 0.2
81 0.21
82 0.22
83 0.19
84 0.18
85 0.19
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.16
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.11
94 0.09
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.15
99 0.18
100 0.2
101 0.21
102 0.23
103 0.25
104 0.3
105 0.33
106 0.34
107 0.37
108 0.39
109 0.38
110 0.37
111 0.33
112 0.28
113 0.26
114 0.2
115 0.13
116 0.11
117 0.12
118 0.15
119 0.23
120 0.32
121 0.41
122 0.5
123 0.59
124 0.67
125 0.75
126 0.78
127 0.8
128 0.81
129 0.81
130 0.82
131 0.83
132 0.8
133 0.71
134 0.66
135 0.56
136 0.46
137 0.36
138 0.26
139 0.21
140 0.17
141 0.14
142 0.12
143 0.14
144 0.13
145 0.14
146 0.13
147 0.09
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.19
169 0.24
170 0.32
171 0.41
172 0.49
173 0.55
174 0.62
175 0.69
176 0.68
177 0.7
178 0.65
179 0.61
180 0.61
181 0.6
182 0.6
183 0.56
184 0.55
185 0.53
186 0.48
187 0.44
188 0.36
189 0.28
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.11
203 0.17
204 0.17
205 0.2
206 0.21
207 0.21
208 0.24
209 0.24
210 0.19
211 0.15
212 0.16
213 0.14
214 0.16
215 0.19
216 0.19
217 0.24
218 0.28
219 0.35
220 0.38
221 0.41
222 0.4
223 0.38
224 0.35
225 0.36
226 0.37
227 0.36
228 0.33
229 0.32
230 0.35
231 0.34
232 0.34
233 0.29
234 0.23
235 0.2
236 0.21
237 0.2
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.14
243 0.1
244 0.09
245 0.07
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.18
257 0.19
258 0.2
259 0.24
260 0.27
261 0.28
262 0.33
263 0.34
264 0.32
265 0.27
266 0.26
267 0.21
268 0.17
269 0.15
270 0.08
271 0.06
272 0.06
273 0.04
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.08
290 0.11
291 0.16
292 0.21
293 0.28
294 0.37
295 0.47
296 0.53
297 0.58
298 0.66
299 0.7
300 0.74
301 0.77
302 0.79
303 0.76
304 0.76
305 0.7
306 0.61
307 0.54
308 0.52
309 0.52
310 0.48
311 0.48
312 0.45
313 0.45
314 0.49
315 0.57
316 0.53
317 0.47
318 0.44
319 0.38
320 0.38
321 0.37
322 0.33
323 0.24
324 0.2
325 0.16
326 0.13
327 0.12
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.08
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.13
352 0.24
353 0.32
354 0.35
355 0.42
356 0.44
357 0.46
358 0.52
359 0.59
360 0.57
361 0.54
362 0.52
363 0.5
364 0.48
365 0.48
366 0.42
367 0.33
368 0.24
369 0.21
370 0.19
371 0.14
372 0.12
373 0.11
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.11
383 0.13
384 0.18
385 0.19
386 0.2
387 0.19
388 0.18
389 0.17
390 0.18
391 0.16
392 0.12
393 0.08
394 0.06
395 0.07
396 0.08
397 0.09
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.11
410 0.13
411 0.13
412 0.12
413 0.13
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.09
418 0.07
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.04
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.1
446 0.1
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.14
455 0.18
456 0.22
457 0.24
458 0.27
459 0.26
460 0.26
461 0.24
462 0.22
463 0.19
464 0.17
465 0.16
466 0.14
467 0.13
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.12
472 0.11
473 0.1
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.18
478 0.17
479 0.2
480 0.28
481 0.32
482 0.28
483 0.33
484 0.34
485 0.34
486 0.35
487 0.31
488 0.24
489 0.25
490 0.2
491 0.16
492 0.18
493 0.2
494 0.18
495 0.21
496 0.21
497 0.19
498 0.27
499 0.27
500 0.24
501 0.23
502 0.22
503 0.19
504 0.19
505 0.16
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.09
510 0.1
511 0.12
512 0.17
513 0.22
514 0.29
515 0.32
516 0.4
517 0.48
518 0.54
519 0.58
520 0.6
521 0.58
522 0.52
523 0.54
524 0.48
525 0.41
526 0.34
527 0.28
528 0.22
529 0.22
530 0.2
531 0.17
532 0.15
533 0.14
534 0.16
535 0.17
536 0.15
537 0.12
538 0.12
539 0.14
540 0.15
541 0.16
542 0.2
543 0.2
544 0.2
545 0.19
546 0.19
547 0.18
548 0.14
549 0.12
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.06
562 0.07
563 0.09
564 0.1
565 0.15
566 0.15
567 0.15
568 0.16
569 0.17
570 0.22
571 0.2
572 0.19
573 0.17
574 0.17
575 0.17
576 0.16
577 0.14
578 0.09
579 0.08
580 0.09
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.05
586 0.06
587 0.06
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.08
598 0.08
599 0.11
600 0.12
601 0.14
602 0.16
603 0.18
604 0.19
605 0.17
606 0.25
607 0.26
608 0.29
609 0.28
610 0.27
611 0.27
612 0.27
613 0.25
614 0.16
615 0.13
616 0.11
617 0.09
618 0.1
619 0.09
620 0.1
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.1
625 0.1
626 0.11
627 0.15
628 0.16
629 0.22
630 0.26
631 0.26
632 0.29
633 0.29
634 0.31
635 0.32
636 0.33
637 0.31
638 0.37
639 0.45
640 0.46
641 0.49
642 0.49
643 0.45
644 0.43
645 0.38
646 0.3
647 0.22
648 0.19
649 0.15
650 0.11
651 0.12
652 0.12
653 0.11
654 0.1
655 0.09
656 0.07
657 0.07
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.1
665 0.15
666 0.17
667 0.16
668 0.19
669 0.19
670 0.2
671 0.2
672 0.2
673 0.2
674 0.23
675 0.3
676 0.31
677 0.41
678 0.48
679 0.54
680 0.56
681 0.54
682 0.56
683 0.55
684 0.53
685 0.49
686 0.47
687 0.42
688 0.45
689 0.42
690 0.36
691 0.36
692 0.34
693 0.28
694 0.22
695 0.21
696 0.16
697 0.16
698 0.14
699 0.08
700 0.09
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.07
705 0.08
706 0.09
707 0.08
708 0.1
709 0.1
710 0.11
711 0.12
712 0.14
713 0.13
714 0.18
715 0.18
716 0.16
717 0.16
718 0.16
719 0.15
720 0.13
721 0.13
722 0.08
723 0.11
724 0.09
725 0.09
726 0.09
727 0.1
728 0.11
729 0.14
730 0.15
731 0.12
732 0.14
733 0.14
734 0.18
735 0.2
736 0.27
737 0.26
738 0.29
739 0.33
740 0.4
741 0.5
742 0.57
743 0.64
744 0.66
745 0.74
746 0.79
747 0.86
748 0.88
749 0.87
750 0.86
751 0.8
752 0.73
753 0.67
754 0.61
755 0.55
756 0.49
757 0.48
758 0.45
759 0.46
760 0.53
761 0.57
762 0.63
763 0.68
764 0.72
765 0.73
766 0.76
767 0.78
768 0.7
769 0.65
770 0.55
771 0.45
772 0.36
773 0.26
774 0.16
775 0.1
776 0.09
777 0.08
778 0.08
779 0.07
780 0.07
781 0.08
782 0.09
783 0.09
784 0.1
785 0.09
786 0.1
787 0.1
788 0.14
789 0.18
790 0.17
791 0.18
792 0.2
793 0.21
794 0.2
795 0.19
796 0.15
797 0.11
798 0.11
799 0.1
800 0.1
801 0.11
802 0.12
803 0.14
804 0.15
805 0.19
806 0.19
807 0.19
808 0.21
809 0.22
810 0.23
811 0.23
812 0.24
813 0.21
814 0.22
815 0.21
816 0.18
817 0.16
818 0.13
819 0.12
820 0.1
821 0.08
822 0.06
823 0.05
824 0.04
825 0.04
826 0.05
827 0.04
828 0.04
829 0.04
830 0.04
831 0.04
832 0.05
833 0.07
834 0.08
835 0.15
836 0.18
837 0.23
838 0.25
839 0.28
840 0.32
841 0.34
842 0.42
843 0.39
844 0.38
845 0.34
846 0.33
847 0.35
848 0.3
849 0.29
850 0.19
851 0.15
852 0.13
853 0.14
854 0.14
855 0.13
856 0.2
857 0.22
858 0.31
859 0.34
860 0.35
861 0.36
862 0.37
863 0.38
864 0.4
865 0.45
866 0.37
867 0.37
868 0.36
869 0.34
870 0.35
871 0.31
872 0.23
873 0.15
874 0.14
875 0.13
876 0.12
877 0.15
878 0.14
879 0.15
880 0.15
881 0.18
882 0.19
883 0.19
884 0.21
885 0.19
886 0.16
887 0.18
888 0.19
889 0.18
890 0.19
891 0.2
892 0.22
893 0.25
894 0.31
895 0.32
896 0.34
897 0.32
898 0.33
899 0.36
900 0.38
901 0.39
902 0.37
903 0.37
904 0.39
905 0.41
906 0.47
907 0.5
908 0.56
909 0.55
910 0.53
911 0.55
912 0.51
913 0.5
914 0.44
915 0.36
916 0.29
917 0.29
918 0.26
919 0.23
920 0.23
921 0.22
922 0.21
923 0.21
924 0.19
925 0.17
926 0.18
927 0.18
928 0.19
929 0.16
930 0.16
931 0.16
932 0.15
933 0.13
934 0.13
935 0.13
936 0.11
937 0.11
938 0.12
939 0.11
940 0.11
941 0.11
942 0.11
943 0.09
944 0.08
945 0.08
946 0.07
947 0.1
948 0.11
949 0.12
950 0.12
951 0.12
952 0.13
953 0.14
954 0.15
955 0.12
956 0.12
957 0.16
958 0.2
959 0.22
960 0.23
961 0.24