FuNGI

D4B0C8

Protein Details

Accession

D4B0C8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
413-432	LCTYDKVQRVKSKWKCVLKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 15, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004855 TFIIA_asu/bsu IPR009088 TFIIA_b-brl
Gene Ontology	GO:0005672 C:transcription factor TFIIA complex GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	abe:ARB_01902 -
Pfam	View protein in Pfam PF03153 TFIIA
CDD	cd07976 TFIIA_alpha_beta_like

Amino Acid Sequences

MVFDRVIQEVCDSSQIDFEESGVDQHTLEELRKVGISCLCRLASHNPCPGLFVGAEKYEGDFLRGWQSKLSSLGVAHFPWDPAPQPPVSQPQATQQQSPIPPPSTIPSNDARMNPQPQLHPQQQQQPQQQQQQQQQQQQSHIPQHAGLQSANDHQSGDTFVKAEGGFSPPPPGPPAGTILAQQRAANALHQKYGNAAANQVQHLQSHSQAALSLPGGQPRYNPPPMSTSKPQDFRPPQAQAQIQPQGQAPGQQQTQPQRLPQTGIQNSQTDGASDDLSDWKAEVQRRREAAAKNGPENDRRLRDLVESRNLQLEGGGLLAPLHERYPNANGKKRKIVKFDDLDSLSNQTGASSVVPSSSTPTEAPSHPQFDGPDDYPVKKDDDEDAINSDLDDPDDLLDEEQGEDDAVGQVMLCTYDKVQRVKSKWKCVLKDGILTSDGKECVFPSSTIQFIFSNLSSRYVFHKGTGEFEWY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.19
3	0.19
4	0.17
5	0.17
6	0.15
7	0.14
8	0.15
9	0.13
10	0.13
11	0.11
12	0.11
13	0.13
14	0.13
15	0.13
16	0.15
17	0.14
18	0.15
19	0.17
20	0.18
21	0.19
22	0.23
23	0.25
24	0.25
25	0.3
26	0.29
27	0.28
28	0.31
29	0.36
30	0.4
31	0.45
32	0.49
33	0.46
34	0.45
35	0.46
36	0.43
37	0.36
38	0.27
39	0.22
40	0.19
41	0.17
42	0.19
43	0.16
44	0.17
45	0.18
46	0.18
47	0.17
48	0.15
49	0.15
50	0.24
51	0.27
52	0.27
53	0.26
54	0.28
55	0.27
56	0.3
57	0.3
58	0.21
59	0.19
60	0.21
61	0.21
62	0.19
63	0.19
64	0.17
65	0.16
66	0.15
67	0.17
68	0.15
69	0.15
70	0.19
71	0.18
72	0.19
73	0.23
74	0.29
75	0.31
76	0.31
77	0.29
78	0.34
79	0.43
80	0.43
81	0.41
82	0.36
83	0.4
84	0.4
85	0.43
86	0.41
87	0.33
88	0.32
89	0.31
90	0.32
91	0.3
92	0.29
93	0.29
94	0.27
95	0.3
96	0.34
97	0.33
98	0.35
99	0.36
100	0.39
101	0.38
102	0.38
103	0.36
104	0.39
105	0.45
106	0.46
107	0.46
108	0.47
109	0.53
110	0.58
111	0.63
112	0.65
113	0.67
114	0.68
115	0.7
116	0.72
117	0.7
118	0.71
119	0.72
120	0.71
121	0.69
122	0.68
123	0.62
124	0.6
125	0.58
126	0.55
127	0.5
128	0.45
129	0.38
130	0.32
131	0.32
132	0.3
133	0.26
134	0.2
135	0.16
136	0.15
137	0.18
138	0.19
139	0.16
140	0.14
141	0.12
142	0.13
143	0.14
144	0.13
145	0.1
146	0.09
147	0.09
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.1
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.16
156	0.14
157	0.15
158	0.16
159	0.16
160	0.13
161	0.13
162	0.16
163	0.14
164	0.15
165	0.16
166	0.18
167	0.2
168	0.2
169	0.18
170	0.15
171	0.16
172	0.15
173	0.16
174	0.19
175	0.17
176	0.19
177	0.19
178	0.19
179	0.18
180	0.22
181	0.22
182	0.16
183	0.16
184	0.17
185	0.19
186	0.19
187	0.2
188	0.16
189	0.13
190	0.15
191	0.15
192	0.12
193	0.12
194	0.11
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.09
201	0.08
202	0.11
203	0.12
204	0.12
205	0.13
206	0.17
207	0.24
208	0.25
209	0.25
210	0.23
211	0.28
212	0.31
213	0.37
214	0.36
215	0.35
216	0.38
217	0.41
218	0.41
219	0.46
220	0.46
221	0.45
222	0.46
223	0.45
224	0.4
225	0.42
226	0.42
227	0.34
228	0.36
229	0.36
230	0.3
231	0.27
232	0.26
233	0.22
234	0.21
235	0.22
236	0.18
237	0.16
238	0.17
239	0.18
240	0.22
241	0.26
242	0.32
243	0.29
244	0.31
245	0.3
246	0.31
247	0.31
248	0.31
249	0.34
250	0.31
251	0.33
252	0.33
253	0.3
254	0.3
255	0.29
256	0.25
257	0.15
258	0.13
259	0.11
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.11
269	0.16
270	0.22
271	0.26
272	0.32
273	0.34
274	0.36
275	0.4
276	0.39
277	0.43
278	0.45
279	0.44
280	0.41
281	0.45
282	0.45
283	0.42
284	0.45
285	0.43
286	0.38
287	0.36
288	0.34
289	0.31
290	0.33
291	0.36
292	0.37
293	0.38
294	0.36
295	0.35
296	0.36
297	0.35
298	0.3
299	0.23
300	0.17
301	0.1
302	0.09
303	0.08
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.1
313	0.17
314	0.25
315	0.33
316	0.4
317	0.47
318	0.52
319	0.62
320	0.68
321	0.69
322	0.68
323	0.68
324	0.69
325	0.67
326	0.65
327	0.62
328	0.55
329	0.49
330	0.42
331	0.38
332	0.28
333	0.23
334	0.19
335	0.12
336	0.1
337	0.09
338	0.09
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.11
345	0.12
346	0.13
347	0.12
348	0.15
349	0.18
350	0.19
351	0.25
352	0.26
353	0.29
354	0.28
355	0.29
356	0.27
357	0.28
358	0.32
359	0.27
360	0.29
361	0.28
362	0.29
363	0.29
364	0.3
365	0.29
366	0.24
367	0.25
368	0.21
369	0.24
370	0.25
371	0.24
372	0.26
373	0.24
374	0.23
375	0.21
376	0.19
377	0.13
378	0.12
379	0.1
380	0.08
381	0.07
382	0.08
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.06
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.08
403	0.15
404	0.21
405	0.26
406	0.33
407	0.42
408	0.48
409	0.58
410	0.66
411	0.71
412	0.75
413	0.8
414	0.77
415	0.75
416	0.78
417	0.72
418	0.71
419	0.62
420	0.56
421	0.48
422	0.44
423	0.39
424	0.34
425	0.29
426	0.22
427	0.2
428	0.17
429	0.19
430	0.21
431	0.2
432	0.2
433	0.23
434	0.24
435	0.24
436	0.26
437	0.22
438	0.21
439	0.25
440	0.2
441	0.22
442	0.21
443	0.25
444	0.23
445	0.24
446	0.28
447	0.31
448	0.31
449	0.29
450	0.35
451	0.32
452	0.36

D4B0C8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer