Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AMH0

Protein Details
Accession D4AMH0    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
160-179STPKASPSKPTSRRRRTTGGHydrophilic
244-269SPDTNHQQPPRKRRRVYRKGKEVNVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-189PSKPTSRRRRTTGGAKPRNSRRSG
253-263PRKRRRVYRKG
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG abe:ARB_05423  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15502  PHD_Phf1p_Phf2p_like  
Amino Acid Sequences MGSNTEFAAMPPPPTAPYTTDTNPGMINETQNTQILDIPAESVTFSHEGLDNNVSIPSMTYASSSSELSSISSTSTHEGHNSTMVASGEGPNIKAKELNISAAKPDLPLKYSNPLIGWRNIAPAPPSPATALSPSSATIAPGSAVGAISSTVGSTVPIMSTPKASPSKPTSRRRRTTGGAKPRNSRRSGRYGDRNDDEGVIKAEDTDSDESSDAQLTTTQTKSGRQIHRPTMFTPEQVQKKSVSPDTNHQQPPRKRRRVYRKGKEVNVVCLRCDRGHSPRCNAIVFCDDCNAPWHQFCHDPPIGDDVISVKNKEWFCGECRPIDTPLDLTLKPNGQTREQNGLRTSISPSMQTSGPQTPTLLAGSQLSRVEKKSYFSSLSHAALVNLLVDISDSRPDIPIFPANLNELNTASFSSSTSTISSSIVSNGLAGGSQQYKILGQATTSTPPSSKRPSESVPASTRNGIGENSDEEEVEEHRLYPKPGNGFRLPPDSEDIDMLLEDPSSTTFSHALHGSSKAIAETNHMQIVGGIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.2
4 0.22
5 0.28
6 0.29
7 0.34
8 0.33
9 0.32
10 0.31
11 0.28
12 0.29
13 0.24
14 0.25
15 0.21
16 0.22
17 0.23
18 0.24
19 0.24
20 0.2
21 0.21
22 0.18
23 0.17
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.09
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.14
35 0.15
36 0.18
37 0.2
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.15
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.13
50 0.15
51 0.15
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.19
68 0.18
69 0.15
70 0.17
71 0.16
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.22
84 0.22
85 0.27
86 0.26
87 0.26
88 0.27
89 0.27
90 0.26
91 0.2
92 0.23
93 0.2
94 0.19
95 0.21
96 0.23
97 0.27
98 0.28
99 0.28
100 0.25
101 0.29
102 0.3
103 0.3
104 0.3
105 0.25
106 0.28
107 0.26
108 0.27
109 0.23
110 0.22
111 0.26
112 0.23
113 0.23
114 0.2
115 0.21
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.11
148 0.11
149 0.18
150 0.21
151 0.22
152 0.27
153 0.34
154 0.44
155 0.51
156 0.62
157 0.66
158 0.73
159 0.8
160 0.8
161 0.79
162 0.76
163 0.76
164 0.76
165 0.76
166 0.75
167 0.73
168 0.76
169 0.79
170 0.79
171 0.74
172 0.7
173 0.65
174 0.65
175 0.66
176 0.66
177 0.66
178 0.65
179 0.67
180 0.63
181 0.59
182 0.5
183 0.44
184 0.36
185 0.27
186 0.21
187 0.15
188 0.12
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.09
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.22
210 0.3
211 0.35
212 0.4
213 0.47
214 0.53
215 0.58
216 0.57
217 0.52
218 0.51
219 0.45
220 0.38
221 0.36
222 0.35
223 0.35
224 0.34
225 0.34
226 0.28
227 0.3
228 0.33
229 0.33
230 0.3
231 0.26
232 0.33
233 0.37
234 0.44
235 0.46
236 0.47
237 0.51
238 0.54
239 0.63
240 0.67
241 0.71
242 0.69
243 0.74
244 0.81
245 0.83
246 0.87
247 0.87
248 0.86
249 0.85
250 0.83
251 0.8
252 0.7
253 0.67
254 0.63
255 0.53
256 0.42
257 0.36
258 0.34
259 0.27
260 0.27
261 0.23
262 0.24
263 0.32
264 0.35
265 0.37
266 0.41
267 0.42
268 0.41
269 0.37
270 0.3
271 0.28
272 0.25
273 0.22
274 0.18
275 0.16
276 0.15
277 0.17
278 0.17
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.17
284 0.17
285 0.23
286 0.22
287 0.21
288 0.21
289 0.24
290 0.22
291 0.19
292 0.18
293 0.12
294 0.16
295 0.16
296 0.16
297 0.12
298 0.18
299 0.18
300 0.19
301 0.19
302 0.17
303 0.2
304 0.28
305 0.29
306 0.26
307 0.28
308 0.29
309 0.29
310 0.28
311 0.24
312 0.17
313 0.19
314 0.2
315 0.18
316 0.17
317 0.18
318 0.19
319 0.2
320 0.24
321 0.23
322 0.23
323 0.28
324 0.31
325 0.38
326 0.37
327 0.39
328 0.36
329 0.36
330 0.32
331 0.29
332 0.28
333 0.21
334 0.2
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.17
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.2
343 0.19
344 0.19
345 0.17
346 0.18
347 0.18
348 0.14
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.12
353 0.14
354 0.15
355 0.16
356 0.17
357 0.21
358 0.21
359 0.24
360 0.25
361 0.28
362 0.29
363 0.28
364 0.3
365 0.3
366 0.3
367 0.28
368 0.25
369 0.2
370 0.17
371 0.16
372 0.12
373 0.07
374 0.06
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.14
386 0.18
387 0.18
388 0.19
389 0.19
390 0.2
391 0.22
392 0.22
393 0.2
394 0.16
395 0.14
396 0.14
397 0.13
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.12
425 0.14
426 0.11
427 0.1
428 0.13
429 0.16
430 0.19
431 0.2
432 0.2
433 0.2
434 0.23
435 0.3
436 0.35
437 0.37
438 0.39
439 0.43
440 0.46
441 0.53
442 0.55
443 0.56
444 0.54
445 0.54
446 0.52
447 0.48
448 0.44
449 0.37
450 0.33
451 0.26
452 0.21
453 0.19
454 0.18
455 0.19
456 0.18
457 0.17
458 0.15
459 0.16
460 0.15
461 0.17
462 0.15
463 0.13
464 0.17
465 0.2
466 0.22
467 0.26
468 0.3
469 0.35
470 0.4
471 0.47
472 0.47
473 0.5
474 0.52
475 0.55
476 0.51
477 0.44
478 0.44
479 0.39
480 0.36
481 0.31
482 0.27
483 0.19
484 0.18
485 0.16
486 0.11
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.09
492 0.09
493 0.11
494 0.13
495 0.13
496 0.17
497 0.18
498 0.19
499 0.2
500 0.22
501 0.22
502 0.21
503 0.21
504 0.18
505 0.19
506 0.17
507 0.2
508 0.23
509 0.26
510 0.26
511 0.25
512 0.24