Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AST8

Protein Details
Accession D4AST8    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-70LGKSSKKIKSGDKEKVKKERKTKKDKKEKKEKKKLEKELKKKAREEANNBasic
85-115GVQKAEKSKKVKREDKYKRAKQERMEKRAKLBasic
120-156KTEQDEKKEKKEKKEKKKEKKEKKEKKLKDEEKEEKQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-65KSSKKIKSGDKEKVKKERKTKKDKKEKKEKKKLEKELKKKAR
88-148KAEKSKKVKREDKYKRAKQERMEKRAKLAEENKTEQDEKKEKKEKKEKKKEKKEKKEKKLK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG abe:ARB_07303  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGDKRKRDEAAVDENDGAVVDLGKSSKKIKSGDKEKVKKERKTKKDKKEKKEKKKLEKELKKKAREEANNAAGEDKMEVDGEPNGVQKAEKSKKVKREDKYKRAKQERMEKRAKLAEENKTEQDEKKEKKEKKEKKKEKKEKKEKKLKDEEKEEKQEENGVNGADVEEEQSTPAAPADTETPAENGTEEAAEGAVGDAEMEEARKSQRFIVFISNLPFTATQESVTKHFEKLQPTSVRVPLERGGKKGRGFAFVEFAGFDRMKTCLKQYHGTMFEDGDKPARKIKVELTAGGGGSKSEARKMKILEKNQKLNEERARDAQEAKRAKTASATTNGAGTSAADDQSHIHPSRRARVPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.35
3 0.29
4 0.22
5 0.12
6 0.08
7 0.05
8 0.06
9 0.08
10 0.09
11 0.12
12 0.16
13 0.2
14 0.26
15 0.32
16 0.41
17 0.5
18 0.59
19 0.67
20 0.74
21 0.8
22 0.83
23 0.88
24 0.88
25 0.87
26 0.88
27 0.88
28 0.88
29 0.9
30 0.91
31 0.91
32 0.93
33 0.94
34 0.94
35 0.95
36 0.95
37 0.95
38 0.96
39 0.96
40 0.96
41 0.96
42 0.96
43 0.96
44 0.95
45 0.95
46 0.95
47 0.94
48 0.91
49 0.85
50 0.82
51 0.81
52 0.77
53 0.74
54 0.73
55 0.7
56 0.63
57 0.58
58 0.51
59 0.4
60 0.33
61 0.25
62 0.16
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.21
76 0.27
77 0.34
78 0.41
79 0.49
80 0.58
81 0.69
82 0.75
83 0.74
84 0.79
85 0.82
86 0.84
87 0.88
88 0.87
89 0.87
90 0.88
91 0.86
92 0.84
93 0.83
94 0.83
95 0.82
96 0.82
97 0.72
98 0.68
99 0.67
100 0.6
101 0.57
102 0.54
103 0.52
104 0.5
105 0.53
106 0.49
107 0.47
108 0.47
109 0.41
110 0.42
111 0.43
112 0.41
113 0.47
114 0.55
115 0.57
116 0.66
117 0.75
118 0.77
119 0.79
120 0.86
121 0.87
122 0.89
123 0.95
124 0.96
125 0.96
126 0.97
127 0.97
128 0.96
129 0.96
130 0.96
131 0.93
132 0.92
133 0.92
134 0.89
135 0.86
136 0.85
137 0.82
138 0.8
139 0.79
140 0.7
141 0.59
142 0.51
143 0.47
144 0.37
145 0.3
146 0.23
147 0.15
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.03
163 0.04
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.06
191 0.08
192 0.09
193 0.12
194 0.15
195 0.16
196 0.18
197 0.24
198 0.24
199 0.25
200 0.27
201 0.23
202 0.2
203 0.2
204 0.19
205 0.13
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.16
212 0.2
213 0.2
214 0.18
215 0.23
216 0.26
217 0.29
218 0.3
219 0.37
220 0.36
221 0.38
222 0.41
223 0.4
224 0.38
225 0.34
226 0.34
227 0.3
228 0.35
229 0.34
230 0.35
231 0.37
232 0.4
233 0.41
234 0.45
235 0.42
236 0.38
237 0.37
238 0.34
239 0.32
240 0.26
241 0.25
242 0.18
243 0.17
244 0.16
245 0.14
246 0.13
247 0.1
248 0.12
249 0.14
250 0.15
251 0.19
252 0.21
253 0.26
254 0.31
255 0.33
256 0.4
257 0.41
258 0.42
259 0.39
260 0.34
261 0.34
262 0.3
263 0.27
264 0.25
265 0.25
266 0.24
267 0.29
268 0.31
269 0.28
270 0.3
271 0.35
272 0.38
273 0.38
274 0.38
275 0.36
276 0.34
277 0.33
278 0.3
279 0.25
280 0.15
281 0.14
282 0.16
283 0.12
284 0.17
285 0.22
286 0.25
287 0.3
288 0.35
289 0.43
290 0.49
291 0.58
292 0.62
293 0.67
294 0.74
295 0.73
296 0.78
297 0.72
298 0.72
299 0.7
300 0.66
301 0.6
302 0.57
303 0.57
304 0.51
305 0.54
306 0.5
307 0.51
308 0.52
309 0.5
310 0.51
311 0.46
312 0.44
313 0.44
314 0.43
315 0.4
316 0.4
317 0.4
318 0.34
319 0.35
320 0.34
321 0.28
322 0.23
323 0.17
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.1
328 0.11
329 0.14
330 0.17
331 0.24
332 0.24
333 0.26
334 0.3
335 0.37
336 0.47