Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SMH4

Protein Details
Accession F2SMH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-96RYVALEKRNRWQRKSQREAIETHydrophilic
112-136EDEEHVRKKREPKKRMSQAEFEREMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-126RKKREPKKR
317-327AVKEISRRKRI
Subcellular Location(s) mito 16.5, mito_nucl 12.5, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLRCGNVKLSCARSSRASTVLISTTSATPIAAVSRTQHPSYFVRHYTPLRTWKGRDSSGPRGISPGTTQWDTKDRYVALEKRNRWQRKSQREAIETAKDKNLKDQEEGEGNEDEEHVRKKREPKKRMSQAEFEREMQYIKYDRVALARRVSQLLKLGHEEKATLLVWASQNAKIDCIVSWNTLIEHKMKTGRQKEAVRLFNDMKKRGRPPNEQTFTILLSGLAASSSKHSSETALSLFESLKNSNSESKPNIIHINAVLNVCARNRDMKSLWAFAGDIPEYGESAPNSVTYTIILNAIRTSVLEFTDTLDPNKGPRAVKEISRRKRIAVSSGKKLWGEIISKWRQGDLVLDSKLVTSMARLLTIENTEKSYLDVLRLYRQCMGLPVPPAVESEVIHPQNIQEETSNNDELLTKEEKRQRDEERKMLLHLFDPVDIAEIRTALKGKTGSKKSPSVNLPSPTNIELSLLIQICQNMAHNGMASGRHYWTTLTDNGGYNIKPDSSSCHEYLRLLRHHRASAESLKVVEHYMVPDNLVAGKTITIALSTCSRDRNNPNVLDIANRLLDISTFAPELDPSYILRYIELVRTLVNREKLISDKANMNKIRLKHALDSPTTVLTELHQTRLLKALTHLRLRTQDVIELLAFGYIRYQKLPVDPGFVGSSLGNGEEPTTAQNAGPDDAEKDVTVHKALRKLKAQSFVVPGKAFEGPNCIELLKVLWQSLSLYRRILNTRSVISPSESSPETSSVSSSLSDSDRDWLTKDCERLSMFAPYFKQFTSREVIDNDVESNRNHGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.48
3 0.45
4 0.41
5 0.36
6 0.36
7 0.35
8 0.29
9 0.24
10 0.23
11 0.2
12 0.19
13 0.17
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.14
21 0.22
22 0.28
23 0.29
24 0.3
25 0.32
26 0.35
27 0.41
28 0.46
29 0.41
30 0.41
31 0.46
32 0.5
33 0.52
34 0.56
35 0.58
36 0.59
37 0.63
38 0.62
39 0.64
40 0.67
41 0.64
42 0.66
43 0.64
44 0.65
45 0.67
46 0.65
47 0.56
48 0.52
49 0.49
50 0.41
51 0.36
52 0.32
53 0.29
54 0.29
55 0.3
56 0.3
57 0.37
58 0.4
59 0.39
60 0.39
61 0.33
62 0.36
63 0.44
64 0.48
65 0.5
66 0.55
67 0.57
68 0.62
69 0.72
70 0.75
71 0.72
72 0.76
73 0.77
74 0.78
75 0.84
76 0.83
77 0.82
78 0.78
79 0.76
80 0.72
81 0.71
82 0.63
83 0.57
84 0.55
85 0.5
86 0.46
87 0.51
88 0.51
89 0.45
90 0.45
91 0.44
92 0.41
93 0.43
94 0.44
95 0.38
96 0.31
97 0.28
98 0.25
99 0.22
100 0.18
101 0.16
102 0.21
103 0.22
104 0.25
105 0.31
106 0.41
107 0.51
108 0.61
109 0.67
110 0.72
111 0.79
112 0.85
113 0.9
114 0.86
115 0.86
116 0.85
117 0.84
118 0.77
119 0.69
120 0.6
121 0.5
122 0.44
123 0.34
124 0.3
125 0.23
126 0.2
127 0.2
128 0.2
129 0.2
130 0.26
131 0.31
132 0.31
133 0.34
134 0.37
135 0.37
136 0.39
137 0.39
138 0.34
139 0.36
140 0.33
141 0.3
142 0.31
143 0.31
144 0.3
145 0.3
146 0.28
147 0.21
148 0.22
149 0.19
150 0.14
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.17
155 0.19
156 0.17
157 0.22
158 0.22
159 0.22
160 0.19
161 0.19
162 0.16
163 0.17
164 0.17
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.16
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.18
174 0.24
175 0.27
176 0.36
177 0.41
178 0.46
179 0.52
180 0.56
181 0.61
182 0.64
183 0.67
184 0.59
185 0.58
186 0.55
187 0.52
188 0.54
189 0.52
190 0.48
191 0.49
192 0.55
193 0.59
194 0.64
195 0.67
196 0.69
197 0.74
198 0.74
199 0.68
200 0.63
201 0.55
202 0.47
203 0.38
204 0.29
205 0.17
206 0.12
207 0.1
208 0.07
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.12
218 0.13
219 0.15
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.12
228 0.14
229 0.14
230 0.16
231 0.22
232 0.24
233 0.27
234 0.27
235 0.31
236 0.3
237 0.31
238 0.32
239 0.25
240 0.25
241 0.21
242 0.21
243 0.19
244 0.18
245 0.15
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.11
251 0.16
252 0.17
253 0.22
254 0.22
255 0.27
256 0.3
257 0.31
258 0.3
259 0.24
260 0.23
261 0.18
262 0.21
263 0.15
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.16
297 0.15
298 0.16
299 0.19
300 0.21
301 0.16
302 0.17
303 0.23
304 0.23
305 0.29
306 0.39
307 0.46
308 0.51
309 0.6
310 0.59
311 0.55
312 0.59
313 0.54
314 0.53
315 0.53
316 0.5
317 0.48
318 0.51
319 0.51
320 0.45
321 0.43
322 0.36
323 0.29
324 0.25
325 0.21
326 0.26
327 0.28
328 0.3
329 0.3
330 0.28
331 0.25
332 0.23
333 0.22
334 0.17
335 0.17
336 0.15
337 0.16
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.13
342 0.09
343 0.04
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.11
351 0.12
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.12
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.17
363 0.18
364 0.19
365 0.19
366 0.2
367 0.19
368 0.18
369 0.19
370 0.15
371 0.15
372 0.14
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.1
378 0.08
379 0.09
380 0.15
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.16
386 0.16
387 0.14
388 0.09
389 0.09
390 0.12
391 0.15
392 0.15
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.15
398 0.15
399 0.13
400 0.19
401 0.25
402 0.28
403 0.31
404 0.37
405 0.42
406 0.49
407 0.54
408 0.55
409 0.55
410 0.53
411 0.51
412 0.46
413 0.38
414 0.28
415 0.25
416 0.18
417 0.12
418 0.11
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.08
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.08
428 0.06
429 0.09
430 0.11
431 0.16
432 0.25
433 0.3
434 0.34
435 0.38
436 0.45
437 0.44
438 0.49
439 0.48
440 0.46
441 0.47
442 0.45
443 0.42
444 0.37
445 0.37
446 0.31
447 0.27
448 0.2
449 0.15
450 0.12
451 0.1
452 0.12
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.1
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.11
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.16
478 0.16
479 0.17
480 0.19
481 0.17
482 0.14
483 0.14
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.14
488 0.18
489 0.23
490 0.23
491 0.25
492 0.26
493 0.27
494 0.32
495 0.33
496 0.34
497 0.35
498 0.4
499 0.41
500 0.42
501 0.41
502 0.39
503 0.37
504 0.35
505 0.33
506 0.28
507 0.25
508 0.23
509 0.22
510 0.2
511 0.15
512 0.11
513 0.09
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.08
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.07
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.07
530 0.1
531 0.12
532 0.14
533 0.18
534 0.19
535 0.26
536 0.33
537 0.39
538 0.43
539 0.42
540 0.42
541 0.4
542 0.39
543 0.33
544 0.28
545 0.22
546 0.15
547 0.14
548 0.12
549 0.1
550 0.1
551 0.1
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.09
558 0.1
559 0.09
560 0.09
561 0.08
562 0.12
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.13
567 0.14
568 0.15
569 0.16
570 0.13
571 0.13
572 0.14
573 0.18
574 0.22
575 0.24
576 0.22
577 0.22
578 0.24
579 0.25
580 0.29
581 0.28
582 0.25
583 0.3
584 0.34
585 0.41
586 0.41
587 0.42
588 0.41
589 0.4
590 0.45
591 0.43
592 0.42
593 0.38
594 0.43
595 0.45
596 0.42
597 0.43
598 0.38
599 0.34
600 0.3
601 0.25
602 0.19
603 0.14
604 0.21
605 0.19
606 0.2
607 0.23
608 0.23
609 0.24
610 0.29
611 0.29
612 0.21
613 0.24
614 0.31
615 0.33
616 0.39
617 0.39
618 0.38
619 0.42
620 0.45
621 0.46
622 0.38
623 0.34
624 0.28
625 0.29
626 0.25
627 0.2
628 0.16
629 0.12
630 0.11
631 0.08
632 0.11
633 0.12
634 0.13
635 0.14
636 0.15
637 0.16
638 0.2
639 0.27
640 0.24
641 0.27
642 0.26
643 0.28
644 0.27
645 0.26
646 0.23
647 0.16
648 0.15
649 0.1
650 0.11
651 0.08
652 0.07
653 0.08
654 0.07
655 0.08
656 0.09
657 0.1
658 0.1
659 0.1
660 0.12
661 0.13
662 0.14
663 0.14
664 0.13
665 0.13
666 0.14
667 0.14
668 0.12
669 0.12
670 0.13
671 0.15
672 0.16
673 0.19
674 0.22
675 0.29
676 0.35
677 0.42
678 0.47
679 0.53
680 0.57
681 0.61
682 0.6
683 0.58
684 0.59
685 0.56
686 0.53
687 0.46
688 0.4
689 0.34
690 0.35
691 0.3
692 0.23
693 0.25
694 0.21
695 0.22
696 0.22
697 0.19
698 0.15
699 0.15
700 0.17
701 0.17
702 0.17
703 0.16
704 0.15
705 0.15
706 0.18
707 0.24
708 0.26
709 0.22
710 0.23
711 0.25
712 0.31
713 0.35
714 0.36
715 0.36
716 0.36
717 0.38
718 0.39
719 0.39
720 0.36
721 0.35
722 0.34
723 0.29
724 0.29
725 0.27
726 0.26
727 0.25
728 0.25
729 0.24
730 0.22
731 0.21
732 0.18
733 0.18
734 0.16
735 0.15
736 0.16
737 0.15
738 0.16
739 0.16
740 0.19
741 0.21
742 0.21
743 0.23
744 0.24
745 0.28
746 0.32
747 0.36
748 0.33
749 0.36
750 0.37
751 0.38
752 0.36
753 0.39
754 0.35
755 0.36
756 0.38
757 0.35
758 0.36
759 0.34
760 0.37
761 0.29
762 0.32
763 0.34
764 0.33
765 0.34
766 0.34
767 0.38
768 0.34
769 0.34
770 0.33
771 0.28
772 0.28
773 0.24