Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SE38

Protein Details
Accession F2SE38    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-85LDALRKKRIKRLGVKAPTHTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-77RKKRIKRL
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MSASDKARYYLEQLVPELREFKKKKIFTEEEISSITKKRSDFEHRINARGPSPADYARYAEYEMNLDALRKKRIKRLGVKAPTHTGQRRVFFILDRATRKFHGDVSLWQQYIDYARKQKAYKKLAQIFTNALRLHPREVDLWIYAAQHSLQDHGDMMQARGYMQRGLRFCQSSRQLWLQYAKLEMIYIAKIGARQRILGLDKVEERDGIDEQNDDEGADVMILPRLTGEDINPTLEGDEPDQKSLETLNATPALSGAIPIAVFDAAMNQFNNDAGFAYDFYHMLLEFEECACLRRVLGHVADSLITAHPANAKAQECHIRYPVGGINPCSPEFPRAFSLALGRLKKHMKDDNPVLALLAPHITTWLQRLLETENLDPALRKVIQVTLKSASRQMESCRVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.38
4 0.39
5 0.33
6 0.39
7 0.39
8 0.46
9 0.51
10 0.54
11 0.6
12 0.64
13 0.68
14 0.64
15 0.7
16 0.63
17 0.56
18 0.54
19 0.48
20 0.4
21 0.38
22 0.34
23 0.29
24 0.28
25 0.27
26 0.33
27 0.42
28 0.48
29 0.53
30 0.62
31 0.61
32 0.65
33 0.66
34 0.61
35 0.53
36 0.48
37 0.4
38 0.34
39 0.35
40 0.32
41 0.32
42 0.3
43 0.3
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.21
48 0.2
49 0.19
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.19
55 0.22
56 0.3
57 0.35
58 0.39
59 0.47
60 0.56
61 0.64
62 0.68
63 0.74
64 0.76
65 0.8
66 0.81
67 0.76
68 0.74
69 0.67
70 0.65
71 0.59
72 0.57
73 0.53
74 0.5
75 0.49
76 0.45
77 0.43
78 0.36
79 0.36
80 0.35
81 0.36
82 0.37
83 0.37
84 0.37
85 0.36
86 0.39
87 0.35
88 0.3
89 0.29
90 0.26
91 0.28
92 0.33
93 0.38
94 0.34
95 0.32
96 0.3
97 0.25
98 0.28
99 0.27
100 0.26
101 0.26
102 0.3
103 0.36
104 0.39
105 0.46
106 0.51
107 0.56
108 0.58
109 0.62
110 0.67
111 0.67
112 0.65
113 0.61
114 0.55
115 0.49
116 0.48
117 0.38
118 0.3
119 0.29
120 0.28
121 0.28
122 0.25
123 0.23
124 0.18
125 0.19
126 0.2
127 0.16
128 0.16
129 0.14
130 0.13
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.13
151 0.18
152 0.18
153 0.2
154 0.24
155 0.25
156 0.25
157 0.29
158 0.32
159 0.3
160 0.33
161 0.34
162 0.31
163 0.32
164 0.35
165 0.28
166 0.24
167 0.23
168 0.19
169 0.15
170 0.13
171 0.1
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.07
178 0.09
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.09
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.09
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.08
242 0.08
243 0.06
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.03
251 0.06
252 0.06
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.07
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.13
283 0.16
284 0.17
285 0.17
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.14
290 0.14
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.11
297 0.13
298 0.17
299 0.19
300 0.19
301 0.25
302 0.33
303 0.32
304 0.35
305 0.36
306 0.32
307 0.29
308 0.32
309 0.31
310 0.28
311 0.3
312 0.28
313 0.31
314 0.33
315 0.34
316 0.32
317 0.3
318 0.28
319 0.26
320 0.28
321 0.26
322 0.24
323 0.24
324 0.23
325 0.26
326 0.27
327 0.33
328 0.32
329 0.31
330 0.35
331 0.41
332 0.44
333 0.48
334 0.5
335 0.49
336 0.56
337 0.62
338 0.63
339 0.59
340 0.55
341 0.47
342 0.39
343 0.33
344 0.25
345 0.19
346 0.11
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.13
352 0.18
353 0.17
354 0.17
355 0.19
356 0.22
357 0.27
358 0.29
359 0.27
360 0.25
361 0.25
362 0.25
363 0.24
364 0.21
365 0.22
366 0.2
367 0.19
368 0.18
369 0.24
370 0.3
371 0.32
372 0.35
373 0.35
374 0.38
375 0.4
376 0.43
377 0.39
378 0.37
379 0.38
380 0.4