Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SRJ3

Protein Details
Accession F2SRJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MMDEALKKPSKRRIKKADGIDLADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-16KKPSKRRIKK
246-261RRMKARQIAANKGSKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MMDEALKKPSKRRIKKADGIDLADYADAEIEEVRKRMTDAARLDSIARKENRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLIDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMAALLRLPINKETLIASGIGKVIVFYTKSKRPEIGIKRQAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYEEVDFDPSRLADRTVSAEASAAEARARELLPPRLANRARVESSHTSYTVVPRSMGVSESKFARPLGASGEDRFRRMKARQIAANKGSKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.87
3 0.89
4 0.89
5 0.83
6 0.77
7 0.67
8 0.56
9 0.46
10 0.37
11 0.27
12 0.17
13 0.11
14 0.07
15 0.06
16 0.06
17 0.08
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.13
23 0.19
24 0.21
25 0.27
26 0.29
27 0.34
28 0.35
29 0.35
30 0.36
31 0.35
32 0.35
33 0.35
34 0.34
35 0.31
36 0.35
37 0.4
38 0.45
39 0.45
40 0.5
41 0.49
42 0.54
43 0.55
44 0.53
45 0.53
46 0.52
47 0.48
48 0.4
49 0.33
50 0.28
51 0.25
52 0.24
53 0.19
54 0.16
55 0.19
56 0.19
57 0.18
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.07
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.12
89 0.11
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.08
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.12
123 0.18
124 0.21
125 0.22
126 0.23
127 0.25
128 0.34
129 0.4
130 0.46
131 0.49
132 0.5
133 0.51
134 0.53
135 0.52
136 0.43
137 0.36
138 0.27
139 0.25
140 0.21
141 0.19
142 0.17
143 0.17
144 0.19
145 0.19
146 0.18
147 0.13
148 0.15
149 0.18
150 0.23
151 0.3
152 0.3
153 0.32
154 0.33
155 0.32
156 0.32
157 0.3
158 0.24
159 0.18
160 0.2
161 0.19
162 0.24
163 0.23
164 0.21
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.17
169 0.15
170 0.09
171 0.1
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.14
179 0.12
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.16
188 0.21
189 0.25
190 0.29
191 0.3
192 0.38
193 0.4
194 0.43
195 0.44
196 0.45
197 0.42
198 0.39
199 0.45
200 0.41
201 0.45
202 0.42
203 0.36
204 0.31
205 0.31
206 0.36
207 0.34
208 0.28
209 0.24
210 0.21
211 0.22
212 0.21
213 0.21
214 0.2
215 0.17
216 0.19
217 0.22
218 0.23
219 0.23
220 0.23
221 0.24
222 0.21
223 0.19
224 0.22
225 0.24
226 0.25
227 0.26
228 0.36
229 0.35
230 0.37
231 0.39
232 0.36
233 0.38
234 0.39
235 0.46
236 0.46
237 0.52
238 0.58
239 0.64
240 0.71
241 0.71