FuNGI

F2SF39

Protein Details

Accession

F2SF39

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
127-146	QHQGHSREREKRTQERKELE	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 9.166, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MAVFDALRHLSDYLRESHPVNHLADLYELVQYAGNIVPRLYLMITVGTVYMSIPDAPVKEIMKDMMEMSRGVQHPIRGLFLRYYLSGQARDYLPMGSGDGPQGNLQDSTNFVLTNFVEMNKLWVRLQHQGHSREREKRTQERKELELLVGSNLVRLSQLVDLEAYKSVILQPLLEQVVQCRDVLAQEYLLEVITKVFPDEYHLHTLDSMLSAIARLNPHVDMKKIVIGLMDRLSTYATRGSEKSDDPEVRKKAEEEATVRLLENLQLSKERGEAPPASDEQKTADKEKGIVQPENGINQPGEGDGGKDTKPESVEDQQESEEATFLPGNIKLYEIFYDQVLNLVKTRGIPIQDTIALLVSLTNLALNIYPDRLEYVDQVLQYATKTATEHSDSADFHSAPAQSSILNLLLAPLQSYVSIFTALSLPNYIPFFAAQSYSTRRAVAGEVARNILRNRTSITSPENLDNVLQILRVLIREGMQQPAGYPGAQSQRRGGETEETIEEQGWLARIVHLVQGPDNDTQLKLLQALRTAYLDGNERIRYTTPSIITSSIKLARKFKAREHFDDNWQPQSSALFRFMHQCVSSLYQRVNSGCADLALRLFVLCGQTADETGFEEVSYEFFAQAFTVYEDSISDSRAQFQAVCIISSALHGCRNFGRENYDTLITKAALHGSKLLKKPDQCRAVYLASHLWWVVESPQKEGDEPNIVYRDGKRVLECLQRALRVADACMDTAVSVELFIEILNRYVYYFDQQNETVTTKYLNGLIELIYSNLQSNQTEGIPSSSLESPRRHFERTLDYIKSREWEGVVTEPPRQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.26
3	0.27
4	0.32
5	0.37
6	0.37
7	0.36
8	0.33
9	0.31
10	0.29
11	0.28
12	0.25
13	0.19
14	0.15
15	0.14
16	0.12
17	0.11
18	0.1
19	0.11
20	0.12
21	0.13
22	0.12
23	0.12
24	0.12
25	0.12
26	0.14
27	0.12
28	0.1
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.09
33	0.09
34	0.08
35	0.07
36	0.07
37	0.07
38	0.07
39	0.07
40	0.08
41	0.1
42	0.11
43	0.12
44	0.17
45	0.17
46	0.17
47	0.18
48	0.19
49	0.18
50	0.18
51	0.18
52	0.17
53	0.17
54	0.16
55	0.16
56	0.22
57	0.21
58	0.24
59	0.25
60	0.24
61	0.28
62	0.29
63	0.32
64	0.26
65	0.28
66	0.26
67	0.26
68	0.26
69	0.22
70	0.23
71	0.24
72	0.26
73	0.26
74	0.25
75	0.27
76	0.26
77	0.26
78	0.25
79	0.2
80	0.17
81	0.15
82	0.16
83	0.13
84	0.13
85	0.14
86	0.14
87	0.14
88	0.14
89	0.15
90	0.15
91	0.14
92	0.14
93	0.12
94	0.13
95	0.15
96	0.15
97	0.14
98	0.12
99	0.15
100	0.14
101	0.17
102	0.16
103	0.13
104	0.14
105	0.14
106	0.2
107	0.19
108	0.21
109	0.18
110	0.21
111	0.25
112	0.32
113	0.36
114	0.38
115	0.43
116	0.49
117	0.57
118	0.62
119	0.66
120	0.67
121	0.69
122	0.71
123	0.72
124	0.75
125	0.78
126	0.79
127	0.81
128	0.77
129	0.75
130	0.72
131	0.65
132	0.55
133	0.47
134	0.37
135	0.28
136	0.24
137	0.2
138	0.15
139	0.13
140	0.12
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.08
147	0.09
148	0.1
149	0.11
150	0.11
151	0.1
152	0.08
153	0.08
154	0.09
155	0.11
156	0.11
157	0.1
158	0.1
159	0.14
160	0.15
161	0.15
162	0.14
163	0.13
164	0.18
165	0.18
166	0.17
167	0.14
168	0.13
169	0.13
170	0.16
171	0.15
172	0.11
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.09
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.06
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.12
186	0.16
187	0.19
188	0.24
189	0.24
190	0.24
191	0.24
192	0.24
193	0.19
194	0.16
195	0.12
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.1
204	0.11
205	0.16
206	0.18
207	0.19
208	0.18
209	0.19
210	0.22
211	0.2
212	0.19
213	0.16
214	0.14
215	0.16
216	0.15
217	0.14
218	0.11
219	0.11
220	0.12
221	0.1
222	0.11
223	0.12
224	0.12
225	0.14
226	0.15
227	0.19
228	0.21
229	0.22
230	0.24
231	0.28
232	0.31
233	0.34
234	0.42
235	0.41
236	0.4
237	0.41
238	0.38
239	0.37
240	0.37
241	0.37
242	0.31
243	0.32
244	0.32
245	0.31
246	0.3
247	0.24
248	0.2
249	0.16
250	0.16
251	0.12
252	0.11
253	0.12
254	0.13
255	0.14
256	0.15
257	0.16
258	0.15
259	0.18
260	0.18
261	0.18
262	0.21
263	0.21
264	0.22
265	0.2
266	0.2
267	0.19
268	0.23
269	0.24
270	0.23
271	0.24
272	0.22
273	0.23
274	0.29
275	0.32
276	0.3
277	0.29
278	0.27
279	0.31
280	0.31
281	0.32
282	0.26
283	0.21
284	0.16
285	0.15
286	0.15
287	0.09
288	0.08
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.11
297	0.12
298	0.12
299	0.16
300	0.19
301	0.23
302	0.23
303	0.24
304	0.22
305	0.22
306	0.21
307	0.16
308	0.11
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.09
316	0.08
317	0.09
318	0.08
319	0.09
320	0.11
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.11
327	0.11
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.12
334	0.11
335	0.11
336	0.12
337	0.12
338	0.13
339	0.14
340	0.13
341	0.11
342	0.09
343	0.08
344	0.07
345	0.06
346	0.04
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.1
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.1
367	0.1
368	0.09
369	0.1
370	0.07
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.09
375	0.11
376	0.12
377	0.12
378	0.14
379	0.13
380	0.15
381	0.18
382	0.15
383	0.13
384	0.15
385	0.14
386	0.12
387	0.12
388	0.1
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.08
421	0.07
422	0.1
423	0.14
424	0.17
425	0.18
426	0.17
427	0.17
428	0.17
429	0.17
430	0.18
431	0.18
432	0.17
433	0.17
434	0.18
435	0.18
436	0.19
437	0.19
438	0.18
439	0.15
440	0.13
441	0.15
442	0.16
443	0.17
444	0.18
445	0.21
446	0.21
447	0.22
448	0.22
449	0.2
450	0.18
451	0.17
452	0.14
453	0.11
454	0.08
455	0.07
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.06
463	0.09
464	0.1
465	0.11
466	0.11
467	0.11
468	0.11
469	0.13
470	0.13
471	0.1
472	0.09
473	0.11
474	0.19
475	0.21
476	0.22
477	0.22
478	0.25
479	0.26
480	0.27
481	0.25
482	0.21
483	0.2
484	0.21
485	0.19
486	0.16
487	0.16
488	0.14
489	0.13
490	0.09
491	0.09
492	0.07
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.09
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.11
503	0.13
504	0.13
505	0.14
506	0.12
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.1
511	0.1
512	0.11
513	0.11
514	0.13
515	0.14
516	0.14
517	0.14
518	0.15
519	0.13
520	0.12
521	0.14
522	0.13
523	0.16
524	0.16
525	0.16
526	0.17
527	0.17
528	0.19
529	0.19
530	0.23
531	0.2
532	0.21
533	0.23
534	0.23
535	0.23
536	0.22
537	0.22
538	0.24
539	0.27
540	0.29
541	0.33
542	0.36
543	0.44
544	0.47
545	0.5
546	0.54
547	0.56
548	0.59
549	0.62
550	0.61
551	0.6
552	0.66
553	0.6
554	0.56
555	0.5
556	0.44
557	0.36
558	0.34
559	0.28
560	0.21
561	0.23
562	0.18
563	0.17
564	0.23
565	0.23
566	0.25
567	0.23
568	0.22
569	0.2
570	0.23
571	0.25
572	0.22
573	0.23
574	0.21
575	0.24
576	0.23
577	0.23
578	0.19
579	0.17
580	0.15
581	0.14
582	0.12
583	0.1
584	0.1
585	0.08
586	0.08
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.07
591	0.06
592	0.07
593	0.07
594	0.08
595	0.08
596	0.09
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.08
606	0.08
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.07
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.13
622	0.12
623	0.15
624	0.16
625	0.16
626	0.13
627	0.13
628	0.19
629	0.17
630	0.17
631	0.14
632	0.14
633	0.13
634	0.14
635	0.16
636	0.11
637	0.15
638	0.15
639	0.16
640	0.19
641	0.22
642	0.24
643	0.23
644	0.28
645	0.26
646	0.29
647	0.31
648	0.32
649	0.29
650	0.27
651	0.28
652	0.22
653	0.2
654	0.18
655	0.19
656	0.17
657	0.16
658	0.22
659	0.25
660	0.32
661	0.37
662	0.42
663	0.44
664	0.5
665	0.56
666	0.6
667	0.63
668	0.56
669	0.55
670	0.54
671	0.51
672	0.45
673	0.41
674	0.34
675	0.26
676	0.26
677	0.22
678	0.17
679	0.13
680	0.13
681	0.15
682	0.18
683	0.18
684	0.21
685	0.26
686	0.27
687	0.27
688	0.28
689	0.28
690	0.28
691	0.28
692	0.3
693	0.28
694	0.27
695	0.29
696	0.3
697	0.33
698	0.3
699	0.31
700	0.27
701	0.28
702	0.34
703	0.4
704	0.4
705	0.41
706	0.41
707	0.4
708	0.4
709	0.39
710	0.36
711	0.28
712	0.28
713	0.24
714	0.21
715	0.19
716	0.18
717	0.16
718	0.12
719	0.11
720	0.11
721	0.06
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.06
728	0.06
729	0.07
730	0.08
731	0.08
732	0.09
733	0.1
734	0.12
735	0.15
736	0.19
737	0.19
738	0.23
739	0.24
740	0.26
741	0.28
742	0.29
743	0.25
744	0.22
745	0.21
746	0.18
747	0.19
748	0.2
749	0.17
750	0.15
751	0.15
752	0.15
753	0.15
754	0.14
755	0.13
756	0.11
757	0.11
758	0.12
759	0.13
760	0.15
761	0.14
762	0.15
763	0.16
764	0.16
765	0.17
766	0.16
767	0.17
768	0.15
769	0.15
770	0.18
771	0.2
772	0.25
773	0.29
774	0.34
775	0.36
776	0.45
777	0.5
778	0.5
779	0.49
780	0.5
781	0.54
782	0.56
783	0.6
784	0.57
785	0.55
786	0.53
787	0.53
788	0.5
789	0.42
790	0.36
791	0.29
792	0.24
793	0.24
794	0.27
795	0.3

F2SF39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer