FuNGI

F2T148

Protein Details

Accession

F2T148

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-51	GPFMVRRRPKPADPLVRPKKRPIPRPTAPGQ	Hydrophilic
439-459	LKSFGKQVRKALQRREKNYDY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-46	VRRRPKPADPLVRPKKRPIPRP

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSTTPPNPPLGRTPPGGPNGPFMVRRRPKPADPLVRPKKRPIPRPTAPGQPQPQGQSQGYGQGQVRSTTANGTSTLPLQPPRHQPPASTLPQPRPIPSADDLTTNGFSGPLLSETYSDYPLVTTKRALREGLRHHIAKLISKKSVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRATTTASAGNEKEDANPRRGFRDPYAGLTEAERQEMEAKKEARAKEREDNLAQIAPSVNSGPKKVNAPKQRTQQVFKSIITPEEAAKSQIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGKYEAAMSETYATFVLERSGKMRMIPIDKWYKFTAKNQFKVLTIEEAEKHMARKIRDPRWFMEKEQARAQERELQRYARQRKIYTGQSRNAPVTDRFEGDDMDFDEDRFADDEEHVGLFDDDEDAKTAEKRIKQDQLKANIFDLKDEKDYDEEEHLEKKQKEDLKSFGKQVRKALQRREKNYDYSSGSDANPYSDDEVILFFTMYLSSSIFN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.47
3	0.5
4	0.52
5	0.45
6	0.42
7	0.42
8	0.43
9	0.44
10	0.4
11	0.46
12	0.49
13	0.55
14	0.59
15	0.62
16	0.65
17	0.69
18	0.76
19	0.76
20	0.76
21	0.81
22	0.83
23	0.86
24	0.84
25	0.84
26	0.83
27	0.81
28	0.82
29	0.81
30	0.8
31	0.78
32	0.82
33	0.78
34	0.78
35	0.75
36	0.74
37	0.71
38	0.66
39	0.62
40	0.59
41	0.59
42	0.54
43	0.48
44	0.42
45	0.36
46	0.38
47	0.34
48	0.34
49	0.3
50	0.28
51	0.29
52	0.27
53	0.27
54	0.21
55	0.21
56	0.19
57	0.19
58	0.16
59	0.16
60	0.18
61	0.18
62	0.19
63	0.21
64	0.21
65	0.26
66	0.28
67	0.34
68	0.42
69	0.48
70	0.55
71	0.53
72	0.51
73	0.52
74	0.57
75	0.54
76	0.53
77	0.51
78	0.49
79	0.58
80	0.58
81	0.52
82	0.47
83	0.43
84	0.4
85	0.37
86	0.36
87	0.27
88	0.28
89	0.27
90	0.27
91	0.27
92	0.22
93	0.19
94	0.13
95	0.12
96	0.11
97	0.1
98	0.07
99	0.08
100	0.08
101	0.09
102	0.12
103	0.14
104	0.14
105	0.13
106	0.12
107	0.12
108	0.15
109	0.16
110	0.15
111	0.17
112	0.21
113	0.27
114	0.29
115	0.31
116	0.32
117	0.38
118	0.44
119	0.49
120	0.5
121	0.45
122	0.43
123	0.45
124	0.42
125	0.41
126	0.41
127	0.37
128	0.35
129	0.35
130	0.39
131	0.44
132	0.51
133	0.47
134	0.44
135	0.44
136	0.49
137	0.51
138	0.49
139	0.45
140	0.43
141	0.41
142	0.41
143	0.4
144	0.41
145	0.47
146	0.52
147	0.57
148	0.6
149	0.69
150	0.71
151	0.69
152	0.67
153	0.6
154	0.56
155	0.47
156	0.4
157	0.34
158	0.29
159	0.29
160	0.23
161	0.2
162	0.19
163	0.18
164	0.18
165	0.23
166	0.24
167	0.27
168	0.31
169	0.31
170	0.34
171	0.36
172	0.37
173	0.3
174	0.37
175	0.33
176	0.32
177	0.35
178	0.32
179	0.29
180	0.26
181	0.29
182	0.2
183	0.19
184	0.16
185	0.12
186	0.16
187	0.19
188	0.2
189	0.22
190	0.22
191	0.25
192	0.31
193	0.33
194	0.36
195	0.38
196	0.41
197	0.43
198	0.46
199	0.47
200	0.43
201	0.42
202	0.36
203	0.32
204	0.26
205	0.19
206	0.15
207	0.1
208	0.09
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.11
213	0.12
214	0.13
215	0.19
216	0.25
217	0.33
218	0.4
219	0.47
220	0.53
221	0.59
222	0.66
223	0.64
224	0.62
225	0.58
226	0.57
227	0.52
228	0.46
229	0.41
230	0.33
231	0.3
232	0.27
233	0.23
234	0.16
235	0.14
236	0.14
237	0.12
238	0.13
239	0.13
240	0.12
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.13
245	0.16
246	0.15
247	0.16
248	0.16
249	0.15
250	0.15
251	0.14
252	0.13
253	0.11
254	0.14
255	0.15
256	0.16
257	0.15
258	0.16
259	0.17
260	0.17
261	0.16
262	0.14
263	0.11
264	0.11
265	0.12
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.09
270	0.09
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.12
282	0.12
283	0.12
284	0.15
285	0.17
286	0.2
287	0.21
288	0.26
289	0.34
290	0.34
291	0.37
292	0.37
293	0.38
294	0.36
295	0.43
296	0.47
297	0.46
298	0.5
299	0.51
300	0.51
301	0.47
302	0.47
303	0.4
304	0.33
305	0.25
306	0.23
307	0.19
308	0.19
309	0.2
310	0.18
311	0.17
312	0.17
313	0.2
314	0.19
315	0.27
316	0.35
317	0.43
318	0.5
319	0.53
320	0.53
321	0.58
322	0.59
323	0.52
324	0.53
325	0.5
326	0.46
327	0.48
328	0.52
329	0.46
330	0.45
331	0.45
332	0.44
333	0.41
334	0.44
335	0.41
336	0.37
337	0.39
338	0.49
339	0.54
340	0.54
341	0.58
342	0.52
343	0.56
344	0.6
345	0.64
346	0.64
347	0.64
348	0.61
349	0.6
350	0.62
351	0.57
352	0.51
353	0.44
354	0.37
355	0.35
356	0.32
357	0.28
358	0.25
359	0.24
360	0.24
361	0.21
362	0.2
363	0.15
364	0.17
365	0.16
366	0.15
367	0.15
368	0.13
369	0.14
370	0.13
371	0.12
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.09
386	0.09
387	0.1
388	0.11
389	0.15
390	0.19
391	0.23
392	0.28
393	0.35
394	0.45
395	0.5
396	0.58
397	0.63
398	0.68
399	0.69
400	0.66
401	0.6
402	0.56
403	0.49
404	0.44
405	0.38
406	0.32
407	0.29
408	0.28
409	0.27
410	0.24
411	0.26
412	0.25
413	0.25
414	0.24
415	0.24
416	0.26
417	0.28
418	0.35
419	0.35
420	0.35
421	0.39
422	0.43
423	0.47
424	0.49
425	0.53
426	0.53
427	0.58
428	0.63
429	0.62
430	0.63
431	0.61
432	0.64
433	0.66
434	0.67
435	0.69
436	0.73
437	0.76
438	0.79
439	0.83
440	0.84
441	0.8
442	0.77
443	0.73
444	0.69
445	0.63
446	0.56
447	0.52
448	0.45
449	0.4
450	0.37
451	0.33
452	0.28
453	0.24
454	0.23
455	0.21
456	0.18
457	0.18
458	0.14
459	0.15
460	0.14
461	0.13
462	0.11
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.08

F2T148

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer