Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SPN4

Protein Details
Accession F2SPN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-56RTTKIYCRPRCPARLARRANVHydrophilic
66-86EKAGYRPCKRCKPEDVRAPTDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035451  Ada-like_dom_sf  
IPR004026  Ada_DNA_repair_Zn-bd  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR018060  HTH_AraC  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0032259  P:methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF02805  Ada_Zn_binding  
PF00165  HTH_AraC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01124  HTH_ARAC_FAMILY_2  
Amino Acid Sequences MTAETDNKSAYASTSARWRAIVNRDAAATGFVYGVRTTKIYCRPRCPARLARRANVEFYDTPLLAEKAGYRPCKRCKPEDVRAPTDPHIRLAQRACETMTLAALAGGDKQRPTLSDLSGEAGLTPSHFHRVFKKVVGVTPGKFARELMERKSLGKVMVPSGINARICWPPPHLAPLVGMSSPVQDSNNNNASSLEPQVQTPPLGDCDIDQIIGQGYSDPQAVGPINWNEFDLMLAAASDPRQQQQQQQQQQQQQQQQHHHHHHQQHINFSRPPTSTPASTAAAASVTTSSSPAVGGGSGICMPQTTASHSFDPNSLNNIQSMLTLDPNSTSNINFAQYMAEPIDFSPMNPPTTTNSSTNTTTGHSPPDTFAHPTPSPTSVPSLYSQQSISPTDSPLMFDSYTSLTGSWPPLLFEDTDWLDSQVLLPARLQQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.32
4 0.33
5 0.34
6 0.35
7 0.42
8 0.46
9 0.4
10 0.38
11 0.37
12 0.36
13 0.34
14 0.28
15 0.2
16 0.14
17 0.11
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.21
26 0.31
27 0.4
28 0.48
29 0.55
30 0.63
31 0.72
32 0.77
33 0.79
34 0.79
35 0.8
36 0.82
37 0.81
38 0.79
39 0.79
40 0.75
41 0.69
42 0.61
43 0.56
44 0.46
45 0.43
46 0.4
47 0.3
48 0.27
49 0.26
50 0.24
51 0.18
52 0.18
53 0.16
54 0.18
55 0.25
56 0.32
57 0.36
58 0.45
59 0.55
60 0.65
61 0.69
62 0.7
63 0.74
64 0.76
65 0.8
66 0.81
67 0.81
68 0.77
69 0.75
70 0.72
71 0.65
72 0.63
73 0.54
74 0.46
75 0.44
76 0.38
77 0.4
78 0.38
79 0.41
80 0.35
81 0.36
82 0.34
83 0.29
84 0.28
85 0.23
86 0.19
87 0.12
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.17
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.19
104 0.2
105 0.2
106 0.18
107 0.14
108 0.11
109 0.1
110 0.08
111 0.09
112 0.07
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.22
117 0.28
118 0.31
119 0.32
120 0.37
121 0.32
122 0.34
123 0.38
124 0.36
125 0.31
126 0.35
127 0.34
128 0.28
129 0.26
130 0.24
131 0.22
132 0.26
133 0.28
134 0.25
135 0.32
136 0.32
137 0.33
138 0.35
139 0.33
140 0.26
141 0.25
142 0.23
143 0.16
144 0.2
145 0.19
146 0.18
147 0.19
148 0.22
149 0.19
150 0.17
151 0.19
152 0.16
153 0.18
154 0.19
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.24
159 0.22
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.17
164 0.14
165 0.13
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.11
173 0.18
174 0.23
175 0.22
176 0.22
177 0.22
178 0.22
179 0.22
180 0.21
181 0.17
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.12
229 0.13
230 0.2
231 0.3
232 0.4
233 0.46
234 0.53
235 0.59
236 0.63
237 0.69
238 0.69
239 0.65
240 0.62
241 0.6
242 0.6
243 0.61
244 0.63
245 0.64
246 0.64
247 0.65
248 0.65
249 0.67
250 0.66
251 0.6
252 0.6
253 0.58
254 0.56
255 0.51
256 0.46
257 0.42
258 0.36
259 0.35
260 0.31
261 0.29
262 0.25
263 0.25
264 0.28
265 0.24
266 0.23
267 0.21
268 0.16
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.07
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.08
292 0.12
293 0.16
294 0.19
295 0.22
296 0.23
297 0.24
298 0.24
299 0.26
300 0.22
301 0.23
302 0.21
303 0.19
304 0.18
305 0.18
306 0.16
307 0.13
308 0.14
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.13
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.15
331 0.13
332 0.13
333 0.18
334 0.19
335 0.21
336 0.21
337 0.22
338 0.23
339 0.3
340 0.33
341 0.29
342 0.3
343 0.32
344 0.34
345 0.34
346 0.3
347 0.26
348 0.26
349 0.26
350 0.27
351 0.24
352 0.24
353 0.25
354 0.27
355 0.28
356 0.28
357 0.28
358 0.3
359 0.29
360 0.32
361 0.33
362 0.33
363 0.31
364 0.28
365 0.31
366 0.25
367 0.27
368 0.26
369 0.29
370 0.27
371 0.28
372 0.27
373 0.24
374 0.27
375 0.27
376 0.29
377 0.24
378 0.24
379 0.25
380 0.25
381 0.24
382 0.22
383 0.23
384 0.19
385 0.17
386 0.18
387 0.18
388 0.19
389 0.17
390 0.15
391 0.13
392 0.16
393 0.18
394 0.19
395 0.17
396 0.17
397 0.18
398 0.2
399 0.2
400 0.18
401 0.22
402 0.2
403 0.22
404 0.22
405 0.21
406 0.19
407 0.19
408 0.18
409 0.18
410 0.17
411 0.16
412 0.15