Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SFC6

Protein Details
Accession F2SFC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-322DETDTKGKGKARRRNRNWSLEELAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-173RKEKEARKRRWE
305-312GKGKARRR
Subcellular Location(s) cyto 10, extr 5, nucl 4, mito 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024974  Sde2_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13019  Sde2_N_Ubi  
Amino Acid Sequences MAPFTINVLLSSFPGLALPATLAIPLPSTSSIADLTDRISAHLPFPLTAQSSPLILTTTNNKQISFSSPAKLSNLIPDIVENGVANTASTFLPLRLSVRVCGGKGGFGSQLRAAGGRMSSRRKGNQDTNTGSNRNLDGRRLRTVKEAKALAEYLALKPEMDRKEKEARKRRWEAAVAAAEKKEQEIRNGEGKGKVDGAWMEDKEEMSEKAREAVLQAMAGGAWKDNLAGLLDSAEASGSSGSGGSMDASEDSDMEDIYEEDSPNEPSASTKKPVRRFFGFDDEEDDEDLMSEDEEDEIDETDTKGKGKARRRNRNWSLEELALAMDGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.08
4 0.08
5 0.07
6 0.06
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.11
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.14
21 0.12
22 0.13
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.19
30 0.18
31 0.15
32 0.16
33 0.18
34 0.18
35 0.17
36 0.19
37 0.16
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.12
42 0.1
43 0.12
44 0.16
45 0.23
46 0.31
47 0.32
48 0.31
49 0.32
50 0.33
51 0.37
52 0.37
53 0.33
54 0.28
55 0.29
56 0.3
57 0.31
58 0.31
59 0.26
60 0.25
61 0.25
62 0.21
63 0.19
64 0.18
65 0.17
66 0.15
67 0.15
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.11
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.19
86 0.21
87 0.2
88 0.22
89 0.2
90 0.18
91 0.17
92 0.18
93 0.15
94 0.14
95 0.16
96 0.13
97 0.14
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.17
105 0.21
106 0.26
107 0.31
108 0.36
109 0.41
110 0.47
111 0.52
112 0.54
113 0.57
114 0.56
115 0.57
116 0.56
117 0.51
118 0.45
119 0.37
120 0.31
121 0.29
122 0.25
123 0.25
124 0.26
125 0.29
126 0.35
127 0.35
128 0.35
129 0.39
130 0.44
131 0.42
132 0.41
133 0.39
134 0.32
135 0.32
136 0.31
137 0.22
138 0.19
139 0.17
140 0.11
141 0.12
142 0.11
143 0.09
144 0.09
145 0.15
146 0.17
147 0.2
148 0.21
149 0.24
150 0.35
151 0.4
152 0.5
153 0.53
154 0.58
155 0.64
156 0.7
157 0.69
158 0.64
159 0.62
160 0.54
161 0.5
162 0.46
163 0.38
164 0.32
165 0.29
166 0.23
167 0.21
168 0.2
169 0.18
170 0.14
171 0.16
172 0.18
173 0.21
174 0.27
175 0.28
176 0.29
177 0.27
178 0.27
179 0.24
180 0.22
181 0.18
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.13
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.12
196 0.13
197 0.14
198 0.13
199 0.12
200 0.14
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.18
255 0.21
256 0.26
257 0.32
258 0.4
259 0.49
260 0.57
261 0.62
262 0.63
263 0.64
264 0.65
265 0.67
266 0.62
267 0.53
268 0.51
269 0.47
270 0.41
271 0.36
272 0.29
273 0.19
274 0.16
275 0.16
276 0.1
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.17
292 0.22
293 0.3
294 0.4
295 0.5
296 0.58
297 0.68
298 0.77
299 0.84
300 0.88
301 0.9
302 0.85
303 0.83
304 0.77
305 0.67
306 0.59
307 0.48
308 0.38