Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SNL9

Protein Details
Accession F2SNL9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
580-615AYIEHNKSRNKQLKERSSFFKKIDRDRAKRKKMLEHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
559-561NKK
590-612KQLKERSSFFKKIDRDRAKRKKM
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032438  ERCC3_RAD25_C  
IPR006935  Helicase/UvrB_N  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR001161  XPB/Ssl2  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF16203  ERCC3_RAD25_C  
PF04851  ResIII  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18029  DEXHc_XPB  
cd18789  SF2_C_XPB  
Amino Acid Sequences MLLKDEVIGPQRIESSEITQQAAPKMGGLVIPGTKDAAMMKQAPDQRAAQVSERPAQSNEDDILVNLREEDDDEEQAQVHSFEIPNTAVESVKARCQSMGCPALEEYDFRNDEINPTLDIDLKPIAQIRSYQEKSLSKMFGNGRAKSGIIVLPCGAGKTLVGITAACTIKKGTIVLCTSSMSVVQWRNEFIRWSNIDPSDIAIFTSDNKEKFRRSTGVIVSTYSMVSQTRARSHDAEKMMEWLQSREWGLMLLDEVHVVPAFMFRTVTSAIATQTKLGLTATLLREDDKIKDLNFLIGPKLYEANWMELAEQGHIAKVQCAEVWCPMTTEFYTEYMREKSRKAALLYIMNPRKFQACQFLIDYHEKRGDKIIVFSDNVFALERYALKLKKAYIYGGTPQNERLRILENFQHNEQVNTIFLSKIGDTSLDLPEATCLIQISSHYGSRRQEAQRLGRILRAKRRNDEGFNAFFYSLVSKDTDEMFYSSKRQAFLVDQGYAFKVITHLQGIENLEGLAYATAEERLALLADVTLQNETSAAVEENADDLFNDRSAGGKSRGNKKAVRRNAATLSGLAGGEDMAYIEHNKSRNKQLKERSSFFKKIDRDRAKRKKMLEH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.28
4 0.29
5 0.3
6 0.29
7 0.32
8 0.31
9 0.32
10 0.27
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.16
15 0.14
16 0.15
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.13
25 0.16
26 0.18
27 0.2
28 0.26
29 0.31
30 0.32
31 0.35
32 0.33
33 0.33
34 0.36
35 0.37
36 0.33
37 0.34
38 0.36
39 0.4
40 0.4
41 0.39
42 0.35
43 0.36
44 0.34
45 0.32
46 0.28
47 0.23
48 0.21
49 0.19
50 0.21
51 0.17
52 0.16
53 0.12
54 0.12
55 0.1
56 0.11
57 0.15
58 0.14
59 0.15
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.12
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.14
74 0.14
75 0.11
76 0.12
77 0.15
78 0.15
79 0.2
80 0.21
81 0.21
82 0.22
83 0.23
84 0.25
85 0.3
86 0.34
87 0.29
88 0.28
89 0.28
90 0.29
91 0.28
92 0.27
93 0.21
94 0.22
95 0.23
96 0.21
97 0.23
98 0.2
99 0.22
100 0.24
101 0.23
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.17
112 0.17
113 0.15
114 0.18
115 0.22
116 0.31
117 0.33
118 0.34
119 0.37
120 0.4
121 0.42
122 0.45
123 0.42
124 0.32
125 0.37
126 0.38
127 0.4
128 0.44
129 0.42
130 0.38
131 0.37
132 0.36
133 0.29
134 0.29
135 0.21
136 0.15
137 0.15
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.14
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.15
159 0.1
160 0.15
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.18
166 0.17
167 0.16
168 0.11
169 0.14
170 0.16
171 0.18
172 0.18
173 0.2
174 0.22
175 0.23
176 0.24
177 0.21
178 0.25
179 0.25
180 0.27
181 0.31
182 0.29
183 0.29
184 0.27
185 0.27
186 0.2
187 0.17
188 0.14
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.14
193 0.16
194 0.17
195 0.2
196 0.24
197 0.27
198 0.3
199 0.34
200 0.32
201 0.33
202 0.38
203 0.38
204 0.41
205 0.38
206 0.35
207 0.3
208 0.27
209 0.24
210 0.16
211 0.13
212 0.08
213 0.09
214 0.11
215 0.14
216 0.18
217 0.2
218 0.23
219 0.26
220 0.28
221 0.34
222 0.33
223 0.31
224 0.27
225 0.28
226 0.26
227 0.24
228 0.22
229 0.16
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.12
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.05
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.13
276 0.14
277 0.12
278 0.15
279 0.14
280 0.15
281 0.14
282 0.14
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.09
287 0.1
288 0.08
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.13
296 0.14
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.11
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.15
322 0.16
323 0.2
324 0.2
325 0.2
326 0.23
327 0.27
328 0.3
329 0.29
330 0.29
331 0.29
332 0.32
333 0.33
334 0.38
335 0.39
336 0.36
337 0.35
338 0.32
339 0.31
340 0.27
341 0.26
342 0.25
343 0.21
344 0.23
345 0.24
346 0.25
347 0.26
348 0.33
349 0.32
350 0.26
351 0.3
352 0.28
353 0.27
354 0.29
355 0.29
356 0.22
357 0.24
358 0.24
359 0.2
360 0.21
361 0.2
362 0.18
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.09
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.13
372 0.14
373 0.15
374 0.17
375 0.19
376 0.22
377 0.23
378 0.23
379 0.2
380 0.22
381 0.26
382 0.3
383 0.31
384 0.27
385 0.31
386 0.34
387 0.32
388 0.3
389 0.26
390 0.24
391 0.23
392 0.26
393 0.27
394 0.28
395 0.3
396 0.3
397 0.34
398 0.3
399 0.3
400 0.27
401 0.23
402 0.17
403 0.15
404 0.15
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.1
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.11
427 0.13
428 0.16
429 0.17
430 0.22
431 0.23
432 0.27
433 0.35
434 0.34
435 0.38
436 0.42
437 0.49
438 0.52
439 0.54
440 0.52
441 0.49
442 0.52
443 0.53
444 0.55
445 0.57
446 0.56
447 0.57
448 0.65
449 0.66
450 0.64
451 0.64
452 0.6
453 0.53
454 0.49
455 0.45
456 0.36
457 0.29
458 0.25
459 0.19
460 0.14
461 0.12
462 0.11
463 0.1
464 0.11
465 0.13
466 0.14
467 0.13
468 0.15
469 0.16
470 0.16
471 0.2
472 0.23
473 0.24
474 0.24
475 0.23
476 0.23
477 0.24
478 0.29
479 0.3
480 0.27
481 0.25
482 0.26
483 0.26
484 0.24
485 0.21
486 0.14
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.13
492 0.12
493 0.16
494 0.18
495 0.17
496 0.16
497 0.14
498 0.12
499 0.11
500 0.1
501 0.07
502 0.04
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.04
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.08
524 0.07
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.09
530 0.08
531 0.07
532 0.08
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.1
538 0.13
539 0.18
540 0.2
541 0.23
542 0.31
543 0.41
544 0.48
545 0.52
546 0.57
547 0.62
548 0.7
549 0.75
550 0.77
551 0.71
552 0.71
553 0.7
554 0.69
555 0.6
556 0.49
557 0.41
558 0.33
559 0.28
560 0.21
561 0.15
562 0.1
563 0.08
564 0.07
565 0.05
566 0.04
567 0.05
568 0.07
569 0.09
570 0.14
571 0.19
572 0.26
573 0.32
574 0.43
575 0.51
576 0.58
577 0.66
578 0.73
579 0.79
580 0.82
581 0.82
582 0.81
583 0.81
584 0.8
585 0.75
586 0.73
587 0.7
588 0.71
589 0.76
590 0.77
591 0.78
592 0.82
593 0.89
594 0.91
595 0.9