FuNGI

F2SMH2

Protein Details

Accession

F2SMH2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
193-239	DAIFRRRRQTEERRNANAKRRQEEDRQRRNNNNDHARKKRRGSRGAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
197-237	RRRRQTEERRNANAKRRQEEDRQRRNNNNDHARKKRRGSRG
664-669	GGRGRG

Subcellular Location(s)

cyto 9, nucl 8, mito 4, cysk 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N
Gene Ontology	GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N

Amino Acid Sequences

MEFIRSQRACPEYDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPHFRVLREDVFFQESKARTCKLCGQAGHVEEACTGKAKEKRGEFDEKQKGNPLKPFIWLHVSVLREYLAVEMQVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRENGIDTLIAIWRDNIPQMGGYLTKDGRVDLAKAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQTEERRNANAKRRQEEDRQRRNNNNDHARKKRRGSRGAEPVPDIPPLVVPGKGELSRAERELTHAMVVNRGAVYKANMANKSAAAALKAQLLSGGTAEDGAGATNSQDPAPSGMPSSKLGKRKSDVFENSNTEAEAEEEDEEEEDTVEVPAKPKEDEMPPDTVRLWEDGYADRYYEQKFGVNPKDIAFRHKVARAYVEGLSWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGKMDVQFTKGTPFKPFEQLMGVLPAASNHAIPEVFRDLMSDENSEIIDFYPEDFPVDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKRLLAAMDKRYHLLSEEEQARNAMGKDVLLLSEKHPLYESLTANFYSKKQVSSKLKLNMRISEGLGGKVEKNESYLPHSSLSLEVDGADIPALDEDRSISVYYEMPRSMHTHKSMLLRGVKFKEPTLDKADLEITRNKARHSGRSFGGAPLHSNRGGRGRGGGRGGGQISYASNDRPNPFAAHVAPGYIPPPHMGGGPPGYNPAPPSMYNGPDRYRSQGGYPRGGGGGGGYGGGYGGHYQQPPPHRWAQHDGPAYGNPPRNPYQDRAHYQSGGSGGYGRGGGGGGPYDGRGGGYYGSRGSGRGRGRGDGYGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.49
3	0.53
4	0.51
5	0.48
6	0.39
7	0.33
8	0.25
9	0.25
10	0.22
11	0.16
12	0.15
13	0.14
14	0.13
15	0.11
16	0.09
17	0.05
18	0.04
19	0.04
20	0.04
21	0.06
22	0.08
23	0.1
24	0.11
25	0.16
26	0.19
27	0.19
28	0.24
29	0.27
30	0.32
31	0.33
32	0.35
33	0.33
34	0.36
35	0.35
36	0.32
37	0.35
38	0.31
39	0.33
40	0.36
41	0.36
42	0.32
43	0.37
44	0.44
45	0.44
46	0.49
47	0.45
48	0.47
49	0.51
50	0.51
51	0.51
52	0.43
53	0.36
54	0.3
55	0.3
56	0.24
57	0.19
58	0.18
59	0.2
60	0.25
61	0.32
62	0.38
63	0.44
64	0.5
65	0.53
66	0.63
67	0.61
68	0.66
69	0.7
70	0.65
71	0.62
72	0.64
73	0.64
74	0.6
75	0.61
76	0.57
77	0.48
78	0.52
79	0.51
80	0.46
81	0.46
82	0.41
83	0.37
84	0.35
85	0.35
86	0.29
87	0.27
88	0.23
89	0.17
90	0.16
91	0.14
92	0.1
93	0.09
94	0.09
95	0.1
96	0.13
97	0.18
98	0.18
99	0.17
100	0.18
101	0.19
102	0.2
103	0.22
104	0.22
105	0.19
106	0.21
107	0.22
108	0.22
109	0.22
110	0.23
111	0.18
112	0.15
113	0.14
114	0.13
115	0.11
116	0.09
117	0.08
118	0.06
119	0.06
120	0.08
121	0.09
122	0.08
123	0.08
124	0.1
125	0.1
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.1
130	0.11
131	0.16
132	0.2
133	0.2
134	0.2
135	0.21
136	0.21
137	0.2
138	0.19
139	0.13
140	0.08
141	0.09
142	0.1
143	0.09
144	0.08
145	0.09
146	0.11
147	0.12
148	0.13
149	0.12
150	0.11
151	0.1
152	0.11
153	0.11
154	0.11
155	0.11
156	0.14
157	0.14
158	0.15
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.16
163	0.17
164	0.16
165	0.2
166	0.19
167	0.19
168	0.2
169	0.19
170	0.18
171	0.17
172	0.15
173	0.13
174	0.13
175	0.13
176	0.13
177	0.11
178	0.12
179	0.16
180	0.18
181	0.24
182	0.3
183	0.34
184	0.43
185	0.46
186	0.51
187	0.56
188	0.65
189	0.68
190	0.72
191	0.76
192	0.76
193	0.81
194	0.83
195	0.83
196	0.79
197	0.76
198	0.71
199	0.66
200	0.64
201	0.66
202	0.7
203	0.71
204	0.74
205	0.76
206	0.79
207	0.83
208	0.85
209	0.83
210	0.82
211	0.82
212	0.8
213	0.8
214	0.83
215	0.83
216	0.84
217	0.84
218	0.83
219	0.83
220	0.82
221	0.79
222	0.78
223	0.8
224	0.78
225	0.71
226	0.65
227	0.57
228	0.49
229	0.42
230	0.32
231	0.21
232	0.15
233	0.14
234	0.12
235	0.1
236	0.09
237	0.1
238	0.13
239	0.14
240	0.14
241	0.14
242	0.18
243	0.19
244	0.2
245	0.2
246	0.17
247	0.2
248	0.21
249	0.2
250	0.16
251	0.17
252	0.16
253	0.17
254	0.17
255	0.14
256	0.12
257	0.12
258	0.11
259	0.09
260	0.1
261	0.13
262	0.17
263	0.21
264	0.21
265	0.23
266	0.23
267	0.22
268	0.22
269	0.19
270	0.15
271	0.1
272	0.11
273	0.1
274	0.12
275	0.12
276	0.11
277	0.1
278	0.1
279	0.09
280	0.08
281	0.07
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.04
291	0.05
292	0.06
293	0.05
294	0.06
295	0.06
296	0.09
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.1
301	0.12
302	0.14
303	0.19
304	0.22
305	0.28
306	0.31
307	0.36
308	0.38
309	0.44
310	0.46
311	0.49
312	0.49
313	0.46
314	0.48
315	0.47
316	0.46
317	0.39
318	0.35
319	0.26
320	0.2
321	0.17
322	0.12
323	0.08
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.06
336	0.07
337	0.08
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.13
342	0.15
343	0.19
344	0.2
345	0.25
346	0.25
347	0.26
348	0.25
349	0.23
350	0.2
351	0.17
352	0.14
353	0.1
354	0.1
355	0.11
356	0.13
357	0.13
358	0.12
359	0.12
360	0.14
361	0.14
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.14
366	0.2
367	0.24
368	0.25
369	0.25
370	0.24
371	0.31
372	0.29
373	0.32
374	0.3
375	0.28
376	0.28
377	0.31
378	0.31
379	0.25
380	0.27
381	0.24
382	0.23
383	0.2
384	0.17
385	0.13
386	0.12
387	0.11
388	0.08
389	0.07
390	0.04
391	0.03
392	0.04
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.08
399	0.12
400	0.15
401	0.13
402	0.17
403	0.18
404	0.22
405	0.25
406	0.26
407	0.24
408	0.21
409	0.21
410	0.17
411	0.17
412	0.13
413	0.1
414	0.08
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.07
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.13
428	0.14
429	0.15
430	0.18
431	0.2
432	0.21
433	0.26
434	0.26
435	0.22
436	0.22
437	0.21
438	0.19
439	0.17
440	0.15
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.06
447	0.04
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.08
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.1
457	0.12
458	0.13
459	0.11
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.08
464	0.08
465	0.06
466	0.06
467	0.05
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.09
475	0.12
476	0.12
477	0.12
478	0.14
479	0.13
480	0.15
481	0.16
482	0.14
483	0.13
484	0.12
485	0.12
486	0.13
487	0.15
488	0.13
489	0.12
490	0.12
491	0.11
492	0.11
493	0.11
494	0.07
495	0.06
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.1
500	0.16
501	0.21
502	0.25
503	0.26
504	0.26
505	0.25
506	0.26
507	0.23
508	0.21
509	0.16
510	0.19
511	0.25
512	0.24
513	0.24
514	0.24
515	0.23
516	0.21
517	0.2
518	0.15
519	0.08
520	0.07
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.09
527	0.17
528	0.17
529	0.16
530	0.17
531	0.17
532	0.18
533	0.24
534	0.23
535	0.17
536	0.19
537	0.2
538	0.2
539	0.21
540	0.19
541	0.2
542	0.2
543	0.22
544	0.24
545	0.33
546	0.41
547	0.46
548	0.54
549	0.55
550	0.59
551	0.63
552	0.64
553	0.58
554	0.53
555	0.48
556	0.41
557	0.37
558	0.33
559	0.25
560	0.23
561	0.2
562	0.17
563	0.16
564	0.17
565	0.12
566	0.14
567	0.15
568	0.15
569	0.2
570	0.22
571	0.22
572	0.22
573	0.22
574	0.2
575	0.19
576	0.19
577	0.13
578	0.11
579	0.09
580	0.08
581	0.08
582	0.07
583	0.06
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.05
588	0.04
589	0.04
590	0.05
591	0.06
592	0.07
593	0.08
594	0.08
595	0.09
596	0.11
597	0.13
598	0.16
599	0.16
600	0.15
601	0.17
602	0.21
603	0.24
604	0.28
605	0.29
606	0.28
607	0.32
608	0.37
609	0.39
610	0.4
611	0.44
612	0.4
613	0.43
614	0.45
615	0.46
616	0.42
617	0.4
618	0.42
619	0.38
620	0.4
621	0.4
622	0.39
623	0.34
624	0.34
625	0.38
626	0.31
627	0.31
628	0.31
629	0.3
630	0.34
631	0.35
632	0.34
633	0.38
634	0.4
635	0.47
636	0.47
637	0.48
638	0.42
639	0.47
640	0.48
641	0.42
642	0.42
643	0.33
644	0.31
645	0.29
646	0.32
647	0.28
648	0.27
649	0.27
650	0.29
651	0.29
652	0.27
653	0.3
654	0.28
655	0.3
656	0.32
657	0.31
658	0.25
659	0.28
660	0.28
661	0.21
662	0.18
663	0.15
664	0.13
665	0.14
666	0.14
667	0.12
668	0.15
669	0.2
670	0.22
671	0.23
672	0.25
673	0.25
674	0.25
675	0.27
676	0.25
677	0.24
678	0.22
679	0.22
680	0.2
681	0.18
682	0.18
683	0.15
684	0.14
685	0.11
686	0.12
687	0.12
688	0.12
689	0.12
690	0.15
691	0.18
692	0.19
693	0.19
694	0.21
695	0.21
696	0.21
697	0.22
698	0.21
699	0.2
700	0.18
701	0.25
702	0.26
703	0.3
704	0.35
705	0.38
706	0.39
707	0.42
708	0.44
709	0.43
710	0.43
711	0.4
712	0.41
713	0.45
714	0.47
715	0.47
716	0.46
717	0.41
718	0.37
719	0.35
720	0.28
721	0.2
722	0.15
723	0.09
724	0.08
725	0.05
726	0.05
727	0.05
728	0.05
729	0.05
730	0.05
731	0.07
732	0.12
733	0.13
734	0.15
735	0.21
736	0.29
737	0.33
738	0.39
739	0.45
740	0.45
741	0.5
742	0.57
743	0.59
744	0.6
745	0.61
746	0.56
747	0.5
748	0.49
749	0.46
750	0.45
751	0.44
752	0.37
753	0.38
754	0.42
755	0.46
756	0.49
757	0.52
758	0.54
759	0.58
760	0.63
761	0.64
762	0.64
763	0.58
764	0.53
765	0.51
766	0.42
767	0.33
768	0.26
769	0.2
770	0.15
771	0.14
772	0.14
773	0.1
774	0.09
775	0.08
776	0.08
777	0.07
778	0.08
779	0.07
780	0.08
781	0.08
782	0.09
783	0.09
784	0.09
785	0.09
786	0.09
787	0.1
788	0.11
789	0.13
790	0.13
791	0.15
792	0.15
793	0.16
794	0.19
795	0.25
796	0.28
797	0.34
798	0.37
799	0.39
800	0.42
801	0.47

F2SMH2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer