FuNGI

P0C2N7

Protein Details

Accession

P0C2N7

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
49-77	TAGAGAVKGKKNKKEKKGKKGGKSAAAGG	Basic
152-175	DLDEIIRRRREKKKGKGLEKVEEE	Basic
737-758	GRLSNKDKKKLDSKAERSESKS	Hydrophilic
773-795	AVLNLKKVTKPKSKAPAGRKGRR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
42-72	RPNKKARTAGAGAVKGKKNKKEKKGKKGGKS
158-168	RRRREKKKGKG
713-795	KKKAKELGRAELNGVRDAMKKKGAGRLSNKDKKKLDSKAERSESKSTGWKKGRAERDGKGAVLNLKKVTKPKSKAPAGRKGRR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17947 DEADc_DDX27 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MAPSQKRKSLPDDDFIHTISDNDEPDILDEEEETVPAAVAGRPNKKARTAGAGAVKGKKNKKEKKGKKGGKSAAAGGDGEDGDEEEEEEVTGLWGANDADDGAMDSDFEFVAGGGGEDGLSGFDEEGWGFENAKKGVVGAGGAGQEVKSGVDLDEIIRRRREKKKGKGLEKVEEEEVEVEDMGEVDLDLDDEVLAEDGFGMGMEDGEGGVDEEDKGGEDDDEAASDNDSVATPVQHPDDEASEDDDEEDAEEEARRKEFFAAPEETENVGKKGGLSSFQGMSLSRPILRGLTSVGFTKPTPIQAKTIPIALMGKDVVGGAVTGSGKTAAFVVPILERLLYRPKKVPTTRVVVLTPTRELAIQCHSVATKLASHTDIKFCLAVGGLSLKVQEGELRLRPDVVIATPGRFIDHMRNSASFAVETVEILVLDEADRMLEDGFADELNEILTTLPKSRQTMLFSATMTSTVDKLIRVGLNKPARIMVDSQKQTAVTLAQEFVRLRPGREEKRMGYLGPYLQDPVHRTSHYLLQAEEDCSPDPDHLRLAGAFEHRAPWKHEPGSAFRDGKVNYLLATDLASRGLDIKGIDTVINYEAPQSLEIYVHRVGRTARAGRSGVAITLAAEPDRKVVKAAVRAGKAQGAKIISRVIDAADADKWQDQIDEMDDEIDEILQEEKEEKQLAQIEMQVKKGENLIKHEEEIHARPKRTWFETQEDKKKAKELGRAELNGVRDAMKKKGAGRLSNKDKKKLDSKAERSESKSTGWKKGRAERDGKGAVLNLKKVTKPKSKAPAGRKGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.52
3	0.45
4	0.35
5	0.3
6	0.23
7	0.21
8	0.17
9	0.15
10	0.15
11	0.14
12	0.15
13	0.18
14	0.17
15	0.14
16	0.13
17	0.15
18	0.14
19	0.14
20	0.13
21	0.09
22	0.08
23	0.08
24	0.09
25	0.08
26	0.13
27	0.21
28	0.27
29	0.34
30	0.41
31	0.46
32	0.5
33	0.54
34	0.52
35	0.53
36	0.5
37	0.5
38	0.51
39	0.53
40	0.52
41	0.55
42	0.57
43	0.57
44	0.61
45	0.64
46	0.67
47	0.71
48	0.77
49	0.81
50	0.86
51	0.89
52	0.92
53	0.93
54	0.93
55	0.93
56	0.91
57	0.88
58	0.81
59	0.74
60	0.66
61	0.57
62	0.47
63	0.36
64	0.3
65	0.21
66	0.17
67	0.13
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.08
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.05
78	0.06
79	0.05
80	0.05
81	0.06
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.05
87	0.05
88	0.06
89	0.06
90	0.05
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.05
97	0.04
98	0.05
99	0.05
100	0.04
101	0.04
102	0.04
103	0.04
104	0.04
105	0.04
106	0.04
107	0.04
108	0.04
109	0.04
110	0.04
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.07
115	0.08
116	0.09
117	0.11
118	0.16
119	0.16
120	0.17
121	0.17
122	0.15
123	0.15
124	0.14
125	0.12
126	0.07
127	0.09
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.05
136	0.05
137	0.06
138	0.06
139	0.07
140	0.08
141	0.15
142	0.19
143	0.22
144	0.28
145	0.33
146	0.41
147	0.5
148	0.6
149	0.64
150	0.71
151	0.79
152	0.84
153	0.88
154	0.89
155	0.87
156	0.85
157	0.79
158	0.72
159	0.62
160	0.52
161	0.43
162	0.34
163	0.27
164	0.18
165	0.12
166	0.08
167	0.07
168	0.06
169	0.05
170	0.04
171	0.04
172	0.03
173	0.03
174	0.04
175	0.03
176	0.03
177	0.03
178	0.03
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.09
221	0.11
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.13
226	0.13
227	0.13
228	0.14
229	0.13
230	0.13
231	0.12
232	0.11
233	0.09
234	0.08
235	0.08
236	0.05
237	0.05
238	0.07
239	0.08
240	0.1
241	0.11
242	0.11
243	0.11
244	0.14
245	0.17
246	0.19
247	0.22
248	0.24
249	0.25
250	0.26
251	0.27
252	0.25
253	0.23
254	0.22
255	0.17
256	0.14
257	0.12
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.12
263	0.14
264	0.14
265	0.14
266	0.15
267	0.13
268	0.13
269	0.14
270	0.13
271	0.11
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.11
280	0.12
281	0.12
282	0.13
283	0.12
284	0.15
285	0.14
286	0.19
287	0.22
288	0.22
289	0.24
290	0.25
291	0.29
292	0.26
293	0.27
294	0.21
295	0.18
296	0.17
297	0.14
298	0.13
299	0.09
300	0.08
301	0.06
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.03
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.04
316	0.04
317	0.05
318	0.06
319	0.05
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.08
325	0.18
326	0.19
327	0.22
328	0.27
329	0.3
330	0.39
331	0.42
332	0.47
333	0.42
334	0.46
335	0.46
336	0.43
337	0.4
338	0.34
339	0.33
340	0.28
341	0.23
342	0.17
343	0.15
344	0.13
345	0.13
346	0.12
347	0.13
348	0.13
349	0.12
350	0.13
351	0.12
352	0.12
353	0.12
354	0.11
355	0.09
356	0.09
357	0.1
358	0.11
359	0.13
360	0.14
361	0.15
362	0.15
363	0.14
364	0.13
365	0.11
366	0.1
367	0.08
368	0.07
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.06
379	0.09
380	0.12
381	0.13
382	0.13
383	0.14
384	0.13
385	0.13
386	0.12
387	0.09
388	0.1
389	0.09
390	0.09
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.14
397	0.17
398	0.19
399	0.2
400	0.2
401	0.21
402	0.22
403	0.21
404	0.13
405	0.1
406	0.09
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.05
411	0.04
412	0.05
413	0.04
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.04
435	0.05
436	0.07
437	0.09
438	0.12
439	0.14
440	0.16
441	0.19
442	0.22
443	0.23
444	0.24
445	0.24
446	0.21
447	0.2
448	0.18
449	0.15
450	0.12
451	0.11
452	0.08
453	0.07
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.1
458	0.11
459	0.12
460	0.13
461	0.21
462	0.25
463	0.26
464	0.26
465	0.25
466	0.23
467	0.23
468	0.25
469	0.23
470	0.27
471	0.28
472	0.28
473	0.28
474	0.27
475	0.26
476	0.24
477	0.18
478	0.1
479	0.09
480	0.1
481	0.09
482	0.12
483	0.12
484	0.12
485	0.19
486	0.19
487	0.18
488	0.26
489	0.34
490	0.38
491	0.44
492	0.49
493	0.42
494	0.49
495	0.49
496	0.41
497	0.34
498	0.31
499	0.26
500	0.21
501	0.2
502	0.15
503	0.14
504	0.16
505	0.17
506	0.18
507	0.2
508	0.19
509	0.21
510	0.22
511	0.27
512	0.29
513	0.27
514	0.23
515	0.23
516	0.24
517	0.24
518	0.23
519	0.18
520	0.14
521	0.15
522	0.15
523	0.13
524	0.13
525	0.12
526	0.13
527	0.11
528	0.12
529	0.1
530	0.11
531	0.13
532	0.13
533	0.13
534	0.12
535	0.16
536	0.17
537	0.2
538	0.24
539	0.27
540	0.32
541	0.33
542	0.36
543	0.35
544	0.39
545	0.43
546	0.44
547	0.4
548	0.33
549	0.37
550	0.35
551	0.34
552	0.3
553	0.24
554	0.17
555	0.16
556	0.16
557	0.1
558	0.11
559	0.09
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.06
564	0.08
565	0.08
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.09
571	0.09
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.1
576	0.09
577	0.09
578	0.1
579	0.1
580	0.1
581	0.1
582	0.09
583	0.1
584	0.1
585	0.13
586	0.15
587	0.17
588	0.17
589	0.18
590	0.18
591	0.22
592	0.29
593	0.31
594	0.3
595	0.32
596	0.33
597	0.31
598	0.33
599	0.29
600	0.21
601	0.17
602	0.15
603	0.11
604	0.11
605	0.11
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.12
610	0.14
611	0.13
612	0.13
613	0.16
614	0.21
615	0.27
616	0.35
617	0.38
618	0.39
619	0.4
620	0.4
621	0.42
622	0.38
623	0.32
624	0.28
625	0.23
626	0.22
627	0.22
628	0.23
629	0.18
630	0.17
631	0.17
632	0.13
633	0.12
634	0.12
635	0.12
636	0.1
637	0.11
638	0.11
639	0.12
640	0.12
641	0.11
642	0.11
643	0.1
644	0.11
645	0.13
646	0.12
647	0.11
648	0.11
649	0.11
650	0.11
651	0.1
652	0.08
653	0.06
654	0.05
655	0.06
656	0.05
657	0.06
658	0.07
659	0.08
660	0.12
661	0.14
662	0.13
663	0.17
664	0.23
665	0.24
666	0.24
667	0.28
668	0.32
669	0.33
670	0.35
671	0.33
672	0.27
673	0.27
674	0.31
675	0.3
676	0.27
677	0.32
678	0.37
679	0.37
680	0.38
681	0.39
682	0.37
683	0.37
684	0.38
685	0.41
686	0.41
687	0.4
688	0.42
689	0.48
690	0.53
691	0.53
692	0.57
693	0.53
694	0.55
695	0.64
696	0.71
697	0.74
698	0.74
699	0.72
700	0.66
701	0.65
702	0.64
703	0.6
704	0.58
705	0.54
706	0.56
707	0.61
708	0.6
709	0.58
710	0.54
711	0.49
712	0.42
713	0.36
714	0.28
715	0.26
716	0.27
717	0.29
718	0.3
719	0.32
720	0.34
721	0.42
722	0.47
723	0.5
724	0.57
725	0.63
726	0.69
727	0.75
728	0.78
729	0.8
730	0.78
731	0.77
732	0.77
733	0.76
734	0.76
735	0.77
736	0.8
737	0.81
738	0.84
739	0.82
740	0.78
741	0.75
742	0.67
743	0.6
744	0.6
745	0.56
746	0.58
747	0.59
748	0.61
749	0.63
750	0.7
751	0.75
752	0.75
753	0.76
754	0.7
755	0.72
756	0.68
757	0.6
758	0.53
759	0.46
760	0.44
761	0.42
762	0.42
763	0.37
764	0.38
765	0.42
766	0.48
767	0.54
768	0.57
769	0.58
770	0.64
771	0.69
772	0.75
773	0.81
774	0.82
775	0.84

P0C2N7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer